C.papaya tRNA sequence alignment (predicted modifications are marked)

X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y




Cpapaya_tR13 GGGGATGTAGCTCAGAT-GG--TAGAGCGCTCGCTTA---------------------GCA------------TGCG-----------AG-AGG---T-----ACCGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Cpapaya_tR33 GGGGATGTAGCTCAGAT-GG--TAGAGCGCTCGCTTA---------------------GCA------------TGCG-----------AG-AGG---C-----ACGGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Cpapaya_tR19 GGGGATGTAGCTCAGAT-GG--TAGAGCGCTCGCTTA---------------------GCA------------TGCG-----------AG-AGG---T-----ACGGGGATCGATACCCCGCATCTCCACCA Cpapaya_tR38 GGGGGTGTAGCTCATAT-GG--TAGAGCGCTCGCTTC---------------------GCA------------TGCG-----------AG-AGG---C-----ACGGGGTTCGATTCCCCGCACCTCCACCA Cpapaya_tR109 GGGGGTGTAGCTCATAT-GG--TAGAGCGCTCGCTTT---------------------GCA------------TGCG-----------AG-AGG---C-----ACGGGGTTCGATTCCCCGCACCTCCACCA Cpapaya_tR18 GGGGATGTAGCTCAAAT-GG--TAGAGCGCTCGCTTT---------------------GCA------------TGCG-----------AG-AGG---C-----ACAGGGTTCGATCCCCTGCATCTCCACCA Cpapaya_tR55 GGGGATGTAGCTCAAAT-GG--TAGAGCGCTCGCTTT---------------------GCA------------TGCG-----------AG-AGG---C-----ACCGGGTTCGATCCCCCGCATCTCCACCA Cpapaya_tR120 GGGGATGTAGCTCAAAT-GG--TAGAGCGCTCGCTTT---------------------GCA------------TGCG-----------AG-AGG---C-----ACGGGGTTCGATCCCCCGCATCTCCACCA Cpapaya_tR2 GGGTGTTTGGTCTAGT--GG--TATGATTCTCGCTTC---------------------GGG------------TGCG-----------AG-AGG---T-----CGCGAGTTCGATTCTCGCAACACCCCCCA Cpapaya_tR25 GGGCGTTTGGTCCAGT--GG--TATGATTCTCGCTTC---------------------GGG------------TGCG-----------AG-AGG---T-----CCCGAGTTCGATTCTCGGAACGCCCCCCA Cpapaya_tR11 GGGCGTTTGGTCTAGT--GG--TATGATTCTCGCTTT---------------------GGG------------TGCG-----------AG-AGG---T-----CCCGAGTTCGATTCTCGGAACGCCCCCCA Cpapaya_tR86 GGGCATTTGGTCTAGT--GG--TATGATTCTCGCTTA---------------------GGG------------TGCG-----------AG-AGG---T-----CCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Cpapaya_tR58 GGGCATTTGGTCTAGT--GG--TATGATTCTCGCTTT---------------------GGG------------TGCT-----------AG-AGG---T-----CCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCCCCCA Cpapaya_tR83 GGGCATTTGGTCTAGT--GG--CATGATTCTCGCTTT---------------------GGG------------TGCG-----------AG-AGG---T-----CCCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Cpapaya_tR126 GGGCATTTGGTCTAGT--GG--TATGATTCTCGCTTT---------------------GGG------------TGCG-----------AG-AGG---T-----CCCGAGTTCGATTCTCGGAATGCCCCCCA Cpapaya_tR40 GTGGCTGTAGTTTAGT--GGT-TAGAATTCTACGTTG---------------------TGG------------CCGT-----------AG-AGA---------CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Cpapaya_tR50 GTGGCTGTAGTTTAGT--GG--TAAGAATTCCACGTT---------------------GTG------------GCCG-----------TGGAGA---------CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Cpapaya_tR85 