V.vinifera tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Vvinifera_tR29 GGGGGTGTAGCTCAT--A--TGGTAGAGCGCTCGCTTCGCA---------------------TGCGAGAG---------GCA----CGGGGTTCGATTCCCCGCACCTCCACCA Vvinifera_tR111 GGGGGTGTAGCTCAT--A--TGGTAGAGCGCTCGCTTCGCA---------------------TGCGAGAG---------GCA----CAGGGTTCGATTCCCTGCACCTCCACCA Vvinifera_tR15 GGGGATGTAGCTCAG--A--TGGTAGAGCGCTCGCTTAGCA---------------------TGCGAGAG---------GTA----CGGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Vvinifera_tR21 GGGGATGTAGCTCAG--A--TGGTAGAGCGCTCGCTTAGCA---------------------TGCGAGAG---------GTA----AGGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Vvinifera_tR56 GGGGATGTAGCTCAA--A--TGGTAGAGCGCTCGCTTTGCA---------------------TGCGAGAG---------GTA----CAGGGTTCGATCCCCTGCATCTCCACCA Vvinifera_tR30 GGGGATGTAGCTCAA--A--CGGTAGAGCGCTCGCTTTGCA---------------------TGCGAGAG---------GTA----CGGGGTTCGATACCCCGCATCTCCACCA Vvinifera_tR112 GGGGATGTAGCTCAC--A--TGGTAGAGCGCTCGCTTTGCA---------------------TGCGAGAG---------GTA----CGGGGTTCGATACCCCGCATCTCCACCA Vvinifera_tR16 GGGGGTGTAGCTCAA--A--TGGTAGAGCGCTCGCTTTGCA---------------------TGCGAGAG---------GCA----CGGGGTTCGATCCCCCGCACCTCCACCA Vvinifera_tR105 GGGGATGTAGCTCAA--A--TGGTAGAGCGCTCGCTTTGCA---------------------TGCGAGAG---------GCA----CGGGGTTCGATCCCCCGCATCTCCACCA Vvinifera_tR3 GGGTGTTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTCGGG---------------------TGCGAGAG---------GTC----GCGAGTTCGATTCTCGCAACACCCCCCA Vvinifera_tR66 GGGCGTTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTCGGG---------------------TGCGAGAG---------GTC----GCGAGTTCGATTCTCGCAACGCCCCCCA Vvinifera_tR34 GGGCATTTGGTCTAG-----TAGTATGATTCTTGCTTTGGG---------------------TGCAAGAG---------GTC----CCTAGTTCGATTCTTGGAATGCCCCCCA Vvinifera_tR39 GGGCATTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTTGCTTTGGG---------------------TGCAAGAG---------GTC----CCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Vvinifera_tR77 GGGCATTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTAGGG---------------------TGCGAGAG---------GTC----CCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Vvinifera_tR43 GGGCATTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTTGGG---------------------TGCGAGAG---------GTC----CCGAGTTCGATTCTCGGAATGACCCCCA Vvinifera_tR76 GGGCATTTGGTCTAG-----TGGCATGATTCTCGCTTTGGG---------------------TGCGAGAG---------GTC----CCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Vvinifera_tR139 GGGCATTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTCGGG---------------------TGCGAGAG---------GTC----CCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Vvinifera_tR109 GGGCATTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTTGGG---------------------TGCGAGAG---------GTC----CCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Vvinifera_tR32 GTGGCTGTAGTTTAG--T--GGTAAGAATTCTACGTTGTGG---------------------CCGTAGAG---------ACC-----TGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Vvinifera_tR45 GTGGCTGTAGTTTAG--T--GGTAAGAATTCCACGTTGTGG---------------------CCGTGGAG---------ACC-----TGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Vvinifera_tR78 