P.persica tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Ppersica_tR70 ATCAGAGTGGCGCAG-----CGGAAGCGTGGTGGGCCCATA--------------------ACCC---------A-CAGGT-------CCCTAGATCGAAACTAGGCTCTGATACCA Ppersica_tR156 ATCAGAGTGGCGCAG-----CGGAAGCGTGGTGGGCCCATA--------------------ACCC---------A-CAGGT-------CCCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATACCA Ppersica_tR95 ATCAGAGTGGCGCAG-----CGGAAGCGTGGTGGGCCCATA--------------------ACCC---------A-CAGGT-------CCCTGGATCGAAACCAGGCTCTGATACCA Ppersica_tR51 GTCGCTTTGGCCGAG--T--GGTTAAGGCGTGTGCCTGCTA--------------------AGTA--------CATGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACGCCA Ppersica_tR141 GACGCTTTGGCCGAG--T--GGTTAAGGCGTGTGCCTGCTA--------------------AGTA--------CATGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGTCGCCA Ppersica_tR32 GTGGGCGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA--------------------ATCA--------TGTGGGCTCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCTCACGCCA Ppersica_tR57 GTGAGCGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA--------------------ATCA--------TGTGGGCTCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCTCACGCCA Ppersica_tR49 GTGGACGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA--------------------ATCA--------TGTGGGCTTTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGTCCACGCCA Ppersica_tR114 GTGGTCGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA--------------------ATCA--------TGTGGGCTTTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGACCACGCCA Ppersica_tR139 GTGGGCGTGCCGGAG--T--GGTTATCGGGCATGACTAGAA--------------------ATCA--------TGTGGGCTTTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCCCACGCCA Ppersica_tR24 GTCGATATGTCCGAG--T--GGTTAAGGAGACAGACTTGAA--------------------ATCTGTTGGGCTTC-GCCCG-------CGCAGGTTCGAACCCTGCTGTCGACGCCA Ppersica_tR41 GTCGATATGTCCGAG--T--GGTTAAGGAGACAGACTCGAA--------------------ATCTGTT--------GGGCTTTGCCTGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTCGACGCCA Ppersica_tR19 GCAGGTTTGCCCGAG----AGGTTAAGGGGGTAGACTTAAG--------------------ATCTACTGTACATAAGTACG-------CGTGGGTTCGAACCCCACAGCCTGCACCA Ppersica_tR86 GCTGGTTTGCCCGAG----AGGTTAAGGGGGAAGACTTAAG--------------------ATCTTCTGCACATAAGTGCG-------CATGGGTTCGAACCCCATAGCCAGCACCA Ppersica_tR22 GTCAGGATGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGACTCAAG--------------------TTCTGGTCCTCTAACGAGGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Ppersica_tR94 GTCAGGATGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGACTCAAG--------------------TTCTGGTCCTCGAAAGAGGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Ppersica_tR103 GTCAGGATGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGACTCAAG--------------------TTCTGGTCTTCGAGAGAGGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Ppersica_tR129 GTCAGGATGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGACTCAAG--------------------TTCTGGTCTTCGAAAGAGGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Ppersica_tR130 GACGGTTTGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGATTTAGG---------------CTCTGGTCC---------GAAAGGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACAGCCGTCACCA Ppersica_tR131 GACAGTTTGGCCGAG-TG--GTCTAAGGCGCCAGATTTAGG---------------CTCTGGTCC---------GAAAGGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACAGCTGTCACCA Ppersica_tR155 GTCAAGATGGCCGAG--TTGGTCTAAGGCGCCAGTTTCAGG---------------TACTGGTCC---------GAAAGGG-------CATGGGTTCGAATCCCATTCTTGACACCA Ppersica_tR125 GTGGAGATGGCCGAGTTG--GTCTAAGGCGCCAGATTAAGG---------------TTCTGGTCC---------GAAAGGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACTCTCCACACCA Ppersica_tR136 GTTGATATGGCCGAG--TTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGG---------------TTCTGGTCC---------GAAAGGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACTGTCAACACCA Ppersica_tR61 GTTGAGATGGCCGAG--TTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGG---------------TTCTGGTCC---------GAAAGGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACTCTCAACACCA Ppersica_tR62 GTTGAGATGGCCGAG--TTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGG---------------TTCTGGTCC---------GAAATGG-------CGTGGGTTCAAATCCCACTCTCAACACCA Ppersica_tR98 GCATCCATAGCTGAA--T--GGTTAAAGCACCCAACTCATA--------------------ATTG---------GCGAATT-------CGTAGGTTCAATTCCTACTGGATGCACCA Ppersica_tR107 GCATCCATGGCTGAA--T--GGTTAAAGCGCCCAACTCATA--------------------ATTG---------GCGAATT-------CGTAGGTTCAATTCCTACTGGATGCACCA Ppersica_tR39 GTCGGGATAGCTCAG--C--TGGTAGAGCAGAGGACTGAAA--------------------ATCC---------T-CGTGT-------CACCAGTTCAAATCTGGTTCCTGGCACCA Ppersica_tR121 GGTGCTGTGGTGTAG--T--GGTTATCACGTCAGTTTTACA--------------------CACT---------G-AAGGT-------CCCCAGTTCGATCCTGGGCAGCATCACCA Ppersica_tR88 GTTGCTGTGGTGTAG--T--GGTTATCACGTCAGTCTTACA--------------------CACT---------G-AAGGT-------CTCCAGTTCGATCCTGGGCAGCAACACCA Ppersica_tR21 GTTGCTGTGGTGTAG--T--GGTTATCACGTTAGTCTTACA--------------------CACT---------A-AAGGT-------CCCCAGTTCGATCCTGGGCAGCAACACCA Ppersica_tR87 GTTGCTGTGGTGTAG--T--GGTTATCACGTTAGTCTTACA--------------------CACT---------A-AAGGT-------CTCCAGTTCGATCCTGGGCAGCAACACCA Ppersica_tR33 GTCTGGGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTTAGTCTCACA--------------------CACT---------A-AAGGT-------CCCCGGTTCGAACCCGGGCTCAGACACCA Ppersica_tR116 GTCTGGGTGGTGTAG-TC--GGTTATCACGCTAGTCTCACA--------------------CACT---------A-GAGGT-------CCCCGGTTCGAACCCGGGCTCAGACACCA Ppersica_tR132 GTCTGGGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGCTAGTCTCACA--------------------CACT---------A-GAGGT-------CCCCGGTTCGAACCCGGGCTCAGACACCA Ppersica_tR53 GGTTTCGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTCAGTCTAACA--------------------CACT---------G-AAGGT-------CCCCAGTTCGAGCCTGGGCGAAGCCACCA Ppersica_tR99 GGTTTCGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTCAGTCTAACA--------------------CACT---------G-AAGGT-------CCCCAGTTCGAACCTGGGCGAAGCCACCA Ppersica_tR69 GGTGTCGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTCAGTCTAACA--------------------CACT---------G-AAGGT-------CTGCGGTTCGAGTCCGTGCGACGCCACCA Ppersica_tR93 GGTGTCGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTCAGTCTAACA--------------------CACT---------G-AAGGT-------CTCCGGTTCGAGTCCGGGCGACGCCACCA Ppersica_tR75 GGTTTCGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTCAGTCTAACA--------------------CACT---------G-AAGGT-------CTCCGGTTCGAACCCGGGCGAAGCCACCA Ppersica_tR153 GGTGTCGTGGTGTAG-TT--GGTTATCACGTCAGTCTAACA--------------------CACT---------G-AAGGT-------CTCCGGTTCGAACCCGGGCGACGCCACCA Ppersica_tR54 GGGTGTATAGCTCGG--T--TGGTAGAGCATTAGGCTTTTA--------------------ACCT---------A-ATGGT-------CTTAGGTTCAAGTCTTGCTATACCCACCA Ppersica_tR31 GGATCAGTGGCGCAA-----TGGTAGCGCGTCTGACTCCAG--------------------ATCA---------G-AAGGT-------TGCGTGTTCGATTCACGTCGGGTTCACCA Ppersica_tR117 GGATCCGTGGCGCAA-----TGGTAGCGCGTCTGACTCCAG--------------------ATCA---------G-AAGGT-------TGCGTGTTCGATTCACGTCGGGTTCACCA Ppersica_tR148 GATCGCATAGCGGAG--T--GGATATCGCATTAGACTCCGG--------------------ATCT---------A-AAGGT-------CGTGGGTTCGAATCCCACTGCGATCGCCA Ppersica_tR58 GACCGCATAGCGCAG-TG--GATTAGCGCGTTTGACTTCGG--------------------ATCA---------A-AAGGT-------CGTGGGTTCGACTCCCACTGTGGTCGCCA Ppersica_tR159 GACCGCATAGCGCAG-TG--GATTAGCGCGTCTGACTTCGG--------------------ATCA---------G-AAGGC-------CGTGGGTTCGACTCCCACTGTAGTCGCCA Ppersica_tR154 GACCGCATAGCGCAG-TG--GATTAGCGCGTCTGACTTCGG--------------------ATCA---------G-AAGGT-------CGTGGGTTCGACTCCCACTGTGGTCGCCA Ppersica_tR76 GACTCTGTGGCCCAA--T--GGATAAGGCGCTGGTCTACGG--------------------AACC---------A-GAGAT-------TCTGGGTTCGATCCCCAGCAGAGTCGCCA Ppersica_tR9 GACTCCATGGCCCAA--T--GGATAAGGCGCTGGTCTACGA--------------------AACC---------A-GAGAT-------TCTGGGTTCGATCCCCAGTGGAGTCGCCA Ppersica_tR26 GACTTCATGGCCCAA--T--GGATAAGGCGCTGGTCTACGG--------------------AACC---------A-GAGAT-------TCTGGGTTCGATCCCCAGTGAAGTCGCCA Ppersica_tR91 GATCGCGTGGCCTAA--T--GGATAAGGCGCTCGCCTCCGG--------------------AGCG---------G-GAGAT-------TGTGGGTTCGAGTCCCACCGTGATCGCCA Ppersica_tR92 GATCGCGTGGCCTAA--T--GGATAAGGCGCTCGCCTCCGG--------------------AGCG---------G-GAGAT-------TGTGGGTTCGAGTCCCATCGCGATCGCCA Ppersica_tR59 GCGCCCGTGGCCTAA--T--GGATAAGGCATTTGACTTCTA--------------------ATCA---------A-AGGAT-------TGTGGGTTCGAATCCCACCGGGCGTGCCA Ppersica_tR20 GCGCCCATGGCCTAA--T--GGATAAGGCGCTTGACTTCTA--------------------ATCA---------A-GCGAT-------TGTGGGTTCGAGTCCCACTGGGCGTGCCA Ppersica_tR2 GCACCCGTGGCCTAA--T--GGATAAGGCGTCTGACTTCTA--------------------ATCA---------G-GCGAT-------TGTGGGTTCGAGTCCCACCGGGTGTGCCA Ppersica_tR4 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CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTGGTAAAAGCCTGGCAGGCATCC---------T-TAGGT-------CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Ppersica_tR105 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG----TTGTTTGAAAGCAGACATCC---------T-TAGGT-------CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Ppersica_tR133 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG--TTGGAGTATCCATCGGTTATCC---------T-TAGGT-------CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Ppersica_tR30 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG-----TTGCAAATAACAGATATCC---------T-TAGGT-------CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Ppersica_tR44 CCGACCTTAGCTCAG--T--TGGTAGAGCGGAGGACTGTAG--TTGGAAAATCCATCAGATATCC---------T-TAGGT-------CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Ppersica_tR90 