S.tuberosum tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Stuberosum_tR139 AGCGGGGTAGAGGAATTGGT-CAACTCATCAGGCTCAT-------------------------GAC------------CTGAAGAT---------TGCAGGTTCGAATCCTGT--CCCCGCCTCCA Stuberosum_tR76 GTGGCTGTAGTTTAGTGGT--AAGAATTCCACGTTGTG--------------------------GC------------CGTGGAGA---------CCTGGGCTCGAATCCCAG--CAGCCACACCA Stuberosum_tR118 GTGGCTGTAGTTTAGTGGT--GAGAATTCCACGTTGTG--------------------------GC------------CGTGGAGA---------CCTGGGCTCGAATCCCAG--CAGCCACACCA Stuberosum_tR1 GTCCCTTTCGTCTAGTGGT--TAGGACATTGTCTTTTC--------------------------AT------------GTCGAAGA---------CACGGGTTCGATTCCCGT--AAGGGATACCA Stuberosum_tR208 GTCCCTTTCGTCCAGTGGT--TAGGACATCGTCTTTTC-------------------------ATG------------TCGAAGA----------CACGGGTTCGATTCCCGT--AAGGGATACCA Stuberosum_tR141 GCGCATCTGGTGTAGTGGTATCATAGTACCCTCCCACG-------------------------GTA------------CTGA-------------CCGGGGTTCGATTCCCCG--GATGCGCACCA Stuberosum_tR5 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATACTACACTGCC--------------------------AC------------GGTACAGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGG--CTGGTGCACCA Stuberosum_tR22 GCACCAGTAGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTGCC--------------------------AC------------GGTACAGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGG--CTGGTGCACCA Stuberosum_tR77 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTGCC--------------------------AC------------GGTACAGA---------CCCGGGTTTGATTCCCGG--CTGGTGCACCA Stuberosum_tR82 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTGCC--------------------------AC------------GGTACAGA---------CCCGGGTTCAATTCCCGG--CTGGTGCACCA Stuberosum_tR163 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTGCC--------------------------AC------------TGTACAGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGG--CTGGTGCACCA Stuberosum_tR174 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTGCC--------------------------AC------------GGTACAGA---------CCCGGGTTCGATTCCAGG--CTGGTGCACCA Stuberosum_tR183 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTGCC--------------------------AC------------GGTACAGA---------CCCGGGTTCGATTCCCAG--CTGGTGCACCA Stuberosum_tR23 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTGCC--------------------------AC------------GGTACAGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGG--CTGGTGCACCA Stuberosum_tR157 GCGTTTGTAGTCCAACGGT--TAGGATAATTGCCTTCC-------------------------AAG------------CAATAGA----------CCCGGGTTCGACTCCCGG--CAGACGCACCA Stuberosum_tR191 GTCGTTGTAGTATAGTGGT--AAGTATTCCCGCCTGTC-------------------------ACG------------CGGGTGA----------CCCGGGTTCGATCCCCGG--CAACGGCGCCA Stuberosum_tR206 TTCGTTGTAGTATAGTGGT--AAGTATTCCCGCCTGTC-------------------------ACG------------CGGGTGA----------CCCGGGTTCGATCCCCGG--CAACGGCGCCA Stuberosum_tR184 GTCGTTGTAGTATAGTGGT--AAGTATTCCCGCCTGTC-------------------------ACG------------CGGGTGA----------CCCGGGTTCGATCCCCGG--CAGCGGTGCCA Stuberosum_tR94 GTCGTTGTAGTATAGTGGT--AAGTATTCCCGCCTGTC-------------------------ACG------------CGGGTGA----------CCCGGGTTCGATCCCCGG--CAGCGGCGCCA Stuberosum_tR91 GTCGTTGTAGTATAGTGGT--GAGTATTCCGGCCTGTC-------------------------ACG------------CGGGTGA----------CCCGGGTTCGATCCCCGG--CAGCGGCGCCA Stuberosum_tR125 GTCGTTGTAGTATAGTGGT--GAGTATTCCCGCCTGTC-------------------------ACG------------CGGGTGA----------CCCGGGTTCGATCCCGGG--CAGCGGCGCCA Stuberosum_tR210 GTCGTTGTAGTATAGTGGT--GAGTATTCCCGCCTGTC-------------------------ACG------------CGGGTGA----------CCCGGGTTCGATCCCCGG--CAGCGGCGCCA Stuberosum_tR232 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------AC------------CCGAGAGA---------CCCGGGTTCAAGTCCCAG--CAACGGTGCCA Stuberosum_tR173 TCCGTTGTAGTCTAGTCGGT-TAGGATACTCGGTTCTC--------------------------AC------------CCGAGAGA---------CCCGGGTTCAATTCCCGG--CAACGGAACCA Stuberosum_tR101 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------AC------------CCGAGAGA---------CCCGTGTTCAAGTCCCGG--CAACGGAACCA Stuberosum_tR116 TCCGTTGTAGTCTAGTTTGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------AC------------CCGAGAGA---------CCCGGGTTCAAGTCCCGG--CAACGGAACCA Stuberosum_tR72 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------AC------------CCGAGAGA---------CCCGGGTTCAAGTCCCGG--CAACGGAACCA