V.carteri tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Vcarteri_tR40 AGCGAGATGGCGCAGCGGA--AGCGTGCGG---G----GCTC----------------------AT----------------------------------------------------------A--ACCC------C------------------------GAGG-T----------CCCTGGATTGAAACCAGGTCTCGCTACCA Vcarteri_tR3 ATCGAGATGGCGCAGCGGA--AGCGTGCGG---G----ACTC----------------------AA----------------------------------------------------------A--ACCC------C------------------------GAGG-T----------CCCAGGATCGAAACCTGGTCTCGATACCA Vcarteri_tR51 CTCGAGATGGCGCAGCGGA--AGCGTGCGG---G----GCTC----------------------AT----------------------------------------------------------A--ACCC------C------------------------GAGG-T----------CCCAGGATCGAAACCTGGTCTCGATACCA Vcarteri_tR33 ATCGAGATGGCGCAGCGGA--AGCGTGCGG---G----GCTC----------------------AT----------------------------------------------------------A--ACCC------T------------------------GAGG-T----------CCCAGGATCGAAACCTGGTCTCGATACCA Vcarteri_tR35 ATCGAGATGGCGCAGCGGA--AGCGTGCGG---G----GCTC----------------------AT----------------------------------------------------------A--ACCC------C------------------------CAGG-T----------CCCAGGATCGAAACCTGGTCTCGATACCA Vcarteri_tR273 ATCGAGATGGCGCAGCGGA--AGCGTGCGG---G----GCTC----------------------AT----------------------------------------------------------A--ACCC------C------------------------GAGG-T----------CCCAGGATCGAAACCTGGTCTCGATACCA Vcarteri_tR152 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----CTTT----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-C----------CGTGGGTTCGATTCCCACAACAACCCCCA Vcarteri_tR63 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----CTTT----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-C----------CGCGGGTTCGATTCCCGCAACTCCCCCCA Vcarteri_tR90 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----CTTT----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-C----------CGTGGGTTCGATTCCCACAACTCCCCCCA Vcarteri_tR280 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----ATTT----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-C----------CGTGGGTTCGATTCCCACAACTCCCCCCA Vcarteri_tR234 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTTTC---G----CTTA----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGA-C----------CGTGGGTTCAATTCCCGCAACTCCCCCCA Vcarteri_tR20 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----CTTA----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-T----------TGTGGGTTCAATTCCCGCAACTCCCCCCA Vcarteri_tR194 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----CTTA----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-T----------CGTGGGTTCAATTCCCACAACTCCCCCCA Vcarteri_tR211 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----CTTA----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-T----------CGAGGGTTCAATTCCCGCAACTCCCCCCA Vcarteri_tR225 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---A----CTTA----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-T----------CGTGGGTTCAATTCCCGCAACTCCCCCCA Vcarteri_tR155 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----CTTA----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-T----------CGTGGGTTCAATTCCCGCAACTCCCCCCA Vcarteri_tR184 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----CTTT----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-T----------CGTGGGTTCGATTCCCGCAGCTCCCCCCA Vcarteri_tR66 GGGAGTTTGGTCTAGTGC--TATGATTCTC---G----CTTC----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-T----------CGTGGGTTCGATTCCCGCAACTCCCCCCA Vcarteri_tR130 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--CATGATTCTC---G----CTTC----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-T----------CGTGGGTTCGATTCCCGCAACTCCCCCCA Vcarteri_tR93 GGGAGTTTGGTCTAGTGG--TATGATTCTC---G----CTTC----------------------GG----------------------------------------------------------G--TGCG------A------------------------GAGG-T----------CGTGGGTTCGATTCCCGCAACTCCCCCCA Vcarteri_tR94 GCACCTGTGGCCGAGTGGT-TAAGGCGCCGCCCT----GCTA----------------------AG----------------------G---------------------------------------CGG------T------------------------GGGG-T---TTCCCCGCGTGCATTCGAATCGCATCGGGTGCGCCA Vcarteri_tR249 GCACCTGTGGCCGAGTGGT-TAAGGCGCCGCCCT----GCTA----------------------AG----------------------G---------------------------------------CGG------T------------------------GGGG-T---TTCCCCGCATGCATTCGAATCGCATCGTGTGCGCCA Vcarteri_tR196 GCACCTGTGGCCGAGTGGT-TAAGGCGCCG---C----CCTG----------------------CT----------------------AA----------------------------------G--GCGG------T------------------------GGGG-T---TTCCCCGCGTGCATTCGAATCGCATCGTGTGCGCCA Vcarteri_tR159 