M.esculenta tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Mesculenta_tR49 GGGCGTTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTCG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCGCGAGTTCGATTCTCGCAACGCCCCCCA Mesculenta_tR130 GGGTGTTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTCG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCGCGAGTTCGATTCTCGCAACACCCCCCA Mesculenta_tR247 GGGTGTTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTCG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCGTGAGTTCGATTCTCGCAACACCCCCCA Mesculenta_tR7 GGGCGTTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTTG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCCCGAGTTCGATTCTCGGAACGCCCCCCA Mesculenta_tR172 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTTG--GG----------------------TGC----------GAAAGG----------TCTCGAGTTCGATTCTCGAAATGCCCCCCA Mesculenta_tR203 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTTG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Mesculenta_tR89 GGGCATTTGGTCTAGTGG---CATGATTC------TCGCTTAG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Mesculenta_tR207 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTAG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Mesculenta_tR2 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTTG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCTCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Mesculenta_tR237 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTTG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCCCGAGTTCGATTCTCGGAAGGCCCCCCA Mesculenta_tR97 GGGCATTTGGTCTAGTGG---TATGATTC------TCGCTTTG--GG----------------------TGC----------GAGAGG----------TCCCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Mesculenta_tR165 GGGGAAATAGCTCAGTCGGT-TAGAGTGC------TGGTCTGT--CA----------------------CGC----------CAGAAG----------TAGCGGGTTCGAACCCTGTTTTCCCCGCCA Mesculenta_tR39 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGC------TCGCTTAG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACGGGGATCGATGCCCTGCATCTCCACCA Mesculenta_tR30 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGC------TCGCTTAG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACGGGGATCGATACCCCGCATTTCCACCA Mesculenta_tR159 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGC------TCGCTTAG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACGGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR170 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGC------TCGCTTAG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACGGGGATCGATACCCCGCTTCTCCACCA Mesculenta_tR206 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGC------TCGCTTAG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACGGGGATCGATTCCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR231 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGC------TCGCTTAG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACAGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR233 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGC------TCGCTTAG--CA----------------------TGT----------GAGAGG----------TACGGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR143 GGGGATGTAGCTCAGATGG--TAGAGCGC------TCGCTTAG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACGGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR18 GGGGACGTAGCTCATATGG--TAGAGCGC------TCGCTTCG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATTCCCCGCGTCTCCACCA Mesculenta_tR26 GGGGGTGTAGCTCATATGG--TAGAGCGC------TCGCTTCG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATTCCCCGCACCTCCACCA Mesculenta_tR146 GGGGGTGTAGCTCATATGG--TAGAGCGC------TCGCTTCG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATCCCCCGCACCTCCACCA Mesculenta_tR119 GGGGGTGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATTCCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR135 GGGGATGTAGCTCACATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACGGGGTTCGATCCCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR178 GAGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATCCCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR261 GGGGATGTAGCTCAACTGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATCCCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR88 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATCCCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR211 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACGGGGTTCGATACCCCGCGTCTCCACCA Mesculenta_tR13 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACAGGGTTCGATCCCCTGCATCTCCACCA Mesculenta_tR63 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAAG----------TACAGGGTTCGATCCCCTGCATCTCCACCA Mesculenta_tR194 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACAGGGTTCGATCCCCTGCATCTCCACCA Mesculenta_tR169 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGT----------GAGAGG----------TACAGGGTTCGATACCCTGCATCTCCACCA