CCGACCTTAGCTCAG-TT--GG-TAGAGCGGAGGACTGTAG--TTGGTATAACCATCAGATATCC---------T-TAGGT-------CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Ppersica_tR60 GGGTCCATAGCTCAG-----TGGTAGAGCATTTGACTGCAG--------------------ATCA---------A-GAGGT-------CACCGGTTCGATCCTGGTTGGGCCCTCCA Ppersica_tR40 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GGGGACGTAGCTCAT----ATGGTAGAGCGCTCGCTTCGCA--------------------TGCG---------A-GAGGC-------ACGGGGTTCGATTCCCCGCGTCTCCACCA Ppersica_tR43 GGGGGTGTAGCTCAT----ATGGTAGAGCGCTCGCTTCGCA--------------------TGCG---------A-GAGGC-------ACGGGGTTCGATTCCCCGCACCTCCACCA Ppersica_tR110 GGGGATGTAGCTCAG----ATGGTAGAGCGCTCGCTTAGCA--------------------TGCG---------A-GAGGT-------ACAGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Ppersica_tR144 GGGGATGTAGCTCAG----ATGGTAGAGCGCTCGCTTAGCA--------------------TGCG---------A-GAGGT-------ACGGGGATCGATGCCCCGCATCTCCACCA Ppersica_tR18 GGGGATGTAGCTCAG----ATGGTAGAGCGCTCGCTTAGCA--------------------TGCG---------A-GAGGT-------ACGGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Ppersica_tR122 GGGGATGTAGCTCAC----ATGGTAGAGCGCTCGCTTTGCA--------------------TGCG---------A-GAGGT-------ACGGGGTTCGATACCCCGCATCTCCACCA Ppersica_tR72 GGGGATGTAGCTCAA----ATGGTAGAGCGCCCGCTTTGCA--------------------TGCG---------G-GAGGT-------ACAGGGTTCGATCCCCTGCATCTCCACCA Ppersica_tR64 GGGGATGTAGCTCAA----ATGGTAGAGCGCTCGCTTTGCA--------------------TGCG---------A-GAGGT-------ACAGGGTTCGATCCCCTGCATCTCCACCA Ppersica_tR142 GGGGATGTAGCTCAA----ATGGTAGAGCGCTCGCTTTGCA--------------------TGCG---------A-GAGGT-------ACAGGGTTCGATACCCTGCATCTCCACCA Ppersica_tR151 GGGGATTTAGTCCAG-----TGGTAGGATGCTCGCTTAGGG--------------------AGCG---------A-AAGGT-------CCCGAGTTCAATTCTCGGAATCCCCACCA Ppersica_tR1 GGGTGTTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTCGGG--------------------TGCG---------A-GAGGT-------CGCGAGTTCGATTCTCGCAACACCCCCCA Ppersica_tR6 GGGCGTTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTCGGG--------------------TGCG---------A-GAGGT-------CGTGAGTTCGATTCTCGCAACGCCCCCCA Ppersica_tR47 GGCCGTTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTTGCTTTGGG--------------------TGCA---------A-GAGGT-------CCCGAGTTCGATTCTCGGAACGGCCCCCA Ppersica_tR158 GGGCATTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTTGGG--------------------TGTG---------A-GAGGT-------CCCGAGTTCAATTTTCGGAATGCCCCCCA Ppersica_tR84 GGGCATTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTAGGG--------------------TGCG---------A-GAGGT-------CCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Ppersica_tR119 GGGCATTTGGTCTAG-----TGGTATGATTCTCGCTTTGGG--------------------TGCG---------A-GAGGT-------CCCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Ppersica_tR35 GGTCCCATGGTCTAG--T--GGTTAGGACATTGGACTCTGA--------------------ATCC-----------AGTAA-------CCCGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCTCCA Ppersica_tR65 GGTCCCATGGTCTAG--T--GGTCAGGACATTGGACTCTGA--------------------ATCC-----------AGTAA-------CCCGAGTTCAAGTCTCGGTGGGACCTCCA Ppersica_tR8 