O.sativa tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Osativa_tR52 TGGGGCGTGGCCAAG--TGG--TAAGGCAGCGGGTTT--T-----------------GG--------------TCCC---------G-TTACTCGG-------AGGTTCGAATCCTTCCGTCCCAGCCA Osativa_tR70 GACGCTTTGGCCGAG--TGGT-TAAGGCGTGTGCCTG--C-----------------TA--------------AGTA--------CATGGGGTCTCCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGTCGCCA Osativa_tR190 GACGCTTTGGCCGAG--TGGT-TAAGGCGTGTGCCTG--C-----------------TAAGTACATGGGGTTTCCCC---------G------CGA-------GAGTTCGAATCTCTCAGGCGTCGCCA Osativa_tR101 GTCGATATGTCCGAG--TGGT-TAAGGAGGTAGACTC--G-----------------AA--------------ATCTACTGGGCTCT-GCCCGCGC-------AGGTTCGAATCCTGCTGTCGACGCCA Osativa_tR176 GTCGATATGTCCGAG--TGGT-TAAGGAGGTAGACTC--G-----------------AA--------------ATCTACTGGGCTTT-GCCTGCGC-------AGGTTCGAATCCTGCTGTCGACGCCA Osativa_tR54 GTCGATATGTCCGAG--TGGT-TAAGGAGACAGACTC--G-----------------AA--------------ATCTGTTGGGCTTT-GCCTGCGC-------AGGTTCGAATCCTGCTGTCGACGCCA Osativa_tR30 GTCGATATGTCCGAG--TGGT-TAAGGAGACAGACTT--G-----------------AA--------------ATCTGTTGGGCTTC-GCCCGCGC-------AGGTTCGAACCCTGCTGTCGACGCCA Osativa_tR204 GTCGATATGTCCGAG--TAGT-TAAGGAGACAGACTT--G-----------------AA--------------ATCTGTTGGGCTAC-GCCCGCGC-------AGGTTCGAACCCTGCTGTCGACGCCA Osativa_tR80 GTCGATATGTCCGAG--TGGT-TAAGGAGACAGACTT--G-----------------AA--------------ATCTGTTGGGCTAC-GCCCGCGC-------AGGTTCGAACCCTGCTGTCGACGCCA Osativa_tR209 GTGGACGTGCCAGAG--TGGT-TATTGGGCATGACTA--G-----------------AA--------------ATCATGTGGGCTCT-GCCCGCGT-------AGGTTCGAATCCTGCCATCCACGCCA Osativa_tR63 GTGGTCGTGCCGGAG--TGGT-TATCGGGCATGACTA--G-----------------AA--------------ATCATGTGGGCTCT-GCCCGCGC-------AGGTTCGAATCCTGCCGACCACGCCA Osativa_tR162 GTGGTCGTGCCGGAG--TGGT-TATCGGGCATGACTA--G-----------------AA--------------ATCATGTGGGCTTT-GCCCGCGC-------AGGTTCGAATCCTGCCGACCACGCCA Osativa_tR36 GCTGGTTTGCCCGAG--TGGT-TAAGGGGGAAGACTT--A-----------------AG--------------ATCTTCTGCACATGAGTGCGCGT-------GGGTTCGAACCCCACAGCCAGCACCA Osativa_tR37 GCTGGTTTGCCCGAG--TGGT-TAAGGGGGAAGACTT--A-----------------AG--------------ATCTTCTGCACTGAAGTGCGCGT-------GGGTTCGAACCCCACAGCCAGCACCA Osativa_tR126 GCTGGTTTGCCCGAG--TGGT-TAAGGGGGAAGACTT--A-----------------AG--------------ATCTTCTGCACAGAAGTGCGCGT-------GGGTTCGAACCCCACAGCCAGCACCA Osativa_tR78 GACGGTTTGGCCGAG--TGGTCTAAGGCGCCAGATTT--------------AGGCTCTG--------------GTCC---------GAATGGGCGT-------GGGTTCAAATCCCACAGCTGTCACCA Osativa_tR127 GACAGTTTGGCCGAG--TGGTCTAAGGCGCCAGATTT--------------AGGCTCTG--------------GTCC---------GTAAGGGCGT-------GGGTTCAAATCCCACAGCTGTCACCA Osativa_tR180 GACAGTTTGGCCGAG--TGGTCTAAGGCGCCAGATTT--------------AGGCTCTG--------------GTCC---------GAAAGGGCGT-------GGGTTCAAATCCCACAGCTGTCACCA Osativa_tR29 GTCAGGATGGCCGAG--TGGTCTAAGGCGCCAGACTC--A-----------------AG--------------TTCTGGTCCTCTAACGAGGGCGT-------GGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Osativa_tR200 GTCAAGATGGCCGAG-TTGGTCTAAGGCGCCAGTTTC--A----------GGTACTGGT--------------CCGA-----------AAGGGCAT-------GGGTTCGAATCCCATTCTTGACACCA Osativa_tR17 GTTGAGATGGCCGAG-TTGGTCTAAGGCGCCAGATTA--------------AGGTTCTG--------------GTCC---------GAAAGGGCGT-------GGGTTCAAATCCCACTCTTAACACCA Osativa_tR28 