GTGGCTGTAGTTTAG--T--GGTGAGAATTCCACGTTGTGG---------------------CCGTGGAG---------ACC-----TGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Vvinifera_tR9 GTCCCTTTCGTCCAG--T--GGTTAGGACATCGTCTTTTCA---------------------TGTCGAAG---------ACA-----CGGGTTCGATTCCCGTAAGAGATACCA Vvinifera_tR2 GCACCAGTGGTCTAG-----TGGTAGAATAGTACCCTGCCA---------------------CGGTACAG---------ACC-----CGGGTTCGATTCTCGGCTGGTGCACCA Vvinifera_tR11 GCACCAGTGGTCTAG-----TGGTAGAATAGTACCCTGCCA---------------------CGGTACAG---------ACC-----CGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCACCA Vvinifera_tR131 GCGCATCTAGTGTAG-----TGGTATCATAGTACCCTCCCA---------------------CGGTACTG---------ACC-----GGGGTTCGATTCCCCGGATGCGCACCA Vvinifera_tR136 GCGCATCTGGTGTAG-----TGGTATCATAGTACCCTCCCA---------------------CGGTACTG---------ACC-----AGGGTTCGATTCCCTGGATGCGCACCA Vvinifera_tR64 GCGTTTGTAGTCCAA--C--GGTTAGGATAATTGCCTTCCA---------------------AGCAATAG---------ACA-----CTGGTTCGACTCCCGGCAAACGCACCA Vvinifera_tR74 GCGTTTGTAGTCCAA--C--GGTTAGGATAATTGCCTTCCA---------------------AGCAATAG---------ACC-----CGGGTTCGACTCCCGGCAAACGCACCA Vvinifera_tR101 GCGTTTGTAGTCCAA--C--GGTTAGGATAATTGCCTTCCA---------------------AGCAATAG---------ACC-----CGGGTTCGACTCCCGGCAGACGCACCA Vvinifera_tR70 GTCGTTGTAGTATAG--T--GGTGAGTATACCTGCCTGTCA---------------------CGCAGGTG---------ACC-----CGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Vvinifera_tR132 GTCGTTGTAGTATAG--T--GGTGAGTATACCCGCCTGTCA---------------------CGCGGGTG---------ACC-----CGGGTTCGATCCCCGGCAGCGGCGCCA Vvinifera_tR115 GTCGTTGTAGTATAG--T--GGTGAGTATACCCGCCTGTCA---------------------CGCGGGTG---------ACC-----CGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Vvinifera_tR14 GTCGTTGTAGTATAG--T--GGTGAGTATTCCCGCCTGTCA---------------------CGCGGGTG---------ACC-----TGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Vvinifera_tR63 GTCGTTGTAGTATAG--T--GGTGAGTATTCCCGCCTGTCA---------------------CGCGGGTG---------ACC-----CGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Vvinifera_tR41 TCCGTTGTAGTCTAG-TT--GGTTAGGATACTCGGCTCTCA---------------------CCCGAGAG---------ACC-----CGGGTTCAAGTCCCGGCAACGGAACCA Vvinifera_tR118 TCCGTTGTAGTCTAG-TT--GGTTAGGATATTCGGCTCTCA---------------------CCCGAAAG---------ACC-----CGGGTTCAAGTCCCGGCAACGGAACCA Vvinifera_tR103 TCCATTGTCGTCTAG-TCCGGTTTAGGATACCTGGCTTTCA---------------------CCCAGGCG---------ACC-----CGGGTTCAAATCCCGGCAATGGAACCA Vvinifera_tR79 TCCGTTGTCGTCCAG--C--GGTTAGGATATCTGGCTTTCA---------------------CCCAGGAG---------ACC-----CGGGTTCGATTCCCGGCAACGGAACCA Vvinifera_tR85 TCCGTTGTTGTCCAG--C--GGTTAGGATATCTGGCTTTCA---------------------CCCAGGAG---------ACC-----CGGGTTCGATTCCCGGCAACGGAACCA Vvinifera_tR36 GTCGCTTTGGCCGAG--T--GGTTAAGGCGTGTGCCTGCTA---------------------AGTACATGGGGTTTCCCCGC----GAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACGCCA Vvinifera_tR88 GGGAGAGTGGCTGAG-TG--GTCAAAAGCGACAGACTGTAA---------------------ATCTGTTGAAGTTTTTCTAC----GTAGGTTCGAATCCTGCCTCTCCCACCA Vvinifera_tR68 GTGGGCGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA---------------------ATCATGTGGGCTCT---GCC-CGTGCAGGTTCGAATCCTGCCGCTCATGCCA Vvinifera_tR80 GTGGACGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA---------------------ATCATGTGGGCTCT---GCC-CGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGTCCACGCCA Vvinifera_tR42 GTGGGCGTGCCGGAG--T--GGTTATTGGGCATGACTAGAA---------------------ATCATGTGGGCTCT---GCCCGCGCAGTGTTCAAATCCTGCCGCTCACGCCA Vvinifera_tR47 GTGAGCGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA---------------------ATCATGTGGGCTCT---GCC-CGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCTCACGCCA Vvinifera_tR126 GTGGGCGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA---------------------ATCATGTGGGCTCT---GCC-CGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCCCACGCCA Vvinifera_tR23 GTGGGCGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA---------------------ATCATGTGGGCTCT---GCC-CGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCTCACGCCA Vvinifera_tR28 GTCGATATGTCCGAG--T--GGTTAAGGAGACAGACTCGAA---------------------ATCTGTTGGGCTTT---GCC-TGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTCGACGCCA Vvinifera_tR20 GTCGATATGTCCGAG--T--GGTTAAGGAGACAGACTTGAA---------------------ATCTGTTGGGCTTC---GCC-CGCGCAGGTTCGAACCCTGCTGTCGACGCCA Vvinifera_tR37 GTCGATATGTCCGAG--T--GGTTAAGGAGACAGACTTGAA---------------------ATCTGTTGGGCTTC---GCC-CGCTCAGGTTCGAACCCTGCTGTCGACGCCA Vvinifera_tR120 GCTGGTTTGCCCGAG--A--GGTTAAGGGGGAAGACTTAAG---------------------ATCTTTTGCACATAAGTGCG---CGTGGGTTCGAACCCCACAGCCAGCACCA Vvinifera_tR128 GCTGGTTTGCCCGAG--A--GGTTAAGGGGGAAGACTTAAG---------------------ATCTTCTGCACATAAGTGCG---CGTGGGTTCGAACCCCACAGCCAGCACCA Vvinifera_tR145 GTCAAGATGGCCGAG--TTGGTCTAAGGCGCCAGTTTCAGG---------------TACTGGTCCGAAAG---------GGC----ATGGGTTCGAATCCCATTCTTGACACCA Vvinifera_tR5 GTTGAGATGGCCGAGTTG--GTCTAAGGCGCCAGATTAAGG--------TTTTGGT---CC----GAAAG---------GGC----GTGGGTTCAAATCCCACTCTCAACACCA Vvinifera_tR54 GTTGAGATGGCCGAG--TTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGG---------------TTCTGGTCCGAAAG---------GGC----GTGGGTTCAAATCCCACTCTCAACACCA Vvinifera_tR113 GTGGAGATGGCCGAG--TTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGG---------------TTCTGGTCCGAAAG---------GGC----GTGGGTTCAAATCCCACTCTCCACACCA Vvinifera_tR135 GTGGAGATGGCCGAG--TTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGG---------------TTCTTGTCCGAAAG---------GGC----GTGGGTTCAAATCCCACTCTCCACACCA Vvinifera_tR119 GACAGTTTGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGATTTAGG---------------CTCTGGTCCGAAAG---------GGC----GTGGGTTCAAATCCCACAGCTGTCACCA Vvinifera_tR91 GTCAGGATGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGACTCAAG-------------TTCTGGTCTTCGAGAGAA-------GGC----GTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Vvinifera_tR7 GTCAGGATGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGACTCAAG-----------TTCTGGTCCTCGTGAGAG---------GGC----GTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Vvinifera_tR55 GTCAGGATGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGACTCAAGTTCTGGTCCTCGAGAGAG--------------------GGC----GTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Vvinifera_tR10 ATCAGAGTGGCGTAG-----CGGAAGCGTGGTGGGCCCATA---------------------ACCCACAG---------GTC----CCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATACCA Vvinifera_tR146 ATCAGAGTGGCGCAG-----CGGAAGCGTGGTGGGCCCATA---------------------ACCCACAG---------GTC----CCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATACCA Vvinifera_tR62 GCCCTTTTAACTCAG-----TGGTAGAGTAACGCCATGGTA---------------------AGGCGTAA---------GTC----ATCGGTTCAAATCCGATAAAGGGCTCCA Vvinifera_tR98 GCCCACTTAGCTCAG--A--GTTTAGAGCATCGCATTTGTA---------------------ATGCGATG---------GTC----ATCGGTTCGATTCCGATAGCTGGCTCCA Vvinifera_tR8 GGTCCCATGGTCTAG--T--GGTCAGGACATTGGACTCTGA---------------------ATCCAGTA---------ACC-----CGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCTCCA Vvinifera_tR137 GGTCCCATGGTCTAG--T--GGTAAGGACATTGGACTCTGA---------------------ATCCAGTA---------ACC-----CGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCTCCA Vvinifera_tR116 GGTTCCATGGTCTAG--T--GGTGAGGACATTGGACTCTGA---------------------ATCCAGTA---------ACC-----CGAGTTCAAATCTCGGTGGAACCTCCA Vvinifera_tR147 GGTTCCATGGTCTAG--T--GGTCAGGACATTGGACTCTGA---------------------ATCCAGTA---------ACC-----CGAGTTCAAGTCTCGGTGGAACCTCCA Vvinifera_tR97 GGTTCCATGGTCTAG--T--GGTCAGGACATTGGACTCTGA---------------------ATCCAGTA---------ACC-----CGAGTTCAAATCTCGGTGGAACCTCCA Vvinifera_tR143 GGTTCCATGGTGTAG--T--GGTTAGCACTCTGGACTTTGA---------------------ATCCAGCG---------GCC-----TTGGTTCGACTCCCGGTGGGATCTCCA Vvinifera_tR24 GGTTCTATGGTGTAG--T--GGTTAGCACTCTGGACTTTGA---------------------ATCCAGCG---------ACC-----TGGGTTCGACTCCCGGTAGGACCTCCA Vvinifera_tR1 GGTTCCATGGTGTAG--T--GGTTAGCACTCTGGACTTTGA---------------------ATCCAGCG---------ACT-----TGGGTTCGACTCCCGGTGGGACCTCCA Vvinifera_tR19 GTCTAGGTGGTATAG-TT--GGTTATCACGCTAGTCTCACA---------------------CACTAGAG---------GTC----CCTAGTTCGAACCCAGGCTCAGATACCA Vvinifera_tR35 GTCTGGGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGCTAGTGTCACA---------------------CACTGGAG---------GTC----CCTGGTTTGAATCTGGGCTCAGACACCA Vvinifera_tR124 GTCTGGGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGCTAGTCTCACA---------------------CACTAGAG---------GTC----CCCGGTTCGAACCCGGGCTCAGACACCA Vvinifera_tR17 GTTGCTGTGGTGTAG--T--GGTTATCACGTTAGTCTTACA---------------------CACTAAAG---------GTC----CCCAGTTCGATCCTGGGCAGCAACACCA Vvinifera_tR33 GATGTTGTGGTGTAG--T--GGTTATCACGTTAGTCTTACA---------------------CACTAAAG---------GTC----CCCAGTTCGATCCTGGGCAGCATCACCA Vvinifera_tR40 GATGCTGTGGTGTAG--T--GGTTATCACGTTAGTCTTACA---------------------CACTAAAG---------GTC----CCCAGTTCGATCCTGGGCAGCATCACCA Vvinifera_tR141 GGTGTCGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTCAGTCTAACA---------------------CACTGAAG---------GTC----TCCGGTTCGAACCCGGGCGACGCCACCA Vvinifera_tR57 GGTGTCGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTCAGTCTAACA---------------------CACTGAAG---------GTC----TCCGGTTCAAGTCCGGGCGACGCCACCA Vvinifera_tR123 GGTGTCGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTCAGCCTAACA---------------------CACTGAAG---------GTC----TCCGGTTCAAGTCCGGGCGACGCCACCA Vvinifera_tR67 GGGTCCATAGCTTAG-----TGGTAAAGCATTTGACTGTAG---------------------ATCAAGAG---------GTC----ATCGGTTTGATCCCGGTTGGGCCCTCCA Vvinifera_tR90 GGGTCCTTAGCTCAG-----TGGTAGAGCATTTGACTGCAG---------------------ATCAAGAG---------GTC----ACCGGTTCGAACCCGGTAGGGCCCTCCA