M.domestica tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Mdomestica_tR73 GTGGCTGTAGTTTAG--TGGTAAGAATTCCACGTTG----------TGG------------CCG---TGGAG---------ACCTGGGCTC-GAATCCCAGCAGCCACACCA Mdomestica_tR134 GTGGCTGTAGTTTAG--TRGTAAGAATTCCACGTTG----------TGG------------CCG---TGGAG---------ACCTGGGCTC-GAATCCCAGCAGCCACACCA Mdomestica_tR40 GCGCATCTGGTGTAG--TGG-TATCATAGTACCCTC----------CCA--------------CGGTACTGA----------CCAGRGTTC-GATTCCCTGGATGCGCACCA Mdomestica_tR211 GCGCATCTGGTGTAG--TGG-TATCATAGTACCCTC----------CCA------------CGG---TACTG---------ACCAGGGTTC-GATTCCCTGGATGCGCACCA Mdomestica_tR16 GCACCAGTGGTCTAG--TGG-TAGAATAGTACCCTG----------CCA--------------CGGTACAGA----------CCCGGGTTC-GATTCCCCGCTGGTGCACCA Mdomestica_tR32 GCACCAGTGGTCTAG--TGG-TAGAATAGTACCCTG----------CCA--------------CAGTACAGA----------CCCGGGTTC-GATTCCCGGCTGGTGCACCA Mdomestica_tR111 GCACCAGTGGTCTAG--TGG-TAGAATAGTACCCTG----------CCA--------------CGGTACAGA----------CCCGYGTTC-GATTCCCGGCTGGTGCACCA Mdomestica_tR18 GCACCAGTGGTCTAG--TGG-TAGAATAGTACCCTG----------CCA------------CGG---TACAG---------ACCCGGGTTC-GATTCCCGGCTGGTGCACCA Mdomestica_tR117 GCATCAGTGGTCTAG--TGG-TAGAATAGTACTCTG----------CCA--------------CGGTACAGA----------CCCGGGTTC-GATTTCCGGCTGATGCACCA Mdomestica_tR203 GCATCAGTGGTCTAG--TGG-TAGAATAGTACCCTG----------CCA--------------CGGTACAGA----------CCCGGGTTC-GATTCCCGGCTGATGCACCA Mdomestica_tR46 GTCGTTGTAGTATAG--TGGTAAGTATTCCCGCCTG----------TCA------------CGC--GGGTGA----------CCCGGGTTC-GATCCCCGGCCATGGCGCCA Mdomestica_tR193 GTCGTTGTAGTATAG--MGGTAAGTATTCCCGCCTG----------TCA------------CCC--GGGTGA----------CCCGGGTTC-GATCCCCGGCAACGGCGCCA Mdomestica_tR129 GTCGTTGTAGTATAG--TGGTAAGTATTCCCGCCTG----------TCA------------CSC--GGGTGA----------CCCGGGTTC-GATCCCCGGCAACGGCGCCA Mdomestica_tR179 GTCGTTGTAGTATAG--TGGTAAGTATTCCCGCCTG----------TCA------------CGC--GGGTGA----------CCCGGGTTC-GATCCCCGGCAACGGCGCCA Mdomestica_tR123 GCGTTTGTAGTCCAA--CGGTTAGGATAATTGCCTT----------CCA------------AGC--AATAGA----------CCCGGGTTC-GACCCGCGGCAAACGCACCA Mdomestica_tR15 GCGTTTGTAGTCCAA--CGGTTAGGATAATTGCCTT----------CCA------------AGC--AATAGA----------CCCGGGTTC-YACTCCCGGCAAACGCACCA Mdomestica_tR72 GCGTTTGTAGTCCAA--CGGTTAGGATAATTGCCTT----------CCA------------AGC--AATAGA----------CCCGGGTTC-RACTCCCGGCAAACGCACCA Mdomestica_tR113 GCGTTTGTAGTCCAA--CGGTTAGGATAATTGCCTT----------CCA------------AGC--AATAGA----------CCCGGGTTC-GACTCCCGGCAAACGCACCA Mdomestica_tR42 TCCGTTGTAGTCTAG-TTGGTCAGGATACTCGGCTC----------TCA------------ACC--GAGAGA----------CCTGGGTTC-AAGTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR102 TCCGTTGTAGTCTAG-TTGGTCAGGATACTCGGCTC----------TCA------------CCC--GAGAGA----------CCCGGGTTC-AAGTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR143 TCCGTTGTAGTCTAG-TTGGTCAGGATATTCGGCTC----------TCA------------CCC--YAAAGA----------CKCGGGTTC-AAGTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR225 TCCGTTGTAGTCTAG-TTGGTCAGGATATTCGGCTC----------TCA------------CCC--GAAAGA----------CCCGGGTTC-AAATCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR5 TCCGTTGTAGTCTAG-TTGGTCAGGATATTCGGCTC----------TCA------------CCC--GAAAGA----------CCCGGGTTC-AATTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR125 TCCGTTGTAGTCTRG-TTGGTCAGGATATTCGGCTC----------TCA------------CCC--GAAAGA----------CCCGGGTTC-AAGTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR136 TCCGTTGTAGTCTAG-TTGGTCAGGATATTCGGCTC----------TCA------------CCC--AAAAGA----------CCCGGGTTC-AAGTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR185 TCCGTTGTAGTCTAG-TTGGTTAGGATATTCGGCTC----------TCA------------CCC--GAAAGA----------CCCGGGTTC-AAGTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR126 TCCGTTGTAGTCTAG-TTGGTCAGGATATTCGGCTC----------TCA------------CCC--GAAAGA----------CCCGGGTTC-AAGTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR206 TCCGYTGTCGTCCAG--CGGTTAGGATATSTGGCYT----------TCA------------CCC--AGGAGA----------CCCGGGTTC-GATTCCCGGCAACGGWACCA