P.trichocarpa tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Ptrichocarpa_tR161 GACGCTTTGGCCGAG-TGGT-TAAGGCGTGTGCCTGCTA----------------------AGTACATGGGG---TTTCCCCGCGAGAGTTCGAATCTC-TCAGGCGTCGCCA Ptrichocarpa_tR51 GTCGCTTTGGCCGAGTGGT--TAAGGCGTGTGCCTG--C----------------------TAAGTAC-ATGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTCGAATCTC-TCAGGCGACGCCA Ptrichocarpa_tR177 GTCGCTTTGGCCGAGTGGT--TAAGGCGTGTGCCTG-------------------------CTAAATACATGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTCGAATCTC-TCAGGCGACGCCA Ptrichocarpa_tR7 GTCAAGATGGCCGAGCTGGTCTAAGGCGCCAGTTTC-------------------AGGTACTGGTCCGAAAGGG---------CATGGGTTCGAATCCC-ATTCTTGACACCA Ptrichocarpa_tR176 GTCAAGATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGTTTC-------------------AGGTACTGGTCCGAAAGGG---------CATGGGTTCGAATCCC-ATTCTTGACACCA Ptrichocarpa_tR69 GTTGAGATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGATTA-------------------AGGTTCTGGTCCGAAAGGG---------CGTGGGTTCAAATCCC-ACTCTCAACACCA Ptrichocarpa_tR142 GTGGAGATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGATTA-------------------AGGTTCTGGTCCGAAAGGG---------CGTGGGTTCAAATCCC-ACTCTCCACACCA Ptrichocarpa_tR149 GACAGTTTGGCCGAGTGGTC-TAAGGCGCCAGATTT-------------------AGGCTCTGGTCCGAAAGGG---------CGTGGGTTCAAATCCC-ACAGCTGTCACCA Ptrichocarpa_tR146 GTCAGGATGGCCGAGTGGTC-TAAGGCGCCAGACTC-------------------AAGTTCTGGTCTTCGAAAG-----AGGGCGTGGGTTCAAATCCC-ACTTCTGACACCA Ptrichocarpa_tR112 GTCAGGATGGCCGAGTGGTC-TAAGGCGCCAGACTC-------------------AAGTTCTGGTCTTCGAGAG-----AGGGCGTGGGTTCAAATCCC-ACTTCTGACACCA Ptrichocarpa_tR133 GTCAGGATGGCCGAGTGGTC-TAAGGCGCCAGACTC-------------------AAGTTCTGGTCTTCGTGAG-----AGGGCGTGGGTTCAAATCCC-ACTTCTGACACCA Ptrichocarpa_tR13 GTCAGGATGGCCGAGTGGTC-TAAGGCGCCAGACTC-------------------AAGTTCTGGTCCTCGTGAG-----AGGGCGTGGGTTCAAATCCC-ACTTCTGACACCA Ptrichocarpa_tR164 GTAAGGATGGCCGAGTGGTC-TAAGGCGCCAGACTC-------------------AAGTTCTGGTCCTCGTGAG-----AGGGCGTGGGTTCAAATCCC-ACTTCTGACACCA Ptrichocarpa_tR73 GCTGGTTTGCCCGAGAGGT--TAAGGGGGAAGACTT------------------------AAGATCTTCTGTACATAAGTACGCATGGGTTCGAACCCC-ATAGCCAGCACCA Ptrichocarpa_tR95 GCTGGTTTGCCCGAGAGGT--TAAGGGGGAAGACTT------------------------AAGATCTTCTGCACATAAGTGCGCATGGGTTCGAACCCC-ATAGCCAGCACCA Ptrichocarpa_tR119 GCAGGTTTGCCCGAGAGGT--TAAGGGGGAAGACTT------------------------AAGATCTTCTGTACATAAGTACGCGTGGGTTCGAACCCC-ACAGCCTGCACCA Ptrichocarpa_tR27 GCTGGTTTGCCCGAGAGGT--TAAGGGGGAAGACTT------------------------AAGATCTTCTGTGCATAAGCACGCGTGGGTTCGAACCCC-ACAGCCAGCACCA Ptrichocarpa_tR156 GCTGGTTTGCCCGAGTGGT--TAAGGGGGAAGACTT------------------------AAGATCTTCTGTGCATAAGCACGCGTGGGTTCGAACCCC-ACAGCCAGCACCA Ptrichocarpa_tR169 GGCGACATGGCCGAGTGG---TAAGGCGGGGGACTG------------------------CAAATCCT-----------TTTTCCCCAGTTCAAATCCG-GGTGTCGCCTCCA Ptrichocarpa_tR32 GTGGGCGTGCCGGAGTGGT--TATCGGGCATGACTA------------------------GAAATCATGTGGGC-TCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCT-GCCGCTCACGCCA Ptrichocarpa_tR128 GTGGGCGTGCCGGAGTGGT--TATCGGGCATGACTA------------------------GAAATCATGTGGGC-TTTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCT-GCCGCTCACGCCA Ptrichocarpa_tR42 