S.lycopersicum tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Slycopersicum_tR265 GTCCCTTTCGTCCAG-TGGT-TAGGACATCGTCTTTTC--------------------------------------ATGT----------CGAAGA----------C-ACGGGTTCGATTCCCGTA-AGGGATACCA Slycopersicum_tR63 GTGGCTGTAGTTTAG-TGGT-GAGAATTCCACGTTGTG--------------------------------------GCCG----------TGGAGA----------C-CTGGGCTCGAATCCCAGC-AGCCACACCA Slycopersicum_tR178 GTGGCTGTAGTTTAG-TGGT-AAGAATTCCACGTTGTG--------------------------------------GCCG----------TGGAGA----------C-CTGGGCTCGAATCCCAGC-AGCCACACCA Slycopersicum_tR7 GCGCATCTGGTGTAG-TGGT--ATCATAGTACCCTCCC--------------------------------------ACGG----------TACTGA----------C-CGGGGTTCGATTCCCCGG-GTGCACACCA Slycopersicum_tR71 GCGCATCTGGTGTAG-TGGT--ATCATAGTACCCTCCC--------------------------------------ACGG----------TACTGA----------C-CGGGGTTCGATTCCCCGG-ATGCGCACCA Slycopersicum_tR248 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTTGATACCCGGC-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR110 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAATACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGC-TGGTTCACCA Slycopersicum_tR212 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGTGTTCGATTCCCGGT-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR20 GTACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGC-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR218 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGC-TGGTGTACCA Slycopersicum_tR37 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATATTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGC-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR91 GCACCAGTGGTCTAG-TGAT--AGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGC-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR118 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCACGGC-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR160 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACAG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGC-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR179 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAGTAACCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGC-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR151 GCACCAGTGGTCTAG-TGG--TAGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGCTGGGTGCACCA Slycopersicum_tR145 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGC-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR252 GCACCAGTGGTCTAG-TGGT--AGAATAGTACCCTGCC--------------------------------------ACGG----------TACAGA----------C-CCTGGTTCGATTCCCGGC-TGGTGCACCA Slycopersicum_tR59 GCGTTTGTAGTCCAA-CGGT-TAGGATAATTGCCTTCC--------------------------------------AAGC----------AATAGA----------T-CCGGGTTCGACTCCCGGC-AGACGCACCA Slycopersicum_tR85 GCGTTTGTAGTCCAA-CGGT-TAGGATAATTGCCTTCC--------------------------------------AAGC----------AATAGA----------C-CCGGGTTCGACTCCCGGC-AGACGCACCA Slycopersicum_tR54 GCGTCTGTAGTCCAA-CGGT-TAGGATAATTGCCTTCC--------------------------------------AAGC----------AATAGA----------C-CCGGGTTCGACTCCCGGC-AGATGCACCA Slycopersicum_tR201 GCGTCTGTAGTCCAA-CGGT-TAGGATAATTGCCTTCC--------------------------------------AAGC----------AATAGA----------C-CCGGGTTCGACTCCCGGC-AGACGCACCA Slycopersicum_tR4 GTCGTTGTAGTATAG-TGGT-AAGTATTCCTGCCTGTC--------------------------------------ACGC----------CGGTGA----------C-CCGGGTTCGATCCCCGGC-AGCGGCGCCA Slycopersicum_tR55 GTCGTTGTAGTATAG-TGGT-AAGTATTCCCGCCTGTC--------------------------------------ACGC----------GGGTGA----------C-CCGGGTTCGATCCCCGGC-AATGGCGCCA Slycopersicum_tR193 GTCGTTGTAGTATAG-TGGT-AAGTATTCCCGCCTGTC--------------------------------------ACGC----------GGGTGA----------C-CCGGGTTCGATCCCCGGC-AGCGGCGCCA Slycopersicum_tR232 GTCGTTGTAGTATAG-TGGT-AAGTATTCCCGCCTGTC--------------------------------------ACGC----------GGGTGA----------C-CCGGGTTTGATCCCCGGC-AACGGCGCCA Slycopersicum_tR249 GTCGTTGTAGTATAG-TGGT-AAGTATTCCCGCCTGTC--------------------------------------ACGC----------GGGTGA----------C-CCGGGTTCGATCCCCGGC-AACGGCGCCA Slycopersicum_tR261 TCCGTTGTAGTCTAG-TCGT-TAGGATACTCGGTTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAATTCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR235 TCCATTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTTGGCTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAAGTCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR51 TTCGATGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGG----------C-CCGGGTTCAAGTCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR64 TTCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAAGTCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR25 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAAGTCCCGGC-AATGGAACCA Slycopersicum_tR69 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAAATCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR80 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACCCGGCTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAAGTCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR131 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAAGTCCCGGC-AACAGAACCA Slycopersicum_tR149 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATATTCGGCTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAAGTCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR181 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTTTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAAGTCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR173 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTCTC--------------------------------------ACCC----------GAGAGA----------C-CCGGGTTCAAGTCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR259 TCCGTCATCGTCCAG-CGGT-TAGGATATCTGGCTTTC--------------------------------------ACCC----------AGGAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGT-AACGGAGCCA Slycopersicum_tR255 TTCGTTATCGTCCAG-CGGT-TAGGATATCTGGCTTTC--------------------------------------ACCC----------AGGAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGT-AACGGAACCA Slycopersicum_tR1 TCCGTTATCGTCCAG-CGGT-TAGGATATCTGGCTTTC--------------------------------------ACCC----------AGGAGA----------C-CCGGGTTTGATTCCCGGT-AACGGAACCA Slycopersicum_tR42 TCCGTTATCGTCCAG-CGGT-TAGGATATCTGGCTTTC--------------------------------------ACCC----------AGGAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGT-AACGGAACCA Slycopersicum_tR2 TCCATTGTCGTCCAG-CGGT-TAGGATATCTGGCTTTC--------------------------------------ACCC----------AGGAGA----------C-CCGGGTTCGATTCCCGGC-AATGGAACCA Slycopersicum_tR5 TCCGTTGTCGTCCAG-CGGT-TAGGATATCTGGCTTTC--------------------------------------ACCC----------AGGAGA----------C-CCGGGTTCAATTCCCGGC-AACGGAACCA Slycopersicum_tR242 GGGTGTTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTCGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-GTGAGTTCGATTCTCGCA-ACACCCCCCA Slycopersicum_tR278 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCGATTCTCGGA-ATGCCTCCCA Slycopersicum_tR225 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCGATTCTCGGA-ATACCCCCCA Slycopersicum_tR97 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCGATTCTCGGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR40 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCAAGTTCGATTCTCGGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR62 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG----------T-CCCAGTTCGATTCTCGGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR49 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTTAATTCTCGGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR148 GGGCATTTGGTCTAG-TAG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCAATTCTCGGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR205 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCAATTCTCGGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR175 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTAGG--------------------------------------GTGC----------AAGAGG--T-------C-CCGAGTTCAATTCTCGGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR275 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTAGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCAATTCTCAGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR253 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTAGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCAATTCTCTGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR209 