Mesculenta_tR120 GGGGATGTAGCTCAAATGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACAGGGTTCGATACCCTGCATCTCCACCA Mesculenta_tR46 GGGGATGTAGCTCAAACGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACAGGGTTCGATACCCTGCATCTCCACCA Mesculenta_tR200 GGGGATGTAGCTCAAACGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------CACGGGGTTCGATACCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR249 GGGGATGTAGCTCAAACGG--TAGAGCGC------TCGCTTTG--CA----------------------TGC----------GAGAGG----------TACAGGGTTCGATACCCCGCATCTCCACCA Mesculenta_tR267 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Mesculenta_tR180 GTGGCTGTAGTTTAGTGGT--AAGAATTC------CACGTTGT--GG----------------------CCG----------TGGAGA-----------CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Mesculenta_tR59 GTGGCTGTAGTTTAGTGGT--GAGAATTC------CACGTTGT--GG----------------------CCG----------TGGAGA-----------CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Mesculenta_tR273 ATCAGAGTGGCGCAGCGG---AAGCGTGG------TGGGCCCA--TA----------------------ACC----------CACAGG----------TCCCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATACCA Mesculenta_tR129 ATCAAAGTGGCGCAGCGG---AAGCGTGG------TGGGCCCA--TA----------------------ACC----------CACAGG----------TCCCAGGATCGAAACCTGGCTTTGATACCA Mesculenta_tR44 ATCAAAGTGGCGCAGCGG---AAGCGTGG------TGGGCCCA--TA----------------------ACC----------CACAGG----------TCCCTGGATCGAAACCAGGCTTTGATACCA Mesculenta_tR69 ATCAGAGTGGCGCAGCGG---AAGCGTGG------TGGGCCCA--TA----------------------ACC----------CACAGG----------TCCCTGGATCGAAACCAGGCTCTGATACCA Mesculenta_tR84 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Mesculenta_tR220 GCGCTCTTAGTTCAGTTCGG-TAGAACGT------GGGTCTCT--AA----------------------AAC----------CCAATG----------TCGTAGGTTCAAATCCTACAGAGCGTGCCA Mesculenta_tR14 GTCTGGGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGC------TAGTCTCA--CA----------------------CGC----------TAGAGA----------TCCCGGGTTCAAGCCCGGGCTTAGACACCA Mesculenta_tR112 GTCTGGGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGC------TAGTCTCA--CA----------------------CAC----------TAGAGG----------TCCCCGGTTCGAACCCGGGCTCAGACACCA Mesculenta_tR61 GGTGTCGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGT------CAGTCTAA--CA----------------------CAC----------TGAAGG----------TCTCCGGTTCGAGTCCGCTCGACGCCACCA Mesculenta_tR73 GGTGTCGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGT------CAGTCTAA--CA----------------------CAC----------TCAAGG----------TCTCCGGTTCGAGTCCGGGCGACGCCACCA Mesculenta_tR215 GGTGTCGTGGTGTAGTTGGT-TATCACGT------CAGTCTAA--CA----------------------CAC----------TGAAGG----------TCTCCGGTTCGAGTCCGGGCGACGCCACCA Mesculenta_tR78 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GCCGTCTTAGCTCAGCTGG--TAGAGCGC------GTGGCTTT--TA----------------------ACC----------ACGTGG----------TCGTGGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Mesculenta_tR161 GCCGTCTTAGCTCAGCCGG--TAGAGCGC------GTGGCTTT--TA----------------------ACC----------ACGTGG----------TCGTGGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Mesculenta_tR133 GCCGCCTTAGCTCAGCTGG--TAGAGCGC------ATGGCTTT--TA----------------------ACC----------ATGTGG----------TCGTGGGTTCGATTCCCACAGGCGGCGCCA Mesculenta_tR140 GCCTTCTTAGCTCAGCTGG--TAGAGCGC------ATGGCTTT--TA----------------------ACC----------ATGTGG----------TCGTGGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Mesculenta_tR222 GCCGTCTTAGCTCAGCCGG--TAGAGCGC------ATGGCTTT--TA----------------------ACC----------ATGTGG----------TCGTGGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Mesculenta_tR205 GCCGTCTTAGCTCAGCTGG--TAGAGCGC------ATGGCTTT--TA----------------------ACC----------ATGTGG----------TCGTGGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Mesculenta_tR145 GGATCCGTGGCGCAATGG---TAGCGCGT------CTGACTCC--AG----------------------ATC----------AGAAGG----------TTGCGTGCTCGATTCACGTCGGGTTCACCA Mesculenta_tR230 GGATCCGTGGCGCAATGG---TAGCGCGT------CTGACTCC--AG----------------------ATC----------AGAAGG----------TTGCGTGTTCGATTCTCGTCGGGTTCACCA Mesculenta_tR242 GGATCCGTGGCGCAATGG---TAGCGCGT------CTGACTCC--AG----------------------ATC----------AGAAGG----------TTGCGTGTTCGATTCACGTCGGGTTCACCA Mesculenta_tR55 GATCGCATAGCGGAGTGGA--TATCGCGT------TAGACTCC--GG----------------------ATC----------TAAAGG----------TCGTGGGTTCGAATCCCACTGCGATCGCCA Mesculenta_tR128 GACCGCATAGCGCAGTGGAT-TAGCGCGT------CTGACTTC--GG----------------------ATC----------AGAAGG----------TCGTGGGTTCGACTCCCACTGTGGTCGCCA Mesculenta_tR184 GACCGCATAGCGCAGTGGAT-TAGCGCGT------TTGACTTC--GG----------------------ATC----------AAAAGG----------TCGTGGGTTCGACTCCCACTGTGGTCGCCA Mesculenta_tR221 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X: m1G
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X: m3C
X: m2G/m22G
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