GGTCCCATGGTCTAG--T--GGTCAGGACATTGGACTCTGA--------------------ATCC-----------AGTAA-------CCCGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCTCCA Ppersica_tR52 GGTTCCATGGTCTAG--C--GGTTAGGACATTGGACTCTGA--------------------ATCC-----------AGTAA-------CCCGAGTTCAAGTCTCGGTGGAACCTCCA Ppersica_tR28 GGTTCCATGGTCTAG--T--GGTTAGGACATTGGACTCTGA--------------------ATCC-----------AGTAA-------CCCGAGTTCAAATCTCGGTGGAACCTCCA Ppersica_tR11 GGTTCTGTAGTGTAG--T--GGTTAGCACTCTGGACTTTGA--------------------ATCC-----------AGCGA-------CCTGGGTTCGACTCCCGGCAGGACCTCCA Ppersica_tR34 GGTTCTATGGTGTAG--T--GGTTAGCACTCTGGACTTTGA--------------------ATCC-----------AGCGA-------CCTGGGTTCGACTCCCGGTAGGACCTCCA Ppersica_tR97 GGTTCCATGGTGTAG--T--GGTTAGCACTCTGGACTTTGA--------------------ATCC-----------AGCGA-------CCTGGGTTCGACTCCCGGTGGGACCTCCA Ppersica_tR5 GTGGCTGTAGTTTAG--T--GGTGAGAATTTCACGTTGTGG----------------------CC---------GTGAAGA-------CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Ppersica_tR45 GTGGCTGTAGTTTAG--T--GGTAAGAATTCTACGTTGTGG----------------------CC---------GTAGAGA-------CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Ppersica_tR56 GTGGCTGTAGTTTAG--T--GGTAAGAATTCCACGTTGTGG----------------------CC---------GTGGAGA-------CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Ppersica_tR13 GCACCAGTGGTCTAG-----TGGTAGAATAGTACCCTGCCA----------------------CG---------GTACAGA-------CCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCACCA Ppersica_tR146 GCGCATCTGGTGTAG-----TGGTATCATAGTACCCTCCCA----------------------CG---------GTACTGA-------CCAGGGTTCGATTCCCTGGATGCGCACCA Ppersica_tR120 GCGTCAGTAGTCCAA--C--GGTTAGGATAATTGCCTTCCA--------------------AGCA-----------ATAGA-------CCCGGGTTCGACTCCCGGCTGACGCACCA Ppersica_tR77 GCGTTTGTAGTCCAA--C--GGTTAGGATAATTGCCTTCCA--------------------AGCA-----------ATAGA-------TCCGGGTTCGACTCCCGGCAGACGCACCA Ppersica_tR81 GCGTTTGTAGTCCAA--C--GGTTAGGATAATTGCCTTCCA--------------------AGCA-----------ATAGA-------CCCGGGTTCGACTCCCGGCAAACGCACCA Ppersica_tR108 GCGTTTGTAGTCCAA--C--GGTTAGGATAATTGCCTTCCA--------------------AGCA-----------ATAGA-------CCCGGGTTCGACTCCCGGCAGACGCACCA Ppersica_tR124 GTCGTTGTAGTATAG--T--GGTAAGTATTCCCGCCTGTCA--------------------CGCG-----------GGTGA-------CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Ppersica_tR149 GTCGTTGTAGTATAG--T--GGTAAGTATTTCCGCCTGTCA--------------------CGCG-----------GACGA-------CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Ppersica_tR71 TCCGTTGTAGTCTAG-TT--GGTCAGGATACTCGGCTCTCA--------------------CCCG-----------AGAGA-------CCCGGGTTCAAGTCCCGGCAACGGAACCA Ppersica_tR89 TCCGTTGTAGTCTAG-TT--GGTCAGGATATTCGGCTCTCA--------------------CCCG-----------AAAGA-------CCCGGGTTCAAGTCCCGGCAACGGAACCA Ppersica_tR112 TCCATTGTCGTCTAG-TCCGGTTTAGGATACCTGGCTTTCA--------------------CCCA-----------GGCGA-------CCCGGGTTCAAATCCCGGCAATGGAACCA Ppersica_tR3 TCCATTGTCGTCCAG--C--GGTTAGGATATCTGGCTTTCA--------------------CCCA-----------GGAGA-------CCCGGGTTCGATTCCCGGCAATGGAACCA Ppersica_tR85 TCCGTTGTCGTCCAG--C--GGTTAGGATATCTGGCTTTCA--------------------CCCA-----------GGAGA-------CCCGGGTTCGATTCCCGGCAACGGAACCA
X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y