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTAGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCAATTCTCGGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR10 GGGCGTTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCGATTCTCGGA-ACGCCCCCCA Slycopersicum_tR60 GGGCGTTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTTGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCAATTCTCGGA-ACGCCCCCCA Slycopersicum_tR73 GGGCATTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTCGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCGATTCCCGGA-ATGCCCCCCA Slycopersicum_tR256 GGGCGTTTGGTCTAG-TGG--TATGATTCTCGCTTCGG--------------------------------------GTGC----------GAGAGG--T-------C-CCGAGTTCGATTCCCGGA-ACGCCCCCCA Slycopersicum_tR93 GGTTCTATGGTGTAG-TGGT-TAGCACTCTGGACTTTG--------------------------------------AATC----------CAGCGA----------C-CTGGGTTCGACTCCCGGT-ATGACCTCCA Slycopersicum_tR161 GGTTCTATGGTGTAG-TGGT-TAGCACTCTGGACTTTG--------------------------------------AATC----------CAGCGA----------C-CTGGGTTCGACTTCCGGT-AGGACCTCCA Slycopersicum_tR163 GGTTCTATGGTGTAG-TGGT-TAGCACTCTGGACTTTG--------------------------------------AATC----------CAGCGA----------C-CTGGGTTCGACTCCCGGT-AGGACCTCCA Slycopersicum_tR130 GGTTCTATGGTCTAG-CGGT-TAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAATAG----------C-CCGAGTTCAATTCTCGGT-AGAACCTCCA Slycopersicum_tR208 GGTTCTATGGTCTAG-TGGT-TAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAATAG----------C-CCGAGTTCAAGTCTCGGT-AGAACCTCCA Slycopersicum_tR81 GGTTCCATGGTCTAG-TGGT-CAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAGTAA----------C-CCGAGTTCAAATCTCGGT-GGAACCTCCA Slycopersicum_tR139 GGTTCCATGGTCTAG-TGGT-CAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAGTAA----------C-CCGAGTTCAAACCTCGGT-GGAACCTCCA Slycopersicum_tR119 GGTCCCATGGTCTAG-TGGT-TAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAGTAA----------C-CCGAGTTCAAGTCTCGGT-GGGACCTCCA Slycopersicum_tR134 GGTTCCATGGTCTAG-TGGT-TAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAGTAA----------C-CCGAGTTCAAGTCTCGGT-GGAACCTCCA Slycopersicum_tR157 GGTTCTATGGTCTAG-TGGT-CAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAGTAA----------C-CCGAGTTCAAATCTCGGT-AGAATCTCCA Slycopersicum_tR186 GGTCCCATGGTCTAG-TGGT-CAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAGTAG----------C-CCGAGTTCAAATCTCGGT-GGGACCTCCA Slycopersicum_tR194 GGTCCTATGGTCTAG-CGGT-TAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAGTAA----------C-CCGAGTTCAATTCTCGGT-AGGACCTCCA Slycopersicum_tR32 GGTCCTATGGTCTAG-TGGT-CAGGACATTGGACTCTG--------------------------------------AATC----------CAGTAA----------C-CCGAGTTCAAATCTCGGT-AGGACCTCCA Slycopersicum_tR277 GCGGAAATAGCTTAA-TGG--TAGAGCATAGCCTTGCC--------------------------------------AAGG----------CTAAGG--T-------T-GAGGGTTCAAGTCCCTCC-TTCCGCTCCA Slycopersicum_tR129 ATCAAAGTGGCGCAG-CGG--AAGCGTGGTGGGCCCAT--------------------------------------AACC----------CACAGG--T-------C-CCAGGATCGAAACCTGGC-TTTGATACCA Slycopersicum_tR165 ATCAGAGTGGCGCAG-CGG--AAGCGTGGTGGGCCCAT--------------------------------------AACC----------CACAGG--T-------C-CCAGGATCTAAACCTGGC-TCTGATACCA Slycopersicum_tR273 ATCAGAGTGGCGCAG-CGG--AAGCGTGGTGGGCCCAT--------------------------------------AACC----------CACAGG--T-------C-CCAGGATCGAAACCTGGC-TCTGATACCA Slycopersicum_tR67 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GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGCTCGCTTTGC--------------------------------------ATGC----------GAGAGG----------TACAGGGTTCGATCCCCTGC-ATCTCCACCA Slycopersicum_tR176 GAGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGCTCGCTTTGC--------------------------------------ATGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATCCCCCGC-ATCTCCACCA Slycopersicum_tR167 GGGGATGTAGCTCATATGG--TAGAGCGCTCGCTTTGC--------------------------------------ATGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATCCCCCGC-ATCTCCACCA Slycopersicum_tR199 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAACGCTCGCTTTGC--------------------------------------ATGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATCCCCCGC-ATCTCCACCA Slycopersicum_tR89 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGCTCGCTTTGC--------------------------------------ATGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATCCCCCGC-ATCTCCACCA Slycopersicum_tR226 GCATCCATGGCTGAA-TGGT-TAAAGCGCCCAACTCAT---------------------------------------AAT----------TGGCGAATT-------C-GTAGGTTCAATTCCTACT-GGATGCACCA Slycopersicum_tR268 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GTTGCTGTGGTGTAG-TGGT-TATCACGTCAGTCTTAC--------------------------------------ACAC----------TGAAGG--T-------C-CCCAGTTCGATCCTGGGC-AGCAACACCA Slycopersicum_tR26 GTCGCTTTGGCCGAG-TGGT-TAAGGCGCTTGCCTGCT--------------------------------------AAGT----------AAGTGGGGTTTCCCCGC-GTGAGTTCGAATCTCACA-GGCGACGCCA Slycopersicum_tR13 GTCGCTTTGGCCGAG-TGGT-TAAGGCGTGTGCCTGCT--------------------------------------AAGT----------ACATGGGGTCTCCCCGC-GAGAGTTCGAATCTCTCA-GGCGACGCCA Slycopersicum_tR112 GTCGCTTTGGCCGAG-TGGT-TAAGGCGTGTGCCTGCT--------------------------------------AAGT----------ACATGGGGTTTCCCCGC-GAGAGTTCGCATCTCTCA-GGCGACGCCA Slycopersicum_tR171 GTCGCTTTGGCCGAG-TGGT-TAAGGCGTGTGCCTGCT--------------------------------------AAGT----------ACATGGGGTTTCCCCGC-GAGAGTTCGAATCTCTCA-GGTGACGCCA Slycopersicum_tR170 GTCGCTTTGGCCGAG-TGGT-TAAGGCGTGTGCCTGCT--------------------------------------AAGT----------ACATGGGGTTTCCCCGC-GAGAGTTCGAATCTCTCA-GGCGACGCCA Slycopersicum_tR36 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GTGGACGTGCCGGAG-TGGT-TATCGGGCATGACTAGA--------------------------------------AATC----------ATGTGGGCTTTGCCCGC-GCAGGTTCGAATCCTGCC-GTCCACGCCA Slycopersicum_tR269 GTGGACGTGCCGGAG-TGGT-TATCGGGCATGACTAGA--------------------------------------AATC----------ATGTGGGCTCTGCCCGC-GCAGGTTCGAATCT-GCC-GTCCACGCCA Slycopersicum_tR211 GTGGACGTGCCGGAG-TGGT-TATCGGGCATGACTAGA--------------------------------------AATC----------ATGTGGGCTCTGCCCGC-GCAGGTTCGAATCCTGCC-GTCCACGCCA Slycopersicum_tR23 GTCGATATGTCCGAG-TGGT-TAAGGAGACAGACTCGA--------------------------------------AATC----------TGTTGGGCTTTGCCTGC-GCAGGTTCGAATCCTGCT-GTCGACGCCA Slycopersicum_tR66 GTCAATATGTCCGAG-TGGT-TAAGGAGACAGACTCGA--------------------------------------AATC----------TGTTGGGCTTTGCCTGC-GCAGGTTCGAATCCTGCT-GTTGACGCCA Slycopersicum_tR276 GTCAATATGTCCGAG-TGGT-TAAGGAGACAGACTTGA--------------------------------------AATC----------TGTTGGGCTTCGCCCGC-GCAGGTTCGAACCCTGCT-GTTGACGCCA Slycopersicum_tR153 GTCGATATGTCCGAG-TGGT-TAAGGAGACAGACTTGA--------------------------------------AATC----------TGTTGGGCTCCGCCCGC-GCAGGTTCGAACCCTGCT-GTCGACGCCA Slycopersicum_tR202 GTCGATATGTCCGAG-TGGT-TAAGGAGACAGACTTGA--------------------------------------AATC----------TGTTGGGCTTCGCCCGC-GCAGGTTCGAACCCTGCT-GTCTACGCCA Slycopersicum_tR17 GTCGATATGTCCGAG-TGGT-TAAGGAGACAGACTTGA--------------------------------------AATC----------TGTTGGGCTTCGCCCGC-GCAGGTTCGAACCCTGCT-GTCGACGCCA Slycopersicum_tR143 GCCCGCTTAGCTCAG-AGGT-TAGAGCATCGCATTTGT--------------------------------------AATG----------CGATGG--T-------A-ATCGGTTCGATTCCGATA-GTCGGCTCCA Slycopersicum_tR221 GCCCGCTTAGCTCAG-AGGT-TAGAGCATCGCATTTGT--------------------------------------AATG----------CGATGG--T-------C-ATCGGTTCGATTCCGATA-GCCGGCTCCA Slycopersicum_tR15 GGGCATGTAGCTCAG-AGGATTAGAGTACGTGGCTACG--------------------------------------AACC----------ACGGTG--T-------C-GGGGGTTCGAATCCCTCC-TCGCCCACCA Slycopersicum_tR53 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GACTTCATGGCCCAA-TGGA-TAAGGCGCTGGTCTACG--------------------------------------AAAC----------CAGAGA--T-------T-CTGGGTTCGATCCCCAGT-GAAGTCGCCA Slycopersicum_tR9 GACTCCATGGCCCAA-TGGA-TAAGGCGCTGGTCTACG--------------------------------------AAAC----------CAGAGA--T-------T-CTGGGTTCGATCCCCAGT-GGAGTCGCCA Slycopersicum_tR44 GTTCGCGTGGCCTAA-TGGA-TAAGGCGCTCGCCTCCG--------------------------------------GAGC----------GGGAGA--T-------T-GTGGGTTCGAGTCCCACC-GTGAACGCCA Slycopersicum_tR262 GATCGCGTGGCCTAA-TGGA-TAAGGCGCTCGCCTCCG--------------------------------------GAGC----------GGGAGA--T-------T-GTGGGTTCGAGTCCCATC-GTGATCGCCA Slycopersicum_tR216 GGTCGCGTGGCCTAA-TGGA-TAAGGCGCTCGCCTCCG--------------------------------------GAGC----------GGGAGA--T-------T-GTGGGTTCGAGTCCCACC-GTGATCGCCA Slycopersicum_tR137 GCACCCGTGGCCTAA-TGGA-TAAGGCGTCTGACTTCT--------------------------------------AATC----------AGGCGA--T-------T-GTGGGTTCGAGTCCCACC-GGGTGTGCCA Slycopersicum_tR141 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X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y