GTTGAGATGGCCGAG-TTGGTCCAAGGCGCCAGATTA--------------AGGTTCTG--------------GTCC---------GAAAGGGCGT-------GGGTTCAAATCCCACTCTTAACACCA Osativa_tR1 GTTGAGATGGCCGAG-TTGGTCTAAGGCGCCAGATTA--------------AGGTTCTA--------------GTCC---------GAAAGGGCGT-------GGGTTCAAATCCCACTCTCAACACCA Osativa_tR207 GTTGAGATGGCCGAG-TTGGTCTAAGGCGCCAGATTA--------------AGGTTCTG--------------GTCC---------GAAAGGGCGT-------GGATTCAAATCCCACTCTCAACACCA Osativa_tR94 GTTGAGATGGCCGAG-TTGGTCTAAGGCGCCAGATTA--------------AGGTTCTG--------------GTCC---------GAAAGGGCGT-------GGGTTCAAATCCCACTCTCAACACCA Osativa_tR187 ATCAGAGTGGCGCAG--CGG--AAGCGTGGTGGGCCC--A-----------------TA--------------ACCC---------A-CAGGTCCC-------AGGATCAAAACCTGGCTCTGATACCA Osativa_tR202 ATCAGAGTGGCGCAG--CGG--AAGCGTGGTGGGCCC--A-----------------TA--------------ACCC---------A-CAGGTCCC-------AGGATCGAAACCTGGCTCTGATACCA Osativa_tR26 GCATCCATGGCTGAA--TGGT-TAAAGCGCCCAACTC--A-----------------TA--------------ATTG---------GTAAATTTGC-------AGGTTCAATTCCTGCTGGATGCACCA Osativa_tR43 GCCCTTTTAACTCAG--TGG--TAGAGTAATGCCATG--G-----------------TA-------------AGGCA-----------TAAGTCAT-------CGGTTCAAATCCGATAAAGGGCTCCA Osativa_tR21 GCCCACTTAGCTCAG--AGGT-TAGAGCATCACATTT--G-----------------TA-------------ATGCG-----------AGGGTCAT-------CGGTTCAAATCCGATAGTCGGCTCCA Osativa_tR184 GCCCACTTAGCTCAG--AGGT-TAGAGCATCGCATTT--G-----------------TA-------------ATGCG-----------AGGGTCAT-------CGGTTCAAATCCAATAGTCGGCTCCA Osativa_tR188 GCCCACTTAGCTCAG--AGGT-TAGAGCATCGCATTT--G-----------------TA-------------ATGCG-----------AGGGTCAT-------CGGTTCAAATCCGATAGTCGGCTCCA Osativa_tR69 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Osativa_tR151 GGTTTCGTGGTGTAG-TTGGT-TATCACGTCAATCTA--A-----------------CA--------------CACT---------G-AAGGTCTC-------CGGTTCGAGTCCGGGCAAAGCCACCA Osativa_tR56 GGTTTTGTGGTGTAG-TTGGT-TATCACGTCAGTCTA--A-----------------CA--------------CACT---------G-AAGGTCTC-------CGGTTCGAGTCCGGGCGAAGCCACCA Osativa_tR81 GGTTTCGTGGTGTAG-TTGGT-TATCACGTCAGTCTA--A-----------------CA--------------CACT---------G-AAGGTCTC-------CGGTTCGAGTCCGGGCGAAGCCACCA Osativa_tR130 GCGTCCATTGTCTAA--TGGA-TAGGACAGAGGTCTT--C-----------------TA--------------AACC-----------TTTGGTAT-------AGGTTCAAATCCTATTGGACGCACCA Osativa_tR89 GGGGATTTAGTCTAG--TGG--TAAGATATTCGCTTA--G-----------------GG--------------AGCG---------A-AAGGTCCC-------GAGTTCAATTCTCGGAATCCCCACCA Osativa_tR19 GGGTGTTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTC--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCGG-------GAGTTCGATTCTCCCAACACCCCCCA Osativa_tR40 GGGTGTTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTC--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAAGTCGC-------GAGTTCGATTCTCGCAACACCCCCCA Osativa_tR79 GGGTGTTTGGTGTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTC--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCGC-------GAGTTCGATTCTCGCAACACCCCCCA Osativa_tR173 GGGTGTTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTC--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCGT-------GAGTTCGATTCTCGCAACACCCCCCA Osativa_tR4 GGGTGTTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTC--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCGC-------GAGTTCGATTCTCGCAACACCCCCCA