GTGGCTGTAGTTTAGT--GGT-GAGAATTCCACGTTG---------------------TGG------------CCGT-----------GG-AGA---------CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Cpapaya_tR146 GTGGCTGTAGTTTAGT--GGT-TAGAATTCCACGTTG---------------------TGG------------CCGT-----------GG-AGA---------CCTGGGCTCGAATCCCAGCAGCCACACCA Cpapaya_tR12 GTCCCTTTCGTCCAGT--GGT-TAGGACATCGTCTTT---------------------TCA------------TGTC-----------GA-AGA---------CACGGGTTCGATTCCCGTAAGAGATACCA Cpapaya_tR32 GCGCATTTGGTGTAGT--GG--TATCATAGTACCCTC---------------------CCA------------------------------CGG---TACTGACCGGGGTTCGATTCCCCGGATGCGCACCA Cpapaya_tR100 GCGCATCTGGTGTAGT--GG--TATCATAGTACCCTC---------------------CCA------------------------------CGG---TACTGACCGGGGTTCGATTCCCCGGATGCGCACCA Cpapaya_tR138 GCACCAGTGGTCTAGT--GG--TAGAATAGTACCCTG---------------------CCA------------------------------CGG---TACAGACCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGNNCCA Cpapaya_tR14 GCACCAGTGGTCTAGT--GG--TAGAATAGTACCCTG---------------------CCA------------------------------CGG---TACAGACCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCACCA Cpapaya_tR61 GCACTAGTGGTCTAGT--GG--TAGAATAGTACCCTG---------------------CCA------------------------------CGG---TACAGACCCGGGTTCGATTCCCGGCTGGTGCACCA Cpapaya_tR82 GCGTTTGTAGTCCAAC--GGT-TAGGATAATTGCCTT---------------------CCA------------AGCA-----------AT-AGA---------CCCGGGTTCGACTCCCGGCAAACGCACCA Cpapaya_tR113 GCGTTTGTAGTCCAAC--GGT-TAGGATAATTGCCTT---------------------CCA------------AGCA-----------AT-AGA---------CCCGGGTTCGACTCCCGGCAGACGCACCA Cpapaya_tR152 GTCGTTGTAGTATAGT--GGT-AAGTATTTCCGCCTG---------------------TCA------------CGCG-----------GA-CGA---------CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Cpapaya_tR149 GTCGTTGTAGTATAGT--GGT-GAGTATTCCCGCCTG---------------------TCA------------CGCG-----------GG-CGA---------CCCGGGTTCGATCCCCGGCAGCGGCGCCA Cpapaya_tR37 GTCGTTGTAGTATAGT--GGT-GAGTATTCCCGCCTG---------------------TCA------------CGCG-----------GG-CGA---------CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Cpapaya_tR134 GTCGTTGTAGTATAGT--GGT-AAGTATTCCCGCCTG---------------------TCA------------CGCG-----------GG-TGA---------CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Cpapaya_tR157 GTCGTTGTAGTATAGT--GGT-GAGTATTCCCGCCTG---------------------TCA------------CCCG-----------GG-TGA---------CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Cpapaya_tR72 GTCGTTGTAGTATAGT--GGT-GAGTATTCCCGCCTG---------------------TCA------------CGCG-----------GG-TGA---------CCCGGGTTCGATCCCCGGCAACGGCGCCA Cpapaya_tR88 TCCGTTGTCGTCCAGC--GGT-TAGGATATCTGGCTT---------------------TCA------------CCCA-----------GG-AGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGGCAACGGAACCA Cpapaya_tR99 TCCGTTGTCGTCCAGC--GGT-TAGGATGTCTGGCTT---------------------TCA------------CCCA-----------GG-AGA---------CCCGGGTTCGATTCCCGGCAACGGAACCA Cpapaya_tR46 TCCGTTGTAGTCTAGTT-GGT-TAGGATACTCGGCTC---------------------TCA------------CCCG-----------AG-AGA---------CCCGGGTTCAAGTCCCGGCAACGGAACCA