Vvinifera_tR89 GGGTCCATAGCTCAG-----TGGTAGAGCATTTGACTGCAG---------------------ATCAAGAG---------GTC----ACCGGTTCGATCCCGGTTGGGCCCTCCA Vvinifera_tR104 GGGTCCATAGCTCAG-----TGGTAGAGCATTTGACTGCAG---------------------ATCAAGAG---------GTC----ACCGGTTCGAACCCGGTTGGGCCCTCCA Vvinifera_tR46 CCGGCTTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG-----------TATGGCTGTGATCCTTAG---------GTC----GCTGGTTCGAATCCGGCAAGCCGGACCA Vvinifera_tR49 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG--TGGGTTTAACCTTATAGTAATCCTTAG---------GTC----ACTGGTTCGAATCCGGTAGGTCGGACCA Vvinifera_tR75 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG---TGGGTCAACCTGTTAGTCATCCTTAG---------GTC----ACTGGTTCGAATCCGGTAGGTCGGACCA Vvinifera_tR58 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG---------TGTGCAACAGCTATCCTTAG---------GTC----GCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Vvinifera_tR52 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG-TGGGATTGTCCCGATTAGATATCCTTAG---------GTC----GCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Vvinifera_tR71 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG------TGGGATTCCCCAGATATCCTTAG---------GTC----GCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Vvinifera_tR44 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG-TGGGTGTAGATCCAACGGTAATCCTTAG---------GTC----GCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Vvinifera_tR87 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG---------TAAGGCAGATTAATCCTTAG---------GTC----GCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Vvinifera_tR26 GCGGGGATAGCTCAG--T--TGGGAGAGCGTCAGACTGAAG---------------------ATCTGAAG---------GTC----GCGTGTTCGATCCACGCTCACCGCACCA Vvinifera_tR82 GCGGGGATAGCTCAG--T--TGGGAGAGCGTCAGACTGAAG---------------------ATCTGAAG---------GTC----GCGTGTTCGATCCGCGCTCACCGCACCA Vvinifera_tR6 GCTTTCGTAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCACCCGTTTAGTA---------------------AGCGGGAG---------GTC----TTGAGTTCAACTCTCAACGAAAGCACCA Vvinifera_tR133 GCTTTCATAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCACCCGTTTAGTA---------------------AGCGGGAG---------GTC----TTGAGTTCAACTCTCAATGAACGCACCA Vvinifera_tR138 GCTTTCATAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCACCCGTTTAGTA---------------------AGCGGGAG---------GTC----TTGAGTTCGACTCTCAATGAAAGCACCA Vvinifera_tR130 GCTTTCATAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCACCCGTTTAGTA---------------------AGCGGGAG---------GTC----TTGAGTTCAACTCTCAATGAAAGCACCA Vvinifera_tR142 GCCTCTATAGCTCAG-----TGGTAGAGCGTCAGTCTTGTA---------------------AACTGAAG---------GTC----TGTAGTTCGATCCTGCATGGAGGCACCA Vvinifera_tR81 GCCCCTATAGCTCAG-----TGGTAGAGCGTCAGTCTTGTA---------------------AACTGAAG---------GTC----CGTAGTTCGATCCTGCGTGGGGGCACCA Vvinifera_tR127 GCCCCTATAGCTCAG-----TGGTAGAGCGTCAGTCTTGTA---------------------AACTGAAG---------GTC----TGTAGTTCGATCCTGCATGGGGGCACCA Vvinifera_tR73 GGGGTGGTGGCGCAG-TT--GGCTAGCGCGTAGGTCTCATA-----------GCTTCGAGTTATCCTGAG---------GTC----GAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Vvinifera_tR25 