GTGGACATGCCGGAGTGGT--TATCGGGCATGACTA--------------GAAATCATGTGAAATCATGTGGGC-TCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCT-GCTGTTCACGCCA Ptrichocarpa_tR84 GTGGACATGCCGGAGTGGT--TATCGGGCATGACTA------------------------GAAATCATGTGGGC-TCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCT-GCTGTTCACGCCA Ptrichocarpa_tR66 GTGGACATGCCGGAGTGGT--TATCGGGCATGACTA------------------------GAAATCATGTGGGT-TCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCT-GCTGTTCACGCCA Ptrichocarpa_tR48 GTGGACGTGCCGGAGTGGT--TATCGGGCATGACTA------------------------GAAATCATGTGGGC-TTTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCT-GCCGTCCACGCCA Ptrichocarpa_tR111 GTGGACGTGCCGGAGTGGT--TATCGGGCATGACTA------------------------GAAATCATGTGGGC-TCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCT-GCCGTTCACGCCA Ptrichocarpa_tR39 GTCGATATGTCCGAGTGGT--TAAGGAGACAGACTC------------------------GAAATCTGTTGGGC-TTTGCCTGCGCAGGTTCGAATCCT-GCTGTCGACGCCA Ptrichocarpa_tR108 GTCGATATGTCCGAGTGGT--TAAGGAGACAGACTC------------------------GAAATCTGTTGGGC-TGTGCCTGCGCAGGTTCGAATCCT-GCTGTCGACGCCA Ptrichocarpa_tR134 GTCGATATGTCCGAGTGGT--TAAGGAGACAGACTC------------------------GAAATCTGTTGGGC-TATGCCTGCGCAGGTTCGAATCCT-GCTGTCGACGCCA Ptrichocarpa_tR25 GTCGATATGTCCGAGTGGT--CAAGGAGACAGACTT------------------------GAAATCTGTTGGGC-TTCGCCCGTGCAGGTTCGAACCCT-GCTGTCGATGCCA Ptrichocarpa_tR31 GTCGATATGTCCGAGTGGT--TAAGGAGACAGACTT------------------------GAAATCTGTTGGGC-TTCGCCCGCGCAGGTTCGAACCCT-GCTGTCGACGCCA Ptrichocarpa_tR62 GTCGATATGTCCGAGTGGT--TAAGGAGACAGACTT------------------------GAAATCTGTTGGGC-TACGCCCGCGCAGGTTCGAACCCT-GCTGTCGACGCCA Ptrichocarpa_tR8 GTCGATATGTCCGAGTGGT--TAAGGAGATAGACTT------------------------GAAATCTATTGGGC-TACGCCCGCGCAGGTTCGAACCCT-GCTGTCGACGCCA Ptrichocarpa_tR50 GTCGATATGTCCGAGTGGT--TAAGGAGATAGACTT------------------------GAAATCTATTGGGC-TTCGCCCGCGCAGGTTCGAACCCT-GCTGTCGACGCCA Ptrichocarpa_tR55 GTGGCTGTAGTTTAGTGGT--AAGAATTCCACGTTG-------------------------TGGCCGTGGAGA----------CCTGGGCTCGAATCCC-AGCAGCCACACCA Ptrichocarpa_tR92 GTGGCTGTAGTTTAGTGGT--GAGAATTCCACGTTG-------------------------TGGCCGTGGAGA----------CCTGGGCTCGAATCCC-AGCAGCCACACCA Ptrichocarpa_tR163 GCGCATCTAGTGTAGTGGTATCATAGTACCCTCCCA-----------------------------CGGTACTGA---------CCGGGGTTCGATTCCC-CGGATGCGCACCA Ptrichocarpa_tR70 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATTGTACCCTG-------------------------CCACGGTACAGA----------CCCGGGTTCGATTACC-GGCTGGTGCACCA Ptrichocarpa_tR45 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTG-------------------------CCACGGTACAGA----------CCCGGGTTCGATTCCC-GGCTTGTGCACCA Ptrichocarpa_tR19 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTG-------------------------CCACGGTACAGA----------CCCGGGTTCGATTCCC-GGCTGGTGCACCA Ptrichocarpa_tR24 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTG--------------------------CCACGGTACAGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGGTGCACCA Ptrichocarpa_tR67 GCACCAGTGGTCTAGTGG---TAGAATAGTACCCTG--------------------------CCACGGTACAGA---------CCCGGGTTCGACTCCC-GGCTGGTGCACCA Ptrichocarpa_tR140 GCATCTGTAGTCCAACGGT--TAGGATAATTGCCTT--C----------------------CAAGCAA-TAGA----------CCCGGGTTCGACTCCC-GGCAAACGCACCA