GCACCTGTGGCCGAGTGGT-TAAGGCGCCGCCCT----GCTA----------------------AG----------------------G---------------------------------------CGG------T------------------------GGGG-T---CTCCCCGCGTGCGTTCAAATCGCATCGGGTGCGCCA Vcarteri_tR147 GCACCTGTGGCCGAGTGGT-TAAGGCGCCG---C----CCTG----------------------CT----------------------AA----------------------------------G--GCGG------T------------------------GGGG-T---CTCCCCGCGTGCGTTCGAATCGCATCGGGTGCGCCA Vcarteri_tR141 GCACCTGTGGCCGAGTGGT-TAAGGCGCCGCCCT----GCTA----------------------------------------------------------------------------------A-GGCGG------T------------------------GGGA-T----TTCCCGCGTGCGTTCGAATCGCATCGGGTGCGCCA Vcarteri_tR171 GCACCTGTGGCCGAGTGGT-TAAGGCGCCGCCCT----GCTA----------------------AG----------------------------------------------------------G---CGG------T------------------------GAGG-T---TTCCCCGCGTGCGTTCGAATCGCATCGGGTGCGCCA Vcarteri_tR39 GCACCTGTGGCCGAGTGGT-TAAGGCGCCG---C----CCTG----------------------CT----------------------------------------------------------AAGGCGG------T------------------------GGGG-T---TTCCCCGCGTGCGTTCGAATCGCATCGGGTGCGCCA Vcarteri_tR252 GCTGTCTTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGGTG---G----ACTT----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCCA------C------------------------TGGG-G---ATCCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGTAGACAGCGCCA Vcarteri_tR261 GCTGTCTTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGGTG---G----ACTT----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCCA------C------------------------TGGG-T---TCTCCCGCGCAAGTTCGAATCTTGTAGACAGCGCCA Vcarteri_tR157 GCTGTCTTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGGTG---G----ACTT----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCCA------C------------------------TGGG-T---TCTCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGTAGACAGCGCCA Vcarteri_tR195 GCGGTTGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTT----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-T---TAGCCCGCGCAGGTTCAAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR193 GTGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ATTC----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR61 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTA----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-C---TCGCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR203 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTT----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR28 GCGGTCGTGCCCGAGTTGT-TAAGGGGTCT---G----ACTA----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR163 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-GAAGGGGTCT---G----ACTA----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR219 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTA----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-G---TCTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR227 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGAGGTCT---G----ACTA----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR64 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTA----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR14 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTC----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TTTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR34 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTC----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGCATAGGTTTGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR142 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTC----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGCACAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR209 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTC----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGGATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR275 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTC----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------T------------------------TGGG-A---TCTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR60 GCGGTCGTGCCCGAGTGGT-TAAGGGGTCT---G----ACTC----------------------GA----------------------A-----------------------------------A--TCAG------A------------------------TGGG-A---TCTCCCGCATAGGTTCGAATCCTGTCGACCGCGCCA Vcarteri_tR144 GGTACGGTGGCCGAGTGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTT----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCCG------A------------------------AAGG-G----------CGCAGGTTCGAACCCTGCCTGTATCACCA Vcarteri_tR133 GGTACGGTGGCCGAGCGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTT----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCCG------A------------------------AAGG-G----------CACAGGTTCAAATCCTGTCCGTATCACCA