GGGGTGGTGGCGCAG-TT--GGCTAGCGCGTAGGTCTCATA----------GCTTCCGAGTAATCCTGAG---------GTC----GAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Vvinifera_tR108 GGGGTGGTGGCGCAG-TT--GGCTAGCGCGTAGGTCTCATA-----------GCTTCGAGTAATCCTGAG---------GTC----GAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Vvinifera_tR134 GGGGTGGTGGCGCAG-TT--GGCTAGCGCGTAGGTCTCATA-----------GCTAAGAGTAATCCTGAG---------GTC----GAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Vvinifera_tR50 GGGGTGGTGGCGCAG-TT--GGCTAGCGCGTAGGTCTCATA------GCTATTGGTTGAGTAATCCTGAG---------GTC----GAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Vvinifera_tR94 GGGGTGGTGGCGCAG-TT--GGCTAGCGCGTAGGTCTCATA------GCTATTGGTTGAGTTATCCTGAG---------GTC----GAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Vvinifera_tR12 GGGGTGGTGGCGCAG-TT--GGCTAGCGCGTAGGTCTCATA---------GCTATTTGAGTGATCCTGAG---------GTC----GAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Vvinifera_tR114 GGGGTGGTGGCGCAG-TT--GGCTAGCGCGTAGGTCTCATA------GCTATTATTTGAGTTATCCTGAG---------GTC----GAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Vvinifera_tR102 GCTTCCGTAGCATAG-----TGGTAGTGCGTTCGCTTCGTA---------------------AGCGAAAG---------GTC----GCGAGTTCGATCCTCGCCGGGAGCTCCA Vvinifera_tR129 GCTTCCATAGCATAG-----TGGTAGTGCGTTCGCTTCGTA---------------------AGCGAAAG---------GTC----GCGAGTTCGATCCTCGCTGGGAGCTCCA Vvinifera_tR95 GGTCTCGTAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCGTTGGTCTTATG---------------------AGCCGAAG---------GTC----GCGGGTTCGAGCCCCGCCAAGACCACCA Vvinifera_tR96 GGTCCCGTAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCGTTGGTCTTATG---------------------AGCCGAAG---------GTC----GCGGGTTCGAGCCCCGCCGGGACCACCA Vvinifera_tR13 GGCCTATTAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCATCATGCTAACA---------------------ACACGAAG---------GTG----GCAGGTTTGAGACCTGCATGGGCCACCA Vvinifera_tR31 GGCCTATTAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCGTCGTGCTAATA---------------------ACGCGAAG---------GTC----ACAGGTTCGAGACCTGTATGGGCCACCA Vvinifera_tR22 GGCCTATTAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCGTCGTGCTAATA---------------------ACGCGAAG---------GTC----GCAGGTTCGAGACCTGCATGGGCCACCA Vvinifera_tR86 GGCCTATTAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCGTCGTGCTAATA---------------------ACGCGAAG---------GTC----GCAGGTTCGAGACCTGCATAGGCCACCA Vvinifera_tR107 GGATCCGTGGCGCAA-----TGGTAGCGCGTCTGACTCCAG---------------------ATCAGAAG---------GTT----GCGTGTTCGATTCACGTCGGGTTCACCA Vvinifera_tR106 GATCGCATAGCGGAG--T--GGATATCGCGTTAGACTCCGA---------------------ATCTAAAG---------GTC----GTGGGTTCGAATCCCACTGCGATCGCCA Vvinifera_tR48 GACCGCATAGCGCAG-TG--GATTAGCGCGTTTGACTTCGG---------------------ATCAAAAG---------GTC----GTGGGTTCGACTCCCACTGTGGTCGCCA Vvinifera_tR144 GACCGCATAGCGCAG-TG--GATTAGCGCGTCTGACTTCGG---------------------ATCAGAAG---------GTC----GTGGGTTCGACTCCCACTGTGGTCGCCA Vvinifera_tR65 GACTCCATGGCCCAA--T--GGATAAGGCGCTGGTCTACGG---------------------AACCAGAG---------ATT----CTGGGTTCGATCCCCAGTGGAGTCGCCA Vvinifera_tR72 GACTCTGTGGCCCAA--T--GGATAAGGCGCTGGTCTACGG---------------------AACCAGAG---------ATT----CTGGGTTCGATCCCCAGCAGAGTCGCCA Vvinifera_tR121 