Osativa_tR2 GGGCGTTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTT--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCGC-------GAGTTCGATTCTCGCAACGCCCCCCA Osativa_tR16 GGGCGTTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTT--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCCC-------GAGTTCGATTCTCGGAACGCCCCCCA Osativa_tR193 GGGCATTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTA--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCCC-------GAGTTCAATTCTCGGAGTACCCCCCA Osativa_tR170 GGGCATTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTT--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCCC-------GAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Osativa_tR116 GGGCATTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTT--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCCC-------GAGTTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Osativa_tR143 GGGCATTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTA--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCCC-------GAATTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Osativa_tR121 GGGCATTTGGTCTAG--TGG--TATGATTCTCGCTTA--G-----------------GG--------------TGCG---------A-GAGGTCCC-------GAGTTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Osativa_tR92 AGGGATGTAGCGCAG-CTTGG-TAGCGCGTTTGTTTT--G-----------------GG--------------TACA---------A-AATGTCAC-------AGGTTCAAATCCTGTCATCCCTACCA Osativa_tR136 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGC-TAGCGCGTAGGTCTC--A-----------------TAGCTAAACGTGAGTAATCC---------T-GAGGTCGA-------GAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Osativa_tR161 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGC-TAGCGCGTAGGTCTC--ATAGCTAAA--ACGTGAGTA--------------ATCC---------T-GAGGTCGA-------GAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Osativa_tR38 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGC-TAGCGCGTAGGTCTC--A-----------------TAGCTAAAGCGAGTGATCCT-----------GAGGTCGA-------GAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Osativa_tR51 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGC-TAGCGCGTAGGTCTC--ATAGCTAAAATAAGCGAGTG--------------ATCC---------T-GAGGTCGA-------GAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Osativa_tR44 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGC-TAGCGCGTAGGTCTC--ATAGCTAATA-TTGTGAGTG--------------ATCC---------T-GAGGTCGA-------GAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Osativa_tR205 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGC-TAGCGCGTAGGTCTC--ATAGCTAATG-TTGTGAGTG--------------ATCC---------T-GAGGTCGA-------GAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Osativa_tR61 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGC-TAGCGCGTAGGTCTC--A-----------------TA---GCTATTGAGTTATCC---------T-GAGGTCGA-------GAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Osativa_tR186 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGC-TAGCGCGTAGGTCTC--ATAGCTATT-----TGAGTT--------------ATCC---------T-GAGGTCGA-------GAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA 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Osativa_tR172 GCCCGTCTAGCTCAG-TCGG--TAGAGCGCAAGGCTC--T-----------------TA--------------ACCT---------T-GTGGTCGT-------GGGTTCGAGCCCCACGGTGGGCGCCA Osativa_tR192 GCCCGTCTAGCTCAG-TCGG--TAGAGCGCAAGGCTC--T-----------------TA--------------ACCT-------------GGTCGT-------GGGTTCGAGCCCCACGGTGGGCGCCA Osativa_tR135 GCCCGTCTAGCTCAG-TCGG--TAGAGCGCAAGGCTC--T-----------------TA--------------ACCT---------T-GTGGTTGT-------GGGTTCAAGCCCCACGGTGGGCGCCA Osativa_tR194 GCCCGTCTAGCTCAG-TCGG--TAGAGCGCAAGGCTC--T-----------------TA--------------ACCT---------T-GTGGTCGT-------GGGTTCAAGCCCCACGGTGGGCGCCA Osativa_tR147 GCCGTCTTAGCTCAG-CCGG--TAGAGCGCATGGCTT--T-----------------TA--------------ACCA---------T-GTGGTCGT-------GGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Osativa_tR163 GCCGTCCTAGCTCAG-TCGG--TAGAGCGCACGGCTT--T-----------------TA--------------ACCG---------T-GTGGTCGT-------GGGTTCGAATCCCACGGACGGCGCCA Osativa_tR83 GCCGACCTAGCTCAG--TGG--TAGAGCGCGTGGCTT--T-----------------TA--------------ACCA---------C-GTGGTCGT-------GGGTTCGATCCCCACGGTCGGCGCCA Osativa_tR118 GCCGTCCTAGCTCAG--TGG--TAGAGCGCGTGGCTT--T-----------------TA--------------ACCA---------C-GTGGTCGT-------GGGTTCGATCCCCACGGACGGCGCCA Osativa_tR114 GGATCCGTGGCGCAA--TGG--TAGCGCGTCTGACTC--C-----------------AG--------------ATCA---------G-AAGGTTGC-------GTGTTCGATTCATGTCGGGTTCACCA Osativa_tR208 GGATCCGTGGCGCAA--TGG--TAGCGCGTCTGACTC--C-----------------AG--------------ATCA---------G-AAGGTTGC-------GTGTTCGATTCACGTCGGTTTCACCA Osativa_tR167 GGATCCGTGGCGCAA--TGG--TAGCGCGTCTGACTC--C-----------------AG--------------ATCA---------G-AAGGTTGC-------GTGTTCGATTCACGTCGGGTTCACCA Osativa_tR45 GACCGCATAGCGCAG-TGGAT-TAGCGCGTCTGACTT--C-----------------GG--------------ATCA---------G-AAAGTCGT-------GGGTTCGACTCCCACTGTGGTCGCCA Osativa_tR201 GACCGCATAGCGCAG-TGGAT-TAGCGCGTCTGACTT--C-----------------GG--------------ATCA---------G-AAGGTCGT-------GGGTTCGACTCCCACTGTGGTCGCCA Osativa_tR60 GATCATATAGCGAAG--TGGA-TATCGCGTTAGATTC--C-----------------GA--------------ATCT---------A-AAAGTCGT-------GGGTTCGAATCCCACTATGATCGCCA Osativa_tR164 GGTCGCATAGCGAAG--TGGA-TATCGCGTTAGATTC--C-----------------GA--------------ATCT---------A-AAAGTCGT-------GGGTTCGAATCCCACTGCGATCACCA Osativa_tR139 GCGCCTGTAGCTCAG--TGGA-TAGAGCGTTTGTTTC--C-----------------TA--------------AACA---------A-AAAGTCGA-------AGGTTCGAACCCTTCCTGGCGCGCCA Osativa_tR171 GCGCCTGTAGCTCAG--TGGA-TAGAGCGTCTGTTTC--C-----------------TA--------------AGCA---------G-AAGGTCGT-------AGGTTCGACCCCTACCTGGCGCGCCA Osativa_tR191 GCGCCTGTAGCTCAG--TGGA-TAGAGCGTCTGTTTC--C-----------------TA--------------AGCA---------G-AAGGCCGT-------AGGTTCGACCCCTACCTGGCGCGCCA Osativa_tR115 GCGCCTGTGGCCTAA--TGGA-TAAGGCGTCTGACTT--C-----------------TA--------------ATCA---------G-ACGATTGT-------GGGTTCGAGTCCCACCAGGCGTGCCA Osativa_tR11 GCGCCCATGGCCTAA--TGGA-TAAGGCGTCTGACTT--C-----------------TA--------------ATCA---------G-GCGATTGT-------GGGTTCGAGTCCCACTGGGCGTGCCA Osativa_tR146 GCGCCCGTGGCCTAA--TGGA-TAAGGCGTCTGACTT--C-----------------TA--------------ATCA---------G-GCGATTGT-------GGGTTCGAGTCCCACCGGGCGTGCCA Osativa_tR9 