Mdomestica_tR4 TCCATTGTCGTCCAG--CGGTTAGGATATCTGGCTT----------TCA------------CCC--AGGAGA----------CCCGGGTTC-GATTCCCGGCAATGGAACCA Mdomestica_tR71 TCCGTTGTCGTCCAG--CGGTTAGGATATCTGGCTT----------TCA------------CCC--AGGAGA----------CCCGGGTTY-GATTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR121 TCCGTTGTCGTCCAG--CGGTTAGGATATCTGGCTT----------TCA------------CCC--AGGAGA----------CCCGGGTTC-GATTCCCGGCAACGGAACCA Mdomestica_tR38 TCCGTTGTTGTCTAG--CGGTTAGGATATCTGGCTT----------TCA------------CCC--AGGAGA----------CCCGGGTTC-GATTCCCGGCAACAGAACCA Mdomestica_tR82 TCCRTTGTTGTCTAG--CGGTTAGGATATCTGGCTT----------TCA------------CCC--AGGAGA----------CCCGGGTTY-GATTCCCGGCAACAGAACCA Mdomestica_tR189 ATCAGAGTGGCGCAG--CGG-AAGCGTGGTGGGCCC----------ATA------------ACC--CACAGG---------TCCCAGGATC-GAAACCTGGTTCTGATACCA Mdomestica_tR221 ATCAGAGTGGCGCAG--CGG-AAGCGTGGTGGGCCC----------ATA------------ACC--CACAGG---------TCCCAGGATC-GAAACCTGGCTCTGATACCA Mdomestica_tR14 TTGTAAATAGTGTAG-TCGGTTATCACGCTAGTCTC----------ACA------------CAC--TAGAGG---------TCCCCGGTTC-GAACCCGGGCTCAGACACCA Mdomestica_tR138 GTCTGGGTGGTGTAG-TCGGTTATCACGCTAGTCTC----------ACA------------CAC--TAGAGG---------TCCKCGGTTC-GAACCCGGGCTRAGACACCA Mdomestica_tR86 GTCTGGGTGGTGTAG-TCGGTTATCACGCTAGTCTC----------ACA------------CAC--TAGAGG---------TCCCCGGTTC-GAAMCCGGGCTTAGACACCA Mdomestica_tR124 GTCTGGGTGGTGTAG-TCGGTTATCACGCTAGTCTC----------ACA------------CAC--TAGAGG---------TCCCCGGTTC-GAACCCGGGCTTAGACACCA Mdomestica_tR100 GTCTGGGTGGTGTAG-TCGGTTATCACGCTAGTCTC----------ACA------------CAC--TAGAGG---------TCCCCGGTTC-GAACCCRGGCTCAGACACCA Mdomestica_tR167 GTCTGGGTGGTGTAG-TCGGTTATCACGCTAGTCTC----------ACA------------CAC--TAGAGG---------TCCCCGGTTC-GAACCCGGGCTCAGACACCA Mdomestica_tR28 GGTTTCGTGGTGTAG-RTGGTTATCACGTCAGTCTA----------ACA------------CAC--TGAAGG---------TCTCCGGTTC-GAACCTGGGCGAAGCCACCA Mdomestica_tR54 GGTTTCGTGGTGTAG-TTGGTTATCACGTCAGTRTA----------ACA------------CAC--TGAAGG---------TCTCCGGTTR-GAACCCGGGCGAAGCCACCA Mdomestica_tR110 GGTTTCGTGGTGTAG-TTGGTTATCACGTCAGTCTA----------ACA------------CAC--TGAAGG---------TCTCCGGTTC-GAACCCGGGCGAAGCCACCA Mdomestica_tR218 GGTTTCGTGGTGTAG-TTGGTTATCACGTCAGTCTA----------ACA------------CAC--TGAAGG---------TCTYCGGTTC-GAACCCGGGCGAAGCCACCA Mdomestica_tR122 GTTGCTGTGGTGTAG--TGGTTATCACGTTAGTCTT----------ACA------------CAC--TAAAGG---------TCTCCAGTTC-GATCCTGGGCAGCAACACCA Mdomestica_tR168 GTTGCTGTGGTGTAG--TGGTTATCACGTTAGTCTT----------ACA------------CAC-TAAAAGG---------TCCCCAGTTG-GATCCTGGGCAGCAACACCA Mdomestica_tR27 GTTGCTGTGGTGTAG--TGGTTATCACGTTAGTCTT----------ACA------------CAC--TAAAGG---------TCCCCAGTTC-GATCCTGGGCAGCAACACCA Mdomestica_tR77 GGTGCTGTAGTGTAG--TGGTTATCACGTCAGTTTT----------ACA------------CAC--TGAAGG---------TTCCCAGTTC-GATCCTGGGCAGCATCACCA Mdomestica_tR174 GGTGCTGTGGTGTAG--TGGTTATCACGTCAGTTTT----------ACA------------CAC--TGAAGG---------TCCCCAGTTC-GATCCTGGGCAGCATCACCA Mdomestica_tR75 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGT--GCATGAGGATCCCCTGTGAGAGTTC-GAACCTCTCAGGCGACGCCA Mdomestica_tR207 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGT--GCATGYGGATCCCCRYRGAGAGTTC-GAACCTCTCAGGCGACGCCA Mdomestica_tR223 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGT--GCATGGGGATCCCCRGRGAGAGTTC-GAACCTCTCAGGCGACGCCA Mdomestica_tR106 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGT--GCATGYGGATCCCCRGRGAGAGTTC-GAACCTCTCAGGCGACGCCA Mdomestica_tR69 YTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTYCTTG----------CTA------------AGT--GCATGGGGATCCCCCGCGAGAGTTC-GAACCTCTCAGGCGACGCCA Mdomestica_tR2 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGT--SCATGGGGATCCCCCGCGAGAGTTC-GAACCTCTCAGGCGACGCCA Mdomestica_tR92 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGT--GCATGGGGATCCCCCGCGAGAGTTC-GAACCTCTCAGGCGACGCCA Mdomestica_tR144 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGT--GCATGGGGATCCCCCGCGAGAGTTC-GAACCTCTCARGCGACGCCA Mdomestica_tR161 