GACTCCGTGGCCCAA--T--GGATAAGGCGCTGGTCTACGG---------------------AACCAGAG---------ATT----CTGGGTTCGATCCCCAGCGGAGTCGCCA Vvinifera_tR53 GCGCTCGTGGCCTAA--T--GGATAAGGCGTCTGACTTCTA---------------------ATCAGGCG---------ACT----GTGGGTTCGAGTCCCACCGGGCGTGCCA Vvinifera_tR38 GCGCCCGTGGCCTAA--T--GGACAAGGCGTCTGACTTCTA---------------------ATCAGGCG---------ATT----GTGGGTTCGAGTCCCACCGGGCGTGCCA Vvinifera_tR93 GCGCCCGTGGCCTAA--T--GGATAAGGCGTCTGACTTCTA---------------------ATCAGGCG---------ATT----GTGGGTTCGAGTCCCACCGGGCGTGCCA Vvinifera_tR4 GTTCGCGTGGCCTAA--T--GGATAAGGCGCTCGCCTCCGG---------------------AGCGGGAG---------ATT----GTGGGTTCGAGTCCCATCGTGAACGCCA Vvinifera_tR83 GATCGCGTGGCCTAA--T--GGATAAGGCGCTCGCCTCCGG---------------------AGCGGGAG---------ATT----GTGGGTTCGAGTCCCATCGCGATCGCCA Vvinifera_tR84 GATCGCGTGGCCTAA--T--GGATAAGGCGCTCGCCTCCGG---------------------AGCGGGAG---------ATT----GTGGGTTCGAGTCCCACCGTGATCGCCA Vvinifera_tR69 GGGCCTGTAGCTCAG---AGGATTAGAGCACGTGGCTACGA---------------------ACCACGGT---------GTC----GGGGGTTCGAATCCCTCCTCGCCCACCA Vvinifera_tR60 GCGCCTGTAGCTCAG--T--GGATAGAGCGTCTGTTTCCTA---------------------AGCAGAAA---------GTC----GTAGGTTCGACCCCTACCTGGCGCGCCA Vvinifera_tR117 GCGCCTGTAGCTCAG--T--GGATAGAGCGTCTGTTTCCTA---------------------AGCAGAAG---------GTC----ATAGGTTCGACCCCTATCTGGCGCGCCA Vvinifera_tR51 GCTGGAGTAGCTCAG-TT--GGCTAGAGCGTGTGGCTGTTA---------------------ACCACAAG---------GTC----AGAGGTTCAAGCCCTCTCTCTAGCGCCA Vvinifera_tR61 GCTGGAATAGCTCAG-TT--GGCTAGAGCGTGTGGCTGTTA---------------------ACCACAAG---------GTC----AGAGGTTCAAGCCCTCTTTCTAGCGCCA Vvinifera_tR140 GCTGGAATAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCGTGTGGCTGTTA---------------------ACCACAAG---------GTC----GGAGGTTCAAGCCCTCCTTCTAGCGCCA Vvinifera_tR125 GCTGGAGTAGCTCAG-TT--GGTTAGAGCGTGTGGCTGTTA---------------------ACCACAAG---------GTC----GAAGGTTCAAGCCCTTCCTCTAGCGCCA Vvinifera_tR59 GCTGGAATAGCTCAG-TT--GGCTAGAGCGTGTGGCTGTTA---------------------ACCACAAG---------GTC----GAAGGTTCAAGCCCTTCTTCTAGCGCCA Vvinifera_tR18 TCCTCAGTAGCTCAG-----TGGTAGAGCGGTCGGCTGTTA---------------------ACTGACTG---------GTC----GTAGGTTCGAATCCTACTTGGGGAGCCA Vvinifera_tR122 TCCTTAGTAGCTCAG-----TGGTAGAGCGGTCAGTTGTTA---------------------ACTTACCG---------GTT----GTAGGTTCGAATCCTACTTAGGGAGCCA Vvinifera_tR99 GCCCGTCTAGCTCAG--C--CGGTAGAGCGCAAGGCTCTTA---------------------ACCTTGTG---------GTC----GTGGGTTCGAGCCCCACGGTGGGCGCCA Vvinifera_tR100 GCCCGTCTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGCAAGGCTCTTA---------------------ACCTTGTG---------GTC----GTGGGTTCGAGCCCCACGGTGGGCGCCA Vvinifera_tR110 GCCCGTCTAGCTCAG--T--CGGTAGAGCGCAAGGCTCTTA---------------------ACCTTGTG---------GTC----GTGGGTTCGAGCCCCACGGTGGGCGCCA Vvinifera_tR92 GCCGTCTTAGCTCAG--C--CGGTAGAGCGCATGGCTTTTA---------------------ACCATGTG---------GTC----GTGGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Vvinifera_tR27 GCCGTCTTAGCTCAG--C--CGGTAGAGCGCGTGGCTTTTA---------------------ACCACGTG---------GTC----GTGGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Vvinifera_tR148 GCCGTCTTAGCTCAG--C--CGGTAGAGCGCGTGGCTTTTA---------------------ACCACGTG---------GTC----GTGGGTTCGATTCCCACGGACGGCGCCA
X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y