Ptrichocarpa_tR78 GCGTTTGTAGTCCAACGGT--CAGGATAATTGCCTT--C----------------------CAAGCAA-TAGAT----------CCGGGTTCGACTCCC-GGCAGACGCACCA Ptrichocarpa_tR56 GCGTTTGTAGTCCAACGGT--CAGGATAATTGCCTT------------------------CCAAGCAA-TAGA----------CCCGGGTTCGACTCCC-GGCAGACGCACCA Ptrichocarpa_tR16 GCGTTTGTAGTCCAACGGT--CAGGATAATTGCCTT--C----------------------CAAGCAA-TAGA----------CCCGGGTTCGACTCCC-GGCAAACGCACCA Ptrichocarpa_tR89 GCGTTTGTAGTCCAACGGT--TAGGATAATTGCCTT--C----------------------CAAGCAA-TAGA----------CCCGGGTTCGACTCCC-GGCAAACGCACCA Ptrichocarpa_tR117 GCGTTTGTAGTCCAACGGT--TAGGATAATTGCCTT--C----------------------CAAGCAA-TAGA----------CCCGGGTTCGACTCCC-GGCAGACGCACCA Ptrichocarpa_tR68 GTCGTTGTAGTATAGTGGT--AAGTATTCCCGCCTG----------------------------TCACGCGGGT-------GACCCGGGTTCGATCCCC-GGCAGCGGCGCCA Ptrichocarpa_tR76 GTCGTTGTAGTATAGTGGT--GAGTATTCCCGCCTG----------------------------TCACGCGGGT-------GACCCGGGTTCGATCCCC-GGCAACGGCGCCA Ptrichocarpa_tR143 GTCGTTGTAGTATAGTGGT--AAGTATTCCCGCCTG----------------------------TCACGCGGGT-------GACCCGGGTTCGATCCCC-GGCAACGGCGCCA Ptrichocarpa_tR94 TCCGTTGTCGTCCAGCGGT--TAGGATATCTGGCTT-------------------------TCACCCAGGAGA----------CCCGGGTTCGATTCCC-GGCAACGGAACCA Ptrichocarpa_tR100 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-CAGGATATTCGGCTC-------------------------TCACCCG-AAAGA---------CCCGGGTTCAAGTCCC-GGCAACGGAACCA Ptrichocarpa_tR82 TCCGTTGTAGTCTAGTAGGT-CAGGATACTCGGCTC-------------------------TCACCCG-AGAGA---------CCCGGGTTCAAGTCCC-GGCAACGGAACCA Ptrichocarpa_tR79 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-CAGGATACTCGGCTC-------------------------TCACCCGAGAGA----------CCCGGGTTCAAGTCCC-GGCAACGGAACCA Ptrichocarpa_tR3 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTC-------------------------TCACCCG-AGCGA---------CCCGGGTTCAAGTCCC-GGCAACGGAACCA Ptrichocarpa_tR141 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTC-------------------------TCACCAG-AGAGA---------CCCGGGTTCAAGTCCC-GGCAACGGAACCA Ptrichocarpa_tR53 TCCGTTGTAGTCTAGTTGGT-TAGGATACTCGGCTC-------------------------TCACCCGAGAGA----------CCCGGGTTCAAGTCCC-GGCAACGGAACCA Ptrichocarpa_tR23 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGCTCGCTTA------------------------GCATGCGA-GAGGT---------ACGGGGATCGATACCC-CGCATCTCCACCA Ptrichocarpa_tR166 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGCTCGCTTA------------------------GCATGCGA-GAGGT---------ACGGGGATCGATACCC-TGCATCTCCACCA Ptrichocarpa_tR1 GGGGATGTAGCACAAATGG--TAGAGCGCTCGCTTT------------------------GCATGCGA-GAGGT---------ACAGGGTTCGATCCCC-TGCATCTCCACCA Ptrichocarpa_tR71 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGCTCGCTTT------------------------GCATGCGA-GAGGT---------ACAGGGTTCGATCCCC-TGCATCTCCACCA Ptrichocarpa_tR121 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGCTCGCTTT------------------------GCATGCGA-GAGGC---------ACGGGGTTCGATCCCC-CGCATCTCCACCA Ptrichocarpa_tR36 GGGGATGTAGCTCATATGG--TAGAGCGCTCGCTTC------------------------GCATGCGA-GAGGC---------ACGGGGTTCGATTCCC-CGCATCTCCACCA Ptrichocarpa_tR40 GGGGGTGTAGCTCATATGG--TAGAGCGCTCGCTTC------------------------GCATGCGA-GAGGC---------ACGGGGTTCGATTCCC-CGCACCTCCACCA