Cpapaya_tR70 TCCGTTGTAGTCTAGTT-GGT-CAGGATATTCGGCTC---------------------TCA------------CCCG-----------AA-AGA---------CCCGGGTTCAAGTCCCGGCAACGGNNCCA Cpapaya_tR91 TCCGTTGTAGTCTAGTT-GGT-CAGGATATTCGGCTC---------------------TCA------------CCCG-----------AA-AGA---------CCCGGGTTCAAGTCCCGGCAACGGAACCA Cpapaya_tR97 GGTTCCATGGTGTAGT--GGT-TAGCACTCTGGACTT---------------------TGA------------ATCC-----------AG-CGA---------CCTGGGTTCGACTCCCGGTGGGACCTCCA Cpapaya_tR31 GGTTCTATGGTGTAGT--GGT-TAGCACTCTGGACTT---------------------TGA------------ATCC-----------AG-CGA---------CCTGGGTTCGACTCCCGGTAGGACCTCCA Cpapaya_tR128 GGTTCTATGGTGTAGT--GGT-TAGCACTTTGGACTT---------------------TGA------------ATCC-----------AG--CG---A-----CCTGGGTTCGACTCCCGGTAGGACCTCCA Cpapaya_tR43 GGTTCCATGGTCTAGT--GGT-AAGGACATTGGACTC---------------------TGA------------ATCC-----------AA-TAG---------CCCGAGTTCAAATCTCGGTGGAACCTCCA Cpapaya_tR111 GGTTCCATGGTCTAGT--GGT-CAGGACATTGGACTC---------------------TGA------------ATCC-----------AG-TAA---------CCCGAGTTCAAATCTCGGTGGAACCTCCA Cpapaya_tR8 GGTCCCATGGTCTAGT--GGT-CAGGACATTGGACTC---------------------TGA------------ATCC-----------AG-TAA---------CCCGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCTCCA Cpapaya_tR34 GGTCCCATGGTCTAGT--GGT-TAGGACATTGGACTC---------------------TGA------------ATCC-----------AGTAA----------CCCGAGTTCAAATCTCGGTGGGACCTCCA Cpapaya_tR5 GCATCCATGGCTGAAT--GGT-TAAAGCACCCAACTC---------------------ATA------------ATTG-----------GCGAAT---T-----CGTAGGTTCAATTCCTACTGGATGCACCA Cpapaya_tR158 ATCAGAGTGGCGCAGC--GGA--AGCGTGGTGGGCCC---------------------ATA------------ACCC-----------AC-AGG---T-----CCCAGGATCGAAACCTGGCTCTGATACCA Cpapaya_tR96 CGCGGGGTAGAGCAGTT-TGG-TAGCTCGCAAGGCTC---------------------ATA------------ACCT-----------TG-AGG---T-----CACGGGTTCAAATCCCGTCTCCGCAACCA Cpapaya_tR22 GGTGTCGTGGTGTAGTT-GGT-TATCACGTCAGTCTA---------------------ACA------------CACT-----------GA-AGG---T-----CTCATGTTCGAGTCCGGGCGACGCCACCA Cpapaya_tR93 GGTGTCGTGGTGTAGTT-GGT-TATCACGTCAGTCTA---------------------ACA------------CACT-----------GA-AGG---T-----CTCCGGTTCGAGTCCGGGCGACGCCACCA Cpapaya_tR98 GGTGTCGTGGTGTAGTT-GGT-TATCACGTCAGTCTA---------------------ACA------------CACT-----------GA-AGG---T-----CTCCGGTTCGAATCCGGGCGACGCCACCA Cpapaya_tR140 GTTTGGGTGGTGTAGTT-GGT-TATCACGCTAGTCTC---------------------ACA------------CACT-----------AG-AGG---T-----CCCCGGTTCGAACCCGGGCTCAGACACCA Cpapaya_tR36 GTCTGGGTGGTGTAGTT-GGT-TATCACGCTAGTCTC---------------------ACA------------CACT-----------AG-TGG---T-----CCCCGGTTCGAACCCGGGCTCAGACACCA Cpapaya_tR142 GTCTGGGTGGTGTAGTT-GGT-TATCACGCTAGTCTC---------------------ACA------------CACT-----------AG-AGG---T-----CCCCGGTTCGAACCCGGGCTCAGACACCA Cpapaya_tR23 GTTGCTGTGGTGTAGT--GGT-TATCACGTTAGTCTT---------------------ACA------------CACT-----------AA-AGG---T-----CCCCAGTTCGATCCTGGGCAGCAACACCA Cpapaya_tR47 