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGT--GCATGGGGATCCCCCGCGAGAGTTC-GAACCTCTCAYGCGACGCCA Mdomestica_tR147 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGT--GCATGGGGATCCCCCGCGAGAGTTC-GAACCTCTCAAGCGACGCCA Mdomestica_tR60 GTCGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCTTG----------CTA------------AGC--ACATGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTC-GAACCTCTCAGGCGACYCCA Mdomestica_tR37 GACGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCCTG----------CTA------------AGT--ACATGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTC-GAATCTCTCAGSCGTCGCCA Mdomestica_tR98 GACGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCCTG----------CTA------------AGT--ACATGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTC-GAATCTCTCAGGCGACGCCA Mdomestica_tR200 GACGCTTTGGCCGAG--TGGTTAAGGCGTGTGCCTG----------CTA------------AGT--ACATGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTC-GAATCTCTCAGGCGTCGCCA Mdomestica_tR154 GCATCCATGGCTGAA--TGGTTAAAGCGCCCAACTC----------ATA------------ATT---GGCGA-------ATTCGTAGGTTC-AATTCCTACTGGATGCACCA Mdomestica_tR93 GGGGATGTAGCTCAA-ATGG-TAGAGCGCCCGCTTT----------GCA------------TGC--GGGAGG---------TACATGGTTC-GATCCCCTGCATCTCCACCA Mdomestica_tR104 GGGGATGTAGCTCAA-ATGG-TAGAGCGCCCGCTTT----------GCA------------TGC--GGGAGG---------TACAGGGTTC-GATCCCCTGCATCTCCACCA Mdomestica_tR213 GGGGATGTAGCTCAA-ATGG-TAGAGCGCCCGCTTT----------GCA------------TGC--GGGAGG---------TACAMGGTTC-GATCCCCTGCATCTCCACCA Mdomestica_tR88 GGGGATGTAGCTCAC-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTT----------GCA------------TGC--YAGAGG---------TACGGGGTTC-GATACCCCGCATCTCCACCA Mdomestica_tR112 GGGGATGTAGCTCAC-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTT----------GCA------------TGC--RAGAGG---------TACGGGGTTC-GATACCCCGCATCTCCACCA Mdomestica_tR178 GGGGATGTAGCTCAC-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTT----------GCA------------TGC--GAGAGG---------TACGGGGTTC-GATACCCCGCATCTCCACCA Mdomestica_tR61 GGGGATGTAGCTCAG-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTA----------GCA------------TGC--GAGAGG---------TATGGGGATC-GATACCCCACTTCTCCACCA Mdomestica_tR43 GGGGATGTAGCTCAG-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTA----------GCA------------TGC--GAGAGG---------CACGGGGATC-GATACCCCGCATCTCCACCA Mdomestica_tR67 GGGGATGTAGCTCAG-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTA----------GCA------------TGC--GAGAGG---------TACGGGGATC-GATYCCCCGCATCTCCACCA Mdomestica_tR202 GGGGATGTAGCTCAG-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTA----------GCA------------TGC--GAGAGG---------TACGGGGATC-GATRCCCCGCATCTCCACCA Mdomestica_tR24 GGGGATGTAGCTCAG-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTA----------GCA------------TGC--GAGAGG---------TACGGGGATC-GATACCCCGCATCTCCACCA Mdomestica_tR35 GGGGACGTAGCTCAT-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTC----------GCA------------TGC--GAGAGG---------CACGGGGTTC-GATTCCCCGCGTCTCCACCA Mdomestica_tR51 GGGGGTGTAGCTCAT-ATGG-TAGAGCGCTCGCTTC----------GCA------------TGC--GAGAGG---------CACGGGGTTC-GATTCCCCGCACCTCCACCA Mdomestica_tR31 GGGGATTTAGTCCAG--TGG-TAGGATGCTCGCTTA----------GGG------------AGC--GAAAGG---------TCCCAAGTTC-AATTCTCGGAATCCCCACCA Mdomestica_tR215 GGGGATTTAGTCCAG--TGG-TAGGATGCTCGCTTA----------GGG------------AGC--GAAAGG---------TCCCGAGTTC-AATTCTCGGAATCCCCACCA Mdomestica_tR173 GGGTGTTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTC----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCGTGAGTTC-GATTCTCGCAACACCCCCCA Mdomestica_tR8 GGGCGTTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTC----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCGTGAGTTC-GATTCTCGCAACGCCCCCCA Mdomestica_tR9 GGGCGTTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTC----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCGTGAGTTC-GATTCTYGCAACGCCCCCCA Mdomestica_tR59 GGCCGTTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTTGCTTT----------GGG------------TGC--AAGAGG---------TCCCGAGTTC-GATTCTCGGAACGGCCCCCA Mdomestica_tR85 GGGCATTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTA----------GGG------------TGCGAGAGAGG---------TCCCGAGTTC-AATTCTCGGAATGCCCCCCA Mdomestica_tR118 GGGCATTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTA----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCCCGAGTTC-AATTCTCGGAATGCCCCCCA Mdomestica_tR101 MGGCATTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTA----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCCCGAGTTC-AATTCTCGGAATGCCCCCCA Mdomestica_tR164 GGGCATTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTT----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCCCCAGTTC-GATTCTCGGAATGCCCCCCA Mdomestica_tR87 GGGCATTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTT----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCCCSAGTTC-GATTCTCGGAATGCCCCCCA Mdomestica_tR119 GGGYATTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTT----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCCCGAGTTC-GATTCTCGGAATGCCCCCCA Mdomestica_tR128 GGGCATTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTT----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCCCGAGTTC-GATTCTCGGAATGCCCTCCA Mdomestica_tR33 GGGCATTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTT----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCCCGAGTRC-GATTCTCGGAATGCCCCCCA Mdomestica_tR169 GGGCATTTGGTCTAG--TGG-TATGATTCTCGCTTT----------GGG------------TGC--GAGAGG---------TCCCGAGTTC-GATTCTCGGAATGCCCCCCA Mdomestica_tR78 GTGAGCGTGCCGGAG--TGGTTATCGGGCATGACTA----------GAA------------ATC--ATGTGGGCTCTGCCCGCGCAGGTTC-GAATCCTGCCGCTCACGCCA Mdomestica_tR205 GTGAGCGTGCCGGAG--TGGTTATCGGGCATGACTA----------GAA------------ATC--ATGTGGGCTTTGCCCGCGCAGGTTC-GAATCCTGCCGCTCACGCCA Mdomestica_tR127 GTGGACGTGCCGGAG--TGGTTATCGGGCATGACTA----------GAA------------ATC--ATGTGGGCTCTGCCCGCGCAGGTTC-GAATCCTGCCGTCCACGCCA Mdomestica_tR57 GTGGTCGTGCCGGAG--TGGTTATCGGGCATGACTA----------GAA------------ATC--ATGTGGGCTCTGCCCGCGCAGGTTC-GAATCCTGCCGACCACGCCA Mdomestica_tR163 GTGGTCGTGCCGGAG--TGGTTATCGGGCATGACTA----------GAA------------ATC--ATGTGGGCTTTGCCCGCGCAGGTTC-GAATCCTGCCGACCACGCCA Mdomestica_tR7 GTGGTCGTGCCGGAG--TGGTTATCGGGCATGACTA----------GAA------------ATC--ATGTGGGCTTYGCCCGCGCAGGTTC-GAATCCTGCCGACCACGCCA Mdomestica_tR48 GTGGTCGTGCCGGAG--TGGTTATCGGGCATGACTA----------GAA------------ATC--ATGTGGGCTTRGCCCGCGCAGGTTC-GAATCCTGCCGACCACGCCA Mdomestica_tR158 GTGGTCGTGCCGGAG--TGGTTATCGGGCATGACTA----------GAA------------ATC--ATGTGGGCTTCGCCCGCGCAGGTTC-GAATCCTGCCGACCACGCCA Mdomestica_tR53 GTCGATATGTCCGAG--TGGTTAAGGAGACAGACTC----------GAA------------ATC--TGTTGGGCTTTGCCTGCGCAGGTTC-GAATCCTGCTGTCGACGCCA Mdomestica_tR209 GTCGATATGTCCGAG--TGGTTAAGGAGACAGACTC----------GAA------------ATC--TGTTGGGCTTTGCCTGCGCAGGTTC-GAATCCTGCTGTCYACGCCA Mdomestica_tR80 GTCGATATGTCCGAG--TGGTTAAGGAGACAGACTT----------GAA------------ATC--TGTTGGGCTTYGCCCGCGCAGGTTC-GAACCCTGCTGTCGACGCCA Mdomestica_tR83 GTCGATATGTCCGAG--TGGTTAAGGAGACAGACTT----------GAA------------ATC--TGTTGGGCTACGCCCGCGCAGGTTC-GAACCCTGCTGTCGACGCCA Mdomestica_tR30 GTCGATATGTCCGAG--TGGTTAAGGAGACAGACTT----------GAA------------ATC--TGTTGGGCTTCGCCCGCGCAGGTTC-GAACCCTGCTGTCGACGCCA Mdomestica_tR63 GCAGGTTTGCCCGAG--AGGTTAAGGGGGCAGACTTAAGATCTGCTGTA-----------------CATAAG------TACGCGTGGGTTC-GAACCCCACAGCCTGCACCA Mdomestica_tR74 GCAGGTTTGCCCGAG--AGGTTAAGGGGGCAGACTTAAGATCTGCTGTA-----------------CATAAG------TACGCGTGGGTTC-GAACCCCACAGCCTGCWCCA Mdomestica_tR84 GCTGGTTTGCCCGAG--AGGTTAAGGGGGAAGACTTAAGATCTTCTGCA------------CAC--AAGTGC---------GCATGGGTTC-GAACCCCATAGCCAGCACCA Mdomestica_tR120 GCTGGTTTGCCCGAG--AGGTTAAGGGGGAAGACTTAAGATCTTCTGCA------------CAT--AAGTGC---------GCATGGGTTC-GAACCCCATAGCCAGCACCA Mdomestica_tR50 GTCAGGATGGCCGAA-TGGTCTAAGGCGCCAGACTCAAGTTCTGGTCCT------------CTA--ACGAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACTTCTGACACCA Mdomestica_tR141 