Ptrichocarpa_tR49 GGGGTTGTAGCTCATATGG--TAGAGCGCTCGCTTC------------------------GCATGCGA-GAGGC---------ACGGGGTTCGATTCCC-CGCAGCTCCACCA Ptrichocarpa_tR2 GGGTGTTTGGTCTAGTGG---TATGATTCTCGCTTC-------------------------GGGTGCGAGAGGT---------CGCGAGTTCGATTCTC-GCAACACCCCCCA Ptrichocarpa_tR136 GGGTGTTTGGTCTAGTGG---TATGATTCTCGCTTC-------------------------GGGTGCGAGAGGT---------CGTGAGTTCGATTCTC-GCAACACCCCCCA Ptrichocarpa_tR91 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTCTCGCTTA-------------------------GGGTGCGAGAGGT---------CCCGAGTTCAATTCTC-GGAATGCCCCCCA Ptrichocarpa_tR182 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTCTCGCTTA-------------------------GGGTGCGAGAGGT---------CCCAAGTTCAATTCTC-GGAATGCCCCCCA Ptrichocarpa_tR17 GGGCGTTTGGTCTAGTGG---TATGATTCTCGCTTT-------------------------GGGTGCGAGAGGT---------CCCGAGTTCGATTCTC-GGAACGCCCCCCA Ptrichocarpa_tR52 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTCTTGCTTT-------------------------GGGTGCAAGAGGT---------CCCGAGTTCGATTCTC-GGAATGCCCCCCA Ptrichocarpa_tR10 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTCTCGCTTT-------------------------GGGTGCGAGAGGT---------CTCGAGTTCGATTCTC-GGAATGCCCCCCA Ptrichocarpa_tR132 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTCTCGCTTT-------------------------GGGTGCGAGAGGT---------CCCGAGTTCGATTCTC-GGAATGCCCCCCA Ptrichocarpa_tR34 GGTTCTATGGTGTAGTGGT--TAGCACTCTGGACTT------------------------TGAATCCA-GCGA----------CCTGGGTTCGACTCCC-GGTAGGACCTCCA Ptrichocarpa_tR162 GGTTCCATGGTCTAGCGGT--TAGGACATTAGACTC------------------------TGAATCTAGTAA-----------CCCGAGTTCAATTCTC-GGTGGAACCTCCA Ptrichocarpa_tR135 GGTCCCGTGGTCTAGTGGT--GAGGACATTGGACTC--T----------------------GAATCCAGTAA-----------CCCGAGTTCAAATCTC-GGCGGGACCTCCA Ptrichocarpa_tR15 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GGGCCTGTAGCTCAGAGGAT-TAGAGCACGTGGCTA--C----------------------GAACCAC-GGTGT---------CGGGGGTTCGAATCCC-TCCTCGCCCACCA Ptrichocarpa_tR90 AGCGGAGTGGCGCAGCGGA---AGCGTGGTGGGCCC--A----------------------TAACCCA-CAGGT---------CCCAGGATCGAAACCT-GGCTCCGCTACCA Ptrichocarpa_tR106 ATCAGAGTGGCGCAGCGGA---AGCGTGGTGGGCCC--A----------------------TAACCCA-CAGGT---------CCCTGGATCGAAACCA-GGCTCTGATACCA Ptrichocarpa_tR180 ATCAGAGTGGCGCAGCGGA---AGCGTGGTGGGCCC--A----------------------TAACCCA-CAGGT---------CCCAGGATCGAAACCT-GGCTCTGATACCA Ptrichocarpa_tR116 GCATCCATGGCTGAATGGT--TAAAGCGCCCAACTC------------------------ATAATTGGCGAATT---------CGTAGGTTCAATTCCT-ACTGGATGCACCA Ptrichocarpa_tR6 GGTGTCGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGTCAGTCTA------------------------ACACACTG-AAGGT---------CTCCGGTTCGAGCCCG-GGCGACGCCACCA Ptrichocarpa_tR103 GGTGTCGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGTCAGTCTA------------------------ACACACTG-AAGGT---------CTCCGGTTCGAGTCCG-GGCGACGCCACCA Ptrichocarpa_tR150 GGTGTCGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGTAAGTCTA------------------------ACACACTG-AAGGT---------CTCCGGTTCGAACCCG-GGCGACGCCACCA Ptrichocarpa_tR174 GGTGTCGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGTCAGTCTA------------------------ACACACTG-AAGGT---------CTCCGGTTCGAACCCG-GGCGACGCCACCA