GATGCTGTGGTGTAGT--GGT-TATCACGTTAGTCTT---------------------ACA------------CACT-----------AA-AGG---T-----CCCCAGTTCGATCCTGGGCAGCATCACCA Cpapaya_tR41 GTCGCTTTGGCCGAGT--GGT-TAAGGCGTGTGCCTG---------------------CTA------------AGTA-----------CATGGGGTTTCCCCGCGGGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACGCCA Cpapaya_tR102 GTCGCTTTGGCCGAGT--GGT-TAAGGCGTGTGCCTG---------------------CTA------------AGTA-----------CGTGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACGCCA Cpapaya_tR44 GTCGCTTTGGCCGAGT--GGT-TAAGGCGTGTGCCTG---------------------CTA------------AGTA-----------CATGGGGTTTCCCCGCGAGAGTTCGAATCTCTCAGGCGACGCCA Cpapaya_tR105 GTGGACGTGCCGGAGT--GGT-TATCGGGCATGACTA---------------------GAA------------ATCA-----------TGTGGGCTCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGTTCACGCCA Cpapaya_tR29 GTGGGCGTGCCGGAGT--GGT-TATCGGGCATGACTA---------------------GAA------------ATCA-----------TGTGGGCTCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCTCACGCCA Cpapaya_tR145 GTGGGCGTGCCGGAGT--GGT-TATCGGGCATGACTA---------------------GAA------------ATCA-----------TGTGGGCTCTGCCCGCGCAGGTTCGAATCCTGCCGCCCACGCCA Cpapaya_tR26 GTCGATATGTCCGAGT--GGT-TAAGGAGACAGACTT---------------------GAA------------ATCT-----------GTTGGGCTTCGCCCGCGCAGGTTCGAACCCTGCTGTCGACGCCA Cpapaya_tR57 GTCGATATGTCCGAGT--GGT-TAAGGAGACAGACTT---------------------GAA------------ATCT-----------GTTGGGCTACGCCCGCGCAGGTTCGAACCCTGCTGTCGACGCCA Cpapaya_tR39 GTCGATATGTCCGAGT--GGT-TAAGGAGACAGACTC---------------------GAA------------ATCT-----------GTTGGGCTTTGCCTGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTCGACGCCA Cpapaya_tR67 GTCGATATGTCCGAGT--GGT-TAAAGAGACAGACTC---------------------GAA------------ATCT-----------GTTGGGCTATGCCTGCGCAGGTTCGAATCCTGCTGTCGACGCCA Cpapaya_tR76 GGGCCTGTAGCTCAGAG-GAT-TAGAGCACGTGGCTA---------------------CGA------------ACCA-----------CG-GTG---T-----CGGGGGTTCGAATCCCTCCTCGCCCACCA Cpapaya_tR125 GTTCAGGTAGCTCAGCT-GGT-TAGAGCAAAGGACTG---------------------AAA------------ATCC-----------TT-GTG---T-----CAGTGGTTCGAATCCACTTCTAAGCGCCA Cpapaya_tR7 GTCGGGATAGCTCAGTT-GG--TAGAGCAGAGGACTG---------------------AAA------------ATCC-----------TC-GTG---T-----CACCAGTTCAAATCTGGTTCCTGACACCA Cpapaya_tR133 TCCTCAGTAGCTCAGC---AG-TAGAGCGGTCGGCTG---------------------TTA------------ACTG-----------AC-TGC---T-----CGTAGGTTCGAATCCTACTTGGGGAGCCA Cpapaya_tR114 GCCCGTCTAGCTCAGT--AGG-TAGAGCGCAAGGCTC---------------------TTA------------ACCT-----------TG-TGG---T-----CGTGGGTTCGAACCCCACGGTGGGCGCCA Cpapaya_tR137 GCCCGTCTAGCTCAGTT--GG-TAGAGCGCAAGGCTC---------------------TTA------------ACCT-----------TG-TGA---T-----CGTGGGTTCGAGCCCCACGGTGGGCGCCA Cpapaya_tR112 GCCCGTCTAGCTCAGCC--GG-TAGAGCGCAAGGCTC---------------------TTA------------ACCT-----------TG-TGG---T-----CGTGGGTTCGAGCCCCACGGTGGGCGCCA Cpapaya_tR127 GCCCGTCTAGCTCAGTC--GG-TAGAGCGCAAGGCTC---------------------TTA------------ACCT-----------TG-TGG---T-----CGTGGGTTCGAGCCCCACGGTGGGCGCCA Cpapaya_tR53 