GATTCCATGGCCCAA--TGGA-TAAGGCGCTGGTCTA--C-----------------GG--------------AACC---------A-GAGATTCT-------GGGTTCGATCCCCAGTGGAATCGCCA Osativa_tR181 GACTCCGTGGCCCAA--TGGA-TAAGGCGCTGGTCTA--C-----------------GG--------------AACC---------A-GAGATTCT-------GGGTTCGATCCCCAGCGGAGTCGCCA Osativa_tR107 GACTCCATGGCCCAA--TGGA-TAAGGCGCTGGTCTA------------------CGGA--------------ACCA-----------GAGATTCT-------GGGTTCGATCCCCAGTGGAGTCGCCA Osativa_tR133 GGTCGCGTGGCCTAA--TGGA-TAAGGCGCTCGCCTC--C-----------------GG--------------AGCG---------G-GAGATTGT-------GGGTTCGAGTCCCACCGTGATCGCCA Osativa_tR199 GACCGCGTGGCCTAA--TGGA-TAAGGCGCTCGCCTC--C-----------------GG--------------AGCG---------G-GAGATTGT-------GGGTTCGAGTCCCATCGTGGTCGCCA Osativa_tR35 GGGGACGTAGCTCAT-ATGG--TAGAGCGCTCGCTTC--G-----------------CA--------------TGCG-----------AGAGGCAC------GGGGTTCGATTCCCCGCGTCTCCACCA Osativa_tR53 GGGGGTGTAGCTCAT-ATGG--TAGAGCGCTCGCTTC--G-----------------CA--------------TGCG-----------AGAGGCAC------GGGGTTCGATTCCCCGCACCTCCACCA Osativa_tR158 GGGGATGTAGCTCAA-ATGG--TAGAGCGCTCGCTTT--G-----------------CA--------------TGCG-----------AGAGGCAC------GGGGTTCGATCCCCCGCATCTCCACCA Osativa_tR123 GGGGGTGTAGCTCAG-ATGG--TAGAGCGCTCGCTTA--G-----------------CA--------------TGCG---------A-GAGGTACG-------GGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Osativa_tR49 GGGGATGTAGCTCAG-ATGG--TAGAGCGCTCGCTTA--G-----------------CA--------------TGCG---------A-GAAGTACG-------GGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Osativa_tR22 GGGGATGTAGCTCAG-ATGG--TAGAGCGCTCGCTTA--G-----------------CA--------------TGCG---------A-GAGGTACG-------GGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Osativa_tR34 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Osativa_tR149 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG--TAGAGCGGAGGACTG--------------------TAGTATGTGCAGATTAATCC---------T-TAGGTCGC-------TGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Osativa_tR169 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG--TAGAGCGGAGGACTG--------------------TAGTGTTTGCAGATAAATCC---------T-TAGGTCGC-------TGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Osativa_tR152 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG--TAGAGCGGAGGACTG--T-----------------AG--TGTTGCAGATTAATCC---------T-TAGGTCGC-------TGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Osativa_tR104 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG--TAGAGCGGAGGACTG--------------------TAGTTGTTGCAGGT-AATCC---------T-TAGGTCGC-------TGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Osativa_tR33 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG--TAGAGCGGAGGACTG--------------------TAGTAGTTGCAGATGAATCC---------T-TAGGTCGC-------TGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Osativa_tR138 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG--TAGAGCGGAGGACTG--------------------TAGTCGTTGCAGATTAATCC---------T-TAGGTCGC-------TGGTTCAAATCCGGCAGGTCGGACCA Osativa_tR58 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Osativa_tR102 TCCATTGTCGTCTAGTCCGGT-TAGGATACCTGGCTT--T-----------------CA--------------CCCA-----------GGCGACCC-------GGGTTCAAATCCCGGCAATGGAACCA
X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y