GTCAGGATGGCCGAG-TGGTCTAAGGCGCCAGACTCAAGTTCTGGTCCT------------TTA--ACGAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACTTCTGACACCA Mdomestica_tR29 GTCAGGATGGCCGAG-TGGTCTAAGGCGCCAGACTCAAGTTCTGGTCCT------------CTA--ACGAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACTTCTGACACCA Mdomestica_tR146 GTCAGGATGGCCGAG-TGGTCTAAGGCGCCAGACTCAAGTTCTGGTCTT------------CGA--GAGAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACTTCTGACACCA Mdomestica_tR183 GTCAGGATGGCCGAG-TGGTCTAAGGCGCCAGACTCAAGTTCTGGTCTT------------CGA--AAGAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACTTCTGACACCA Mdomestica_tR187 GACGGTTTGGCCGAG-TGGTCTAAGGCGCCAGATTTAGGCTCTGGTCCG------------------AAAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACAGCCGTCACCA Mdomestica_tR188 GACAGTTTGGCCGAG-TGGTCTAAGGCGCCAGATTTAGGCTCTGGTCCG------------------AAAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACAGCTGTCACCA Mdomestica_tR3 GTCAAGATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGTTTCAGGTACTGGTCCG------------------AAAGG---------GCATGGGTTC-RAATCCCATTCTTGACACCA Mdomestica_tR157 GTCAAGATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGTTTCAGGTACTGGTCCG------------------AAAGG---------GCATGGGTTC-GAATCCCWTTCTTGACACCA Mdomestica_tR219 GTCAAGATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGTTTCAGGTACTGGTCCG------------------AAAGG---------GCATGGGTTC-GAATCCCATTCTTGACACCA Mdomestica_tR95 GTTGAGATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGGTTCTGGTCCG------------------AAAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACTCTCAACACCA Mdomestica_tR224 GTTGAGATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGGTTCTGGTCCG------------------AAAGG---------GCGTGGGTTCAAAATCCCACTCTCAACACCA Mdomestica_tR96 GTTGATATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGGTTCTGGTCCG------------------AAAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACTGTCAACKCCA Mdomestica_tR47 GTTGATATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGGTTCTGGTCCG------------------AAAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCARTGTCAACACCA Mdomestica_tR94 GTTGAMATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGGTTCTGGTCCG------------------AAAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACTGTCAACACCA Mdomestica_tR196 GTTGATATGGCCGAGTTGGTCTAAGGCGCCAGATTAAGGTTCTGGTCCG------------------AAAGG---------GCGTGGGTTC-AAATCCCACTGTCAACACCA Mdomestica_tR55 GGATCTGTGGCGCAA--TGG-TAGCGCGTCTGACTC----------CAG------------ATC--AGAAGG---------TTGCGTGTTC-GATTCACGTCAGGTTCACCA Mdomestica_tR148 GGATCCGTGGCGCAA--TGG-TRGCGCGTCTGACTC----------CAG------------ATC--AGAAGG---------TTGCGTGTTC-GATTCACGTCGGGTTCACCA Mdomestica_tR166 GGATCCGTGGCGCAA--TGG-TAGCGCGTCTGACTC----------CAG------------ATC--AGAAGG---------TTGCGTGTTC-GATTCACGTCGGGTTCACCA Mdomestica_tR220 GACCGCATAGCGCAG-TGGATTAGCGCGTCTGACTT----------CGG------------ATC--AGAAGG---------TCGTGGGTTC-GACTCCCACTGTGGTCGCCA Mdomestica_tR81 GACCGCATAGCGCAG-TGGATTAGCGCGTTTGACTT----------CGG------------ATC--AAAAGG---------TCGTGGGTTC-GACTCCCACTGTGGTCGCCA Mdomestica_tR222 GACCGCATAGCGCAG-TGGAWTAGCGCGTTTGACTC----------GGA-------------TC--AAAAGG---------TCGTGGGTTC-GACTCCCACTGTGGTCGCCA Mdomestica_tR79 GATCGCATAGCGGAG--CGGATATTGCATTAGACTC----------ACG------------ATC--TAAAGG---------TCGTGGGTTC-GAATCCCACTGCGATAGCCA Mdomestica_tR212 GATCGCATAGCGGAG--TGGATATCGCATTAGACTC----------CGG------------ATC--TAAAGG---------TCGTGGGTTC-GAATCCCACTGCGATCGCCA Mdomestica_tR108 GACTCTGTGGCCCAA--TGGATAAGGCGCTGGTCTA----------CGA------------AAC--CAGAGA---------TTCAGGGTTC-GATCCCCAGCAGAGTCGCCA Mdomestica_tR180 GACTCTGTGGCCCAA--TGGATAAGGCGCTGGTCTA----------CGA------------AAC--CAGAGA---------TTCTGGGTTC-GATCCCCAGCAGAGTCGCCA Mdomestica_tR10 GACTCCATGGCCCAA--TGGATAAGGCGCTGGTCTA----------CGA------------AAC--CAGAGA---------TTCTGGGTTC-GATCCCCAGTGGAGTCGCCA Mdomestica_tR217 GACTTCATGGCCCAA--TGGATAAGGCGCTGGTCTA----------CGA------------AAC--CAGAGA---------TTCTGGGTTC-GATCCCCAGTGAAGTCGCCA