ACCATCTTAGTTCAATT--GG-TAAAACGCATTACTT---------------------TTA------------ATCA-----------TG-TGG---T-----CGTGGGTTCGATTCACACAGATGTTACCA Cpapaya_tR1 GCCATCTTAGCTCAGTT--GG-TAGAGCGCATGGCTT---------------------TTA------------ACCA-----------TG-TGG---T-----CGTGGGTTTGATTCCCACAGATGACGCCA Cpapaya_tR116 GCCATCTTAGCTCAATT--GG-TAGAGCGCATGGCTT---------------------TTA------------ACCA-----------TG-TGG---T-----CGTGGGTTCGATTCCCATAGATGGCGCCA Cpapaya_tR79 GCCGTCTTAGCTCAGCT--GG-TAGAGCGCATGGCTT---------------------TTA------------ACCA-----------TG-TGG---T-----CGTGGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Cpapaya_tR103 GCCGTCTTAGCTCAGCC--GG-TAGAGCGCATGGCTT---------------------TTA------------ACCA-----------TG-TGG---T-----CGTGGGTTCGATTCCCACAGACGGCGCCA Cpapaya_tR124 GGATCCGTGGCGCAAT--GG--TAGCGCGTCTGACTC---------------------CAG------------ATCA-----------GA-AGG---T-----TGCGTGTTCGATTCACGTCGGGTTCACCA Cpapaya_tR24 GCGGGGATAGCTCAGTT--GG-GAGAGCGTCAGACTG---------------------AAG------------ATCT-----------GA-AGG---T-----CACGTGTTCGATCCACGTTCACCGCACCA Cpapaya_tR75 GCGGGGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCAGACTG---------------------AAG------------ATCT-----------GA-AGG---T-----CGCGTGTTCGATCTACGCTCACCGCACCA Cpapaya_tR121 GCGGGGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCAGACTG---------------------AAG------------ATCT-----------GA-AGG---C-----CGCGTGTTCGATCCACGCTCACCGCACCA Cpapaya_tR136 GCGGGGATAGCTCAGTT-GGG--AGAGCGTCAGACTG---------------------AAG------------ATCT-----------GA-AGG---T-----CGCATGTTCGATCCACGCTCACCGCACCA Cpapaya_tR35 GCGGGGATAGCTCAGTTGGG---AGAGCGTCAGACTG---------------------AAG------------ATCT-----------GA-AGG---T-----CGCGTGTTCGATCCACGCTCACCGCACCA Cpapaya_tR101 GGGTCCATAGCTCAGT--GG--TAGAGCATTTAACTG---------------------CAG------------ATCA-----------AG-AGG---T-----CATTAGTTCGATCCTTGTTGGGCCCTCCA Cpapaya_tR71 GGGTCCATAGCTCAGT--GG--TAGAGCATTTGACTG---------------------CAG------------ATCA-----------AG-AGG---T-----CACTAGTTCGATCCTAGTTGGGCCCTCCA Cpapaya_tR119 GGGTCCATAGCTCAGT--GG--TAGAGCATTTGACTG---------------------CAG------------ATCA-----------AG-AGG---T-----CACCGGTTCGAACCCGGTTGGGCCCTCCA Cpapaya_tR161 GGGTCTATAGCTCAGT--GG--TAGAGCATTTGACTG---------------------CAG------------ATCA-----------AG-AGG---T-----CACCTGTTCGATCCTGGTTGGGCCCTCCA Cpapaya_tR17 GGGTCCATAGCTCAGT--GG--TAGAGCATTTGACTG---------------------CAG------------ATCA-----------AG-AGG---T-----CACCAGTTCGATCTTGGTTGGGTCCTCCA Cpapaya_tR62 GGGTCCATAGCTCAGT--GG--TAGAGCATTTGACTG---------------------CAG------------ATCA-----------AG-AGG---T-----CACCAGTTCGATCCTGGTTGGGTCCTCCA Cpapaya_tR77 GGGTCCATAGTTCAGT--GG--TAGAGCATTTGACTG---------------------CAG------------ATCA-----------AG-AGG---T-----CACCAGTTCGATCCTGGTTGGGCCCTCCA Cpapaya_tR151 GGGTCCATAGCTCAGT--GG--TAGAGCATTTGACTG---------------------CAG------------ATCA-----------AG-AGG---T-----CACCAGTTCGAACCTGGTTGGGCCCTCCA Cpapaya_tR117 