Stuberosum_tR20 TCCGTTATCGTCCAGCGGT--TAGGATATCTGGCTTTC--------------------------AC------------CCAGGAGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGA--TAACGGAACCA Stuberosum_tR73 TCCGTTATCGTCCAGCGGT--TAGGATATCTGGCTTTC--------------------------AC------------CCAGGGGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGG--TAACGGAACCA Stuberosum_tR88 TCCGTTATCGTCCAGCGGT--TAGGATATCTGGCTTTC-------------------------ACC------------CAGGAGA----------CCCGGGTTCGATTCCCGG--TAACGGAACCA Stuberosum_tR6 TCCATTGTCGTCCAGCGGT--TAGGATATCTGGCTTTC--------------------------AC------------CCAGGAGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGG--CAATGGAACCA Stuberosum_tR78 TCCGTTGTCGTCCAGCGGT--TAGGATATCTGGCTTTC-------------------------ACC------------CAGGAGA----------CCCGGGTTCGATTCCCGG--CAACGGATCCA Stuberosum_tR155 GCATCCATGGCTGAATGGT--TAAAGCGCCCAACTCAT-------------------------AAT-----------TGGCGAATT---------CGTAGGTTCAATTCCTAC--TGGATGCACCA 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Stuberosum_tR103 GGTTCTATGGTCTAGTGGT--CAGGACATTGGACTCTG-------------------------AAT------------CCAGTAA----------CCCGAGTTCAAATCTCGG--TAGAACCTCCA Stuberosum_tR194 GGTTCCATGGTCTAGTGGT--CAGGACATTGGACTCTG-------------------------AAT------------CCAGTAA----------CCCGAGTTCAAATCTCGG--TGGAATTTCCA Stuberosum_tR97 GGTCCCATGGTCTAGTGGT--CAGGACATTGGACTCTG-------------------------AAT------------CCAGTAA----------CCCGAGTTCAAGTCTCGG--TGGGACCTCCA Stuberosum_tR212 GGTCCCATGGTCTAGTGGT--TAGGACATTGGACTCTG-------------------------AAT------------CCAGTAA----------CCCGAGTTCAAGTCTCGG--TGGGACCTCCA Stuberosum_tR70 GGTTCCATGGTCTAGCGGT--TAGGACATTGGACTCTG-------------------------AAT------------CCAGTAA----------CCCGAGTTCAAGTCTCGG--TGGAACCTCCA Stuberosum_tR231 GGTTCCATGGTCTAGTGGT--CAGGACATTGGACTCTG-------------------------AAT------------CCAGTAA----------CCCGAGTTCAAGTCTCGG--TGGAACCTCCA Stuberosum_tR175 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Stuberosum_tR63 GATTCCATGGCCCAATGGA--TAAGGCGCTGGTCTACG-------------------------AAA------------CCAGAGAT---------TCTGGGTTCGATCCCCAGTGTGGAATCGCCA Stuberosum_tR220 GACTTCATGGCCCAATGGA--TAAGGCGCTGGTCTACG-------------------------AAA------------CCAGAGAT---------TCTGGGTTCGATCCCCAG--TGAAGTCGCCA Stuberosum_tR16 GACTCCATGGCCCAATGGA--TAAGGCGCTGGTCTACG-------------------------AAA------------CCAGAGAT---------TCTGGGTTCGATCCCCAG--TGGAGTCGCCA Stuberosum_tR90 GTTCGCGTGGCCTAATGGA--TAAGGCGCTCGCCTCCG-------------------------GAG------------CGGGAGAT---------TGTGGGTTCGAGTCCCAC--CGTGAACGCCA Stuberosum_tR205 GATCGCGTGGCCTAATGGA--TAAGGCGCTCGCCTCCG-------------------------GAG------------CGGGAGAT---------TGTGGGTTCGAGTCCCAT--CGTGATCGCCA Stuberosum_tR129 GGTCGCGTGGCCTAATGGA--TAAGGCGCTCGCCTCCG-------------------------GAG------------CGGGAGAT---------TGTGGGTTCGAGTCCCAC--CGTGATCGCCA Stuberosum_tR3 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Stuberosum_tR136 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--TAGAGCGGAGGACTGTAGTCGGGTCAAATAAAACCCACAGTTAAT------------CCTTAGGT---------CACTGGTTCGAATCCGGT--AGGTCGGACCA Stuberosum_tR19 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--TAGAGCGGAGGACTGTA----------------GTGGGTCTAAAACCTATCAGATATCCTTAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCGGC--AGGTCGGACCA Stuberosum_tR187 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--TAGAGCGGAGGACTGTA----------------GTGGGGGTAAAACCTATCAGATATCCTTAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCGGC--AGGTCGGACCA Stuberosum_tR50 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--TAGAGCGGAGGACTGTA----------------GTATGGTGTAAACCTTTCAGATATCCTTAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCGGC--AGGTCGGACCA Stuberosum_tR65 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--TAGAGCGGAGGACTGTA--GTGGGGTGTAAAACCTTTCAG-ATAT------------CCTTAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCGGC--AGGTCGGACCA Stuberosum_tR128 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--TAGAGCGGAGGACTGTA--GTGGGGTGT-AAACCTTTCAG-ATAT------------CCTTAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCGGC--AGGTCGGACCA Stuberosum_tR18 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X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y