Mdomestica_tR132 GATCGCGTGGCCTAA--TGGATAAGGCGCTCGCCTC----------CGG------------AGC--GGGAGA---------TTGTGGGTTC-GAGTCCCATCGCGATCGCCA Mdomestica_tR130 GGTCGCGTGGCCTAA--TGGATAAGGCGCTCGCCTC----------CGG------------AGC--GGGAGA---------TTGTGGGTTC-GAGTCCCACCGTGATCGCCA Mdomestica_tR131 GATCGCGTGGCCTAA--TGGATAAGGCGCTCGCCTC----------CGG------------AGC--GGGAGA---------TTGTGGGTTC-GAGTCCCACCGTGATCGCCA Mdomestica_tR91 GCGCCCGTGGCCTAA--TGGATAAGGCATTTGACTT----------CTA------------ATC--AAAGGA---------TTGTGGGTTC-GAATCCCACCGGGCGTGCCA Mdomestica_tR171 GCGCTCGTGGCCTAA--TGGATAAGGCATTTGACTT----------CTA------------ATC--AAAGGA---------TTGTGGGTTC-GAGTCCCACCGAGCGTGCCA Mdomestica_tR6 GCGCCCATGGCCTAA--TGGATAAGGCGTCTGACTT----------CTA------------ATC--AGGCGA---------TTGTGGGTTC-GAGTCCCACTGGGCGTGCCA Mdomestica_tR26 GCGCCCATGGCCTAA--TGGATAAGGCGCTTGACTT----------CTA------------ATC--AAGCGA---------TTGTGGGTTC-GAGTCCCACTGGGCGTGCCA Mdomestica_tR34 GCGCYCGTGGCCTAA--TGGATAAGGCGTCTGACTT----------CTA------------ATC--AGGCGA---------CTGTGGGTTC-GAGTCCCACCGGGCGTGCCA Mdomestica_tR115 GCGCCTGTGGCCTAA--TGGATAAGGCATCTGACTT----------CTA------------ATC--AGGCGA---------TTGTGGGTTC-GAGTCCCACCGGGCGTGCCA Mdomestica_tR116 GCGCCCGTGGCCTAA--TGGATAAGGCATCTGACTT----------CTA------------ATC--AGGCGA---------TTGTGGGTTC-GAGTCCCACCGGGCGTGCCA Mdomestica_tR39 GGTTCTATGGTGTAG--TGGTTAGCACTCTGGACTT----------TGA------------ATC--CAGCGA----------CCTGGGTTC-GACTCCCGGTAGGACCTCCA Mdomestica_tR139 GGTTCCATGGTGTAG--TGGTTAGCACTCTGGACTT----------TGA------------ATC--CAGCGA----------CCTGGGTTC-GACTCCCGGTGGGACCTCCA Mdomestica_tR142 GGTTTCGTAGTGTAG--TGGTTAGCACTCTGGACTT----------TGA------------ATC--CAGCGA----------CCTGGGTTC-GAATCCCGGCGAGACCTCCA Mdomestica_tR17 GGTTCCGTAGTGTAG--TGGTTAGCACTCTGGACTT----------TGA------------ATC--CAGCGA----------CCTGGGTTC-GACTCCCG-CGGGTCCTCCA Mdomestica_tR109 GGTTCCATGGTCTAG--CGGTTAGGACATTAGACTC----------TGA------------ATC--TAGTAA----------CCCGAGTTC-AAATCTCGGTGGAACCTCCA Mdomestica_tR103 GGTTCTATGGTCTAG--TGGTCAGGACATTGGACTC----------TGA------------ATC--CAGTAA----------CCCGAGTTC-AAATCTCGGTAGAACCTCCA Mdomestica_tR12 GGTCCCATGGTCTAG--TGGTCAGGACATTGGACTC----------TGA------------ATC--CAGTAA----------CCCGAGTTC-AAATCTCGGTGGGACCTCCA Mdomestica_tR186 GGTCCCATGGTCTAG--TGGTTAGGACATTGGACTC----------TGA------------ATC--CAGTAA----------CCCGAGTTC-AAATCTCGGTGGKACCTCCA Mdomestica_tR45 GGTCCCATGGTCTAG--TGGTTAGGACATTGGACTC----------TGA------------ATC--CAGTAA----------CCCGAGTTC-AAATCTCGGTGGGACCTCCA Mdomestica_tR145 GCCCGCTTAGCTCAG--AGGTTAGAGCATCGCATTT----------GTA------------ATG--CGATGG---------TCATCGGTTC-GATTCCGATAGCCGGCTCCA Mdomestica_tR149 GCTCTCGTAGCTCAG-TTGGTTAGAGCACCCGTTTA----------GTA------------AGC--GGGAGG---------TCTTGAGTTC-GACTCTCAACGAGAGCACCA Mdomestica_tR25 GCTTTCATAGCTCAG-TTGGTTAGAGCACCCGTTTA----------GTA------------AGC--GGGAGG---------TCTTGAGTTC-AACTCTCAATAAAAGCACCA Mdomestica_tR199 GCTTTCATAGCTCAG-TTGGTTAGAGCACCCGTTTA----------GTA------------AGC--GGGAGG---------TCTTGAGTTC-AACTCTCAATGAAAGCACCA Mdomestica_tR44 GCCCTTATAGCTCAG--TGG-TAGAGCGTCAGTCTT----------GTA------------AAC--TGAAGG---------TCCGTAGTTC-GATCCTGCGTGAGGGCACCA Mdomestica_tR133 GCCCCTATTGCTCAG--TGG-TAGAGCGTCAATCTT----------GTA------------AAC--TGAAGG---------TCTGTAGTTT-GATCCTGCATGGGGGCACCA Mdomestica_tR194 GCCCCTATAGCTCAG--TGG-TAGAGCGTCAGTCTT----------GTA------------AAC--TGAAGG---------TCTGTAGTTC-GATCCTGCATGGGGGCACCA Mdomestica_tR76 GCGGGGATAGCTCAG-TTGG-GAGAGCGTCAGACTG----------AAG------------ATC--TG-AGG---------TCGCGTGTTC-GATCCACGCTCACCGCTCCA Mdomestica_tR97 GCGGGGATAGCTCAG-TTGG-GAGAGCGTCAGACTG----------AAG------------ATC--TGAAGG---------TCAGGTGTTC-GATCCACCTTCACCGCACCA Mdomestica_tR64 GGGTGTATAGCTCAG-TTGG-TAGAGCATTGGGCTT----------TTA------------ACC--TAATGG---------TCGCAGGTTC-AAGTCCTGCTATACCCACCA Mdomestica_tR150 TCCTTAGTAGCTCAG--TGG-TAGAGCGGTCAGCTA----------TTA------------ACT--AATTGG---------TTGTAGGTTC-YAATCCTACCTGGGGAACCA Mdomestica_tR89 TCCTTAGTAGCTCAG--TGG-TAGAGCGGTCAACTA----------TTA------------ACT--AATTGG---------TCGTAGGTTC-GAATCCTACCTGGGGAGCCA Mdomestica_tR216 TCCTTAGTAGCTCAG--TGG-TAGAGCGGTCAGCTA----------TTA------------ACT--AATTGG---------TTGTAGGTTC-GAATCCTACCTGGGGAGCCA Mdomestica_tR175 TCCTCAGTAGCTCAG--TGG-TAGAGCGGTCGGCTG----------TTA------------ACT--GACTGG---------TCGTAGGTTC-GAATCCTACCTGGGGAGCCA Mdomestica_tR58 TCCTCAGTAGCTCAG--TGG-TAGAGCGATCAGCTR----------TTA------------ACT--GACTGG---------TCGTAGGTTC-GAATCCTACCTAGGGAGCCA Mdomestica_tR152 TCCTCAGTAGCTCAG--TGG-TAGAGCGATCAGCTG----------TTA------------ACT--GACTGG---------TCGTAGGTTC-GAATCCTACCTAGGGAGCCA Mdomestica_tR140 GCCGTCTTAGCTCAG-CTGG-TAGAGCGCGTGGCTT----------TTC------------ACC--ACGTGG---------TCATGGGTTC-GATTCTTACAGACGGCGCCA Mdomestica_tR19 GCCGTCTTAGCTCAG-CCGG-TAGAGCGCACGGCTT----------TTA------------ACC--GTGTGG---------TCGTGGGTTC-GATTCCCACAGACGGCGCCA Mdomestica_tR11 GCCGTCTTAGCTCAG-CTGG-TAGAGCGCATGGYTT----------TTA------------ACC--ATGTGG---------TCGTGGGTTC-GATTCCCACAGACGGCGCCA Mdomestica_tR137 GCCGTCTTAGCTCAG-CTGG-TAGAGCGCGTGGCTT----------TTA------------ACC--ACGTGG---------TCGTGGGTTC-GATTCCCACAGACGGCGCCA Mdomestica_tR1 GCCCGTCTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCACAACYCTC----------TTA------------ACC--TTGTGG---------TCATGGGTTT-GAGCCCCATGGTGGGCGCCA Mdomestica_tR70 GCCCGTCTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGCAAGGCTC----------TTA------------ACR--TTGTGG---------TCGTGGGTTC-GAGCCCCACGGTGGGCGCCA Mdomestica_tR135 GCCCGTCTAGCTCAG-TTGG-TAAAGCGCAAGGCTC----------TTA------------ACC--TTGTGG---------TCGTGGGTTC-GAGCCCCACGGTGGGCGCCA Mdomestica_tR182 GCCCGTCTAGCTCAG-CTGG-TAGAGCGCAAGGCTC----------TTA------------ACC--TTGTGG---------TCGTGGGTTC-GAGCCCCACGGTGGGCGCCA Mdomestica_tR155 GCCCGTCTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGCAAGGCTC----------TTA------------ACC--TTGTGG---------TCGTGGGTTC-GAGCCCCACGGTGGGCGCCA Mdomestica_tR13 GCGCCTGTAGCTCAG--TGGATAGAGCGTCTGTTTC----------CTA------------AGC--AGAAAG---------TCGAAGGTTC-GACCCCTTCCTGGCGCGCCA Mdomestica_tR22 GCGCCYGTAGCTCAG--TGGATAGAGCGTCTGTTTC----------CTA------------AGC--AGAAAG---------TCGAAGGTTC-GACCCCTTCCTGGCGCGCCA Mdomestica_tR192 GCGCCCGTAGCTCAG--TGGATAGAGCGTCTGTTTC----------CTA------------AGC--AGAAAG---------TCGAAGGTTC-GACCCCTTCCTGGCGCGCCA Mdomestica_tR184 GCGCCTGTAGCTCAG--TGGATAGAGCGTCTGTTTC----------CTA------------AGC--AGAAGG---------TCATAGGTTC-GACCCCTATCTGGCGCGCCA Mdomestica_tR201 GCGCCTGTAGCTCAG--TGGATAGAGCGTCTGTTTC----------CTA------------AGC--AGAAGG---------CCGTAGGTTC-GACCCCTACCTGGCGCGCCA Mdomestica_tR197 GCTGGAATAGCTCAG-TTGGCTAGAGCGTGTGGCTG----------TTA------------ACC--ACAAGG---------TCGGAGGTTC-GAGCCCTCCTTCTAGCGCCA Mdomestica_tR208 GCTGGAATAGCTCAG-CTGGTTAGAGCGTGTGGCTG----------TTA------------ACC--ACAAGG---------TCGGAGGTTC-GAACCCTCTTTCTAGCGCCA Mdomestica_tR52 GCTGGAATAGCTCAG-CTGGTTAGAGCGTGTGGCTG----------TTA------------ACC--ACAAGG---------TCGGAGGTTC-GAACCCTCCTTCTAGCGCCA Mdomestica_tR66 GCTGGAGTAGCTCAG-TTGGTTAGAGCGTGTGGCTG----------TTA------------ACC--ACAAGG---------TCGGAGGTTC-GAACCCTCCTTCTAGCGCCA Mdomestica_tR165 GCTGGAATAGCTCAG-TTGGTTAGAGCGTGTGGCTG----------TTA------------ACC--ACAAGG---------TCGGAGGTTC-GAACCCTCCTTCTAGCGCCA Mdomestica_tR210 GCTGGAGTAGCTCAG-CTGGTTAGAGCGTGTGGCTG----------TTA------------ACC--ACAAGG---------TCGAAGGTTC-AATCCCTTCCTCTAGCGCCA Mdomestica_tR214 GCTGGAGTAGCTCAG-TTGGTTAGAGCGTGTGGCTG----------TTA------------ACC--ACAAGG---------TCGAAGGTTC-AASCCCTTCCTCTAGCGCCA Mdomestica_tR49 GGGTCCATAGCTCAG--TGG-RAGAGCATTTGACTG----------CAG------------ATC--AAGAGG---------TCACCGGTTC-GAACCCGGTTGGGCCCTCCA Mdomestica_tR90 GGGTCCATAGCTCAG--TGG-TAGAGCATTTGACTG----------CAR------------ATC--AAGAGG---------TCACCGGTTC-GAACCCGGTTGGGCCCTCCA Mdomestica_tR204 GGGTCYATAGCTCAG--TGG-TAGAGCATTTGACTG----------CAG------------ATC--AAGAGG---------TCACCGGTTC-GAACCCGGTTGGGCCCTCCA Mdomestica_tR160 GGGTCCATAGCTCAG--TGG-TAGAGCATTTGACTG----------CAG------------ATC--AAGAGG---------TCACCGGTTC-GAACCCGGTTGGGCCCTCCA Mdomestica_tR114 CCGACCTTAGCTTAA-TTGG-CAMAGCGGAAGACTGTAGTTGGCAAA-----CCATCATAAATC--CTTWGG---------TCGCTGGTTC-GAATCCGGCAGGTCGGACCA Mdomestica_tR176 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTGGGTA-AAAG-CCTGTCAGGCATC--CTTAGG---------TCACTGGTTC-GAATCCGGTAGGTCGGACCA Mdomestica_tR177 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTGGGTA-ATATTCTCTCAGCCATCC---TTAGG---------TCGCTGGTTC-GAATCCGGCAGGTCGGACCA Mdomestica_tR56 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTGGGTGAATATGCTCTCAGCCATCC---TTAGG---------TCGCTGGTTC-GAATCCGGCAGGTCGGACCA Mdomestica_tR62 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTGGGTG-ACAT-GCTCTCAGCCATC--CTTAGG---------TCGCTGGTTC-GAATCCGGCAGGTCGGACCA Mdomestica_tR159 CCGACCTTAGCTCAG--TTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTGGTAAACC-----ATCAGATATC--CTTAGG---------TCGCTGGTTC-GAATCCGGCAGGTCGGACCA Mdomestica_tR191 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTAATATA------ACAGAAATC--CTTAGG---------TCACTGGTTC-GAATCCGGTAGGTCGGACCA Mdomestica_tR156 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTTGG---TAATATCCATCAGATATC--CTTAGG---------TCACTGGTTC-GAATCCGGTAGGTCGGWCCA Mdomestica_tR99 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTTGG---AAATATCCATCAGATATC--CTTAGG---------TCACTGGTTC-GAATCCGGTAGGTCGGACCA Mdomestica_tR170 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTTGG---TAATATCCATCAGATATC--CTTAGG---------TCACTGGTTC-GAATCCGGTAGGTCGGACCA Mdomestica_tR23 CCGACCTTAGCTCAG-TTGG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTTGCAAATAG------CAGATAATC--CTTAGG---------TCGCTGGTTC-GAATCCGGCAGGTCGGACCA Mdomestica_tR105 CCGACCTTAGCTCAG--TTGGTAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTGTAAAA-------CAGACATC--CTTAGG---------TCGCTGGTTC-GAATCCGGCAGGTCGGACCA Mdomestica_tR195 GGGGSGGTGGCGCAG-TTGGTTAGCGCGTAGGTCTC----------ATAGCTTCTGAGTTATCC---TGAGG---------TRGAGAGTTC-GAGCCTCTCTCGCCCCACCA Mdomestica_tR65 GGGGCGGTGGCGCAG-TTGGCTAGCGCGTAGGTCTC----------ATAGCTTCTGAGTGATCC---TGAGG---------TCGAGAGTTC-GAGCCTCTCTCGCCCCACCA Mdomestica_tR20 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGCTAGCGCGTAGGTCTC----------ATAGCTTCTGAGTTATCC---TGAGG---------TCGAGAGTTC-GAGCCTCTCTCACCCCACCA Mdomestica_tR151 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGCTAGCGCGTAGGTCTC----------ATAGCTTCTGAGTCATCC---TGAGG---------TCGAGAGTTC-GAGCCTCTCTCACCCCACCA Mdomestica_tR162 GGGGTGGTGGCGCAG-TTGGCTAGCGCGTAGGTCTC----------ATAGCTTCTGAGTGATCC---TGAGG---------TCGAGAGTTC-GAGCCTCTCTCACCCCACCA Mdomestica_tR21 GCCTCCGTAGCATAG--TGG-TAGTGCGTTCGCTTC----------GTA------------AGC--GAAAGG---------TCGCGAGTTC-GATCCTCGCCGGGGGCTCCA Mdomestica_tR198 GCTTCCATAGCATAG--TGG-TAGTGCGTTCGCTTC----------GTA------------AGC--GAAAGG---------TCGCGAGTTC-GATCCTCGCTGGGAGCTCCA Mdomestica_tR153 GGTCCCGTAGCTCAG-TTGGTTAGAGCGTTGGTCTT----------ATG------------AGC--CGAAGG---------TCGCGGGTTC-GAGCCCCGCCGGGACCACCA Mdomestica_tR190 GGTCCCGTAGCTCAG-TTGGTTAGAGCYTTGGTCTT----------ATG------------AGC--CGAAGG---------TCGCGGGTTC-GAGCCCCGCCGGGACCACCA Mdomestica_tR41 GGCTTATTAGCTCAG-CTGGTTAGAGCGTGGTGCTA----------ATA-----------ACGC---GAAGG---------TCGCAGGTTT-GAGACCTGCATGGGCCACCA Mdomestica_tR68 GGCCTATTAGCTCAG-CTGGTTAGAGCGTCGTGCTA----------ATA-----------ACGC---GAAGG---------TCACAGGTTC-GAGACCTGTATGGGCCACCA Mdomestica_tR181 GGCCTATTAGCTCAG-CTGGTTAGAGCGTCGTGCTA----------ATA-----------ACGC---GAAGG---------TCGCAGGTTC-GAGACCTGCATGGGCCACCA Mdomestica_tR172 GGCCTATTAGCTCAG-CTGGTTAGAGCGTCGTGCTA----------ATA-----------ACGC---GAAGG---------TCGCAGGTTC-GAGACCTGCATGGGCCWCCA Mdomestica_tR36 GGCCTATTAGCTCAG-TTGGTTAGAGCGTCGTGCTA----------ATA-----------ACGC---GAAGG---------TCGCAGGTTC-GAGACCTGCATGGGCCACCA Mdomestica_tR107 GGCCTATTAGCTCAG-TTGGTTAGAGCGTCGTGCTA----------ATA-----------ACGC---GAAGG---------TCGCAGGTTC-GAGACCTGCATGGGCCWCCA
X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y