Vcarteri_tR253 GGTACGGTGGCCGAGCGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTT----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCCG------A------------------------AAGG-G----------CACAGGTTCTAATCCTGTCCGTATCACCA Vcarteri_tR15 GGTACGGTGGCCGAGTGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTA----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCCA------C------------------------AAGG-G----------TGCAGGTTCAAATCCTACCCGTATCACCA Vcarteri_tR87 GGTACGGTGGCCGAGTGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTT----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCCG------T------------------------AAGG-G----------CGCAGGTTCAAATCCTGTCCGTATCACCA Vcarteri_tR105 GGTACGGTGGCCGAGTGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTA----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCTG------C------------------------AAGG-G----------CGCAGGTTCAAGTCCTGCCCGTATCACCA Vcarteri_tR77 GGTACGGTGGCCGAGTGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTA----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCCG------C------------------------AAGG-G----------CGCAGGTTCAAGTCCTGCCCGTATCACCA Vcarteri_tR263 GGTACGGTGGCCGAGTGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTA----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCCG------T------------------------AAGG-G----------CGCAGGTTCAAATCCTGCCCGTATCACCA Vcarteri_tR122 GGTACGGTGGCCGAGTGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTA----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCCG------A------------------------AAGG-G----------CGCAGGTTCAAATCCTGCCCGTATCACCA Vcarteri_tR118 GGTACGGTGGCCGAGTGGTCTAAGGCGTAG---G----ATTA----------------AGGCTCCT----------------------------------------------------------A--TCCG------C------------------------AAGG-G----------CGCAGGTTCAAATCCTGCCCGTATCACCA Vcarteri_tR212 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CCGATCTTAGCTCAGCTGG-AAGAGCGAAG---G----ACTG--------TAATC-------------------------------------------------------------------------------------GTAACGCTTAAATTGCGATCCTTAGG-T----------CGCCTGTTCGATCCAGGCAGATCGGACCA Vcarteri_tR99 GTCCCGTTGGCGTAGTGGA-TAACGCACTG---G----ACTT-------------------------------------------------------CTATTACTA--------------AGACA--TCCA------G-------------------------GGA-T----------CATGGGTTCGAATCCCATACGGGACGCCA Vcarteri_tR16 GCCGTTGTAGCTCAGTGG--TAGAGCGTTT---G----TCTT----------------------GT----------------------------------------------------------A--AACA------A------------------------AAGG-T----------CCCTGGTTCGAACCCGGGCTGCGGCACCA Vcarteri_tR47 GCCGTTGTAGCTCAGTGG--TAGAGCGTTT---G----TCTT----------------------GT----------------------------------------------------------A--AACA------A------------------------AAGG-G----------CCCTGGTTCAATCCCAGGCTGCGGCACCA Vcarteri_tR86 GCCGTTGTAGCTCAGTGA--TAGAGCGTTT---G----TCTT----------------------GT----------------------------------------------------------A--AACA------A------------------------AAGG-T----------CCCTGGTTCAATCCCAGGCTGCGGCACCA Vcarteri_tR221 GCCGTTGTAGCTCAGTGG--TAGAGCGTTT---G----TCTT----------------------GT----------------------------------------------------------A--AACA------A------------------------AAGG-T----------CTCTGGTTCAATCCCAGGCTGCGGCACCA Vcarteri_tR125 GCCGTTGTAGCTCAGTGG--TAGAGCGTTT---G----TCTT----------------------GT----------------------------------------------------------A--AACA------A------------------------AAGG-T----------CCCTGGTTCAATCCCAGGCTGCGGCACCA Vcarteri_tR284 GCCGTTGTAGCTCAGTGG--TAGAGCGTTT---G----TCTT----------------------GT-----------AAACAAAAGGTA-----------------------------------A--ACAA------A-------------------------AGG-T----------CCCTGGTTCAATCCCAGGCTGCGGCACCA Vcarteri_tR1 GTCTCTATAGCTTAGTGG--TAGAGCGTTC---C----CTTC----------------------GT----------------------------------------------------------A--TCAGAGGATCA--------------------GGGAAAGG-T----------CCTGAGTTCAATCCTCAGTGGGGGCACCA Vcarteri_tR164 GCCTCTATAGCTTAGTGG--TAGAGCGTTC---C----CTTC-------------------------------------------------------GTATTCATG--------------TGCTA--GGGA------A-------------------------AGG-T----------CCTGAGTTCAATCCTCAGTGGGGGCACCA Vcarteri_tR217 GCCTATATAGCTTAGTGG--TAGAGCGTTC---C----CTTC----------------------GT----------------------------------------------------------A--AGGG------A------------------------AAGG-T----------CTTGAGTTCAATCCTCAATGTGGGCACCA Vcarteri_tR232 GCCTATATAGCTTAGTGG--TAGAGCATTC---C----CTTC----------------------GT----------------------------------------------------------A--AGGG------A------------------------AAGG-T----------CTTGAGTTCAATCCTCAATGTGGGCACCA Vcarteri_tR129 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X: m1G
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