GGGTCCATAGCTCAGT--GG--TAGAGCATTTGACTG---------------------CAG------------ATCA-----------AG-AGG---T-----CACCAGTTCGATCCTGGTTGGGCCCTCCA Cpapaya_tR123 CCGACCTTAGCTCAGAT--GG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTAGGATTCCCCTAA-CAGCTA------------ATCC-----------TT-AGG---T-----CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Cpapaya_tR27 CCGACCTTAGCTCAGTT-GG--TAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTAACATGCT------GGA------------ATCC-----------TT-AGG---T-----CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Cpapaya_tR66 CCGACCTTAGCTCAGTT--GG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTCGGAAG--------CAGACA------------ATCC-----------TT-AGG---T-----CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Cpapaya_tR159 CCGACCTTAGCTCAGTT--GG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTAAGA-------CAGATA------------ATCC-----------TT-AGG---T-----CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Cpapaya_tR4 CCGACCTTAGCTCAGTT--GG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTGGGGTAATGTCTATCAGCTA------------ATCC-----------TT-AGG---T-----CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Cpapaya_tR51 CCGACCTTAGCTCAGTT--GG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTGGTG----------CAGATA------------ATCC-----------TT-AGG---T-----CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Cpapaya_tR131 CCGACCTTAGCTCAGTT--GG-TAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTCTATAA-----CAGTTA------------ATCC-----------TT-AGG---T-----CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Cpapaya_tR139 CCGACCTTAGCTCAGTT-GG--TAGAGCGGAGGACTGTAGTTGTTGCCAACAGT----TTA------------ATCC-----------TT-AGG---T-----CGCTGGTTCGAATCCGGCAGGTCGGACCA Cpapaya_tR45 GGGTGTATAGCTCAGTT-GG--TAGAGCATTGGGCTT---------------------TTA------------ACCT-----------AA-TGG---T-----CGCAGGTTCAAGTCCTGCTATACCCACCA Cpapaya_tR30 GCTGGGGTAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGTGTGGCTG---------------------TTA------------ACCA-----------CA-AGG---T-----CGAAGGTTCAAGCCCTTCCTCTAGCGCCA Cpapaya_tR52 GCTGGAGTAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGTGTGGCTG---------------------TTA------------ACCA-----------CA-AGG---T-----CGAAGGTTCAAGCCCTTCTTCTAGCGCCA Cpapaya_tR143 GCTGGAGTAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGTGTGGCTG---------------------TTA------------ACCA-----------CA-AGG---T-----CGAAGGTTCAAGCCCTTCCTCTAGCGCCA Cpapaya_tR130 GCTGGAATAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGTGTGGCTA---------------------TTC------------ACCA-----------CA-AGG---T-----CAGAGGTTCAAGCCCTCCTTCTAGCGCCA Cpapaya_tR15 GCTGGAATAGCTCAGTT-GGC-TAGAGCGTGTGGCTG---------------------TTA------------ACCA-----------CA-AGG---T-----CGGAGGTTCAAGCCCTCCTTCTAGCGCCA Cpapaya_tR155 GCTGGAATAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGTGTGGCTG---------------------TTA------------ACCA-----------CA-AGG---T-----CGGAGGTTCAAGCCCTCCTTCTAGCGCCA Cpapaya_tR69 