Ptrichocarpa_tR93 GTTGCTGTGGTGTAGTGGT--TATCACGTTAGTCTT------------------------ACACACTA-AAGGT---------CTCCAGTTCGATCCTG-GGCAGCAACACCA Ptrichocarpa_tR153 GTTGCTGTGGTGTTGTGGT--TATCACGTTAGTCTT------------------------ACACACTA-AAGGT---------CCCCAGTTCGATCCTG-GGCAGCAACACCA Ptrichocarpa_tR29 GTTGCTGTGGTGTAGTGGT--TATCACGTTAGTCTT-------------------------ACACACTAAAGGT---------CCCCAGTTCGATCCTG-GGCAGCAACACCA Ptrichocarpa_tR145 GTCCGGGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGCTAGTCTC------------------------ACACACTA-GAGGT---------CCCCGGTTCGAACCCG-GGCTCGGACACCA Ptrichocarpa_tR33 GTCTGGGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGTTAGTCTC------------------------ACACACTA-AAGGT---------CCCCGGTTCGAACCCG-GGCTCAGACACCA Ptrichocarpa_tR129 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GACTCCGTGGCCCAATGGA--TAAGGCGCTGGTCTA--C----------------------GGAACCA-GAGAT---------TCTGGGTTCGATCCCC-AGCGGAGTCGCCA Ptrichocarpa_tR14 GACTCCATGGCCCAATGGA--TAAGGCGCTGGTCTA--C----------------------GAAACCA-GAGAT---------TCTGGGTTCGATCCCC-AGTGGAGTCGCCA Ptrichocarpa_tR157 GACTCCATGGCCCAATGGA--TAAGGTGCTGGTCTA--C----------------------GGAACCA-GAGAT---------TCTGGGTTCGATCCCC-AGTGGAGTCGCCA Ptrichocarpa_tR77 GACTCCATGGCCCAATGGA--TAAGGCGCTGGTCTA--C----------------------GGAACCA-GAGAT---------TCTGGGTTCGATCCCC-AGTGGAGTCGCCA Ptrichocarpa_tR104 GATCGCGTGGCCTAATGGA--TAAGGCGCTCGCCTC--C----------------------GGAGCGG-GAGAT---------TGTGGGTTCGAGTCCC-ATCGCGATCGCCA Ptrichocarpa_tR105 GATCGCGTGGCCTAATGGA--TAAGGCGCTCGCCTC--C----------------------GGAGCGG-GAGAT---------TGTGGGTTCGAGTCCC-ACCGTGATCGCCA Ptrichocarpa_tR38 GCGGGGATAGCTCAGTTGG--GAGAGCGTCAGACTG------------------------AAGATCTG-AAGGT---------CGCGTGTTCGATCCAC-GCTCACCGCACCA Ptrichocarpa_tR123 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GGGTCCATAGCTCAGTGG---TAGAGCATTTGACTG--C----------------------AGATCAA-GAGGT---------CACCGGTTCGAACCCG-GTTGGGCCCTCCA Ptrichocarpa_tR9 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--TAGAGCGGAGGACTG---TAGTGGGTAGATATCCTAGTAGCCATCCT-TAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCG-GCAGGTCGGACCA Ptrichocarpa_tR4 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--CAGAGCGGAGGACTG----TAGTGGGTAAAATCCAAATAGCCATCCT-TAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCG-GCAGGTCGGACCA Ptrichocarpa_tR109 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--CAGAGCGGAGGACTG----TAGTGGGTGAAATCCAAATAGCCATCCT-TAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCG-GCAGGTCGGACCA Ptrichocarpa_tR107 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--TAGAGCGGAGGACTG--------TAGTTGTTTGTAACAGACAATCCT-TAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCG-GCAGGTCGGACCA Ptrichocarpa_tR126 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--TAGAGCGGAGGACTG----TAGTGGGTGAAATCCTGATGGCCATCCT-TAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCG-GCAGGTCGGACCA Ptrichocarpa_tR46 CCGACCTTAGCTCAGTTGG--CAGAGCGGAGGACTG-------------TAGTGGTGTCTGTAATCCT-TAGGT---------CGCTGGTTCGAATCCG-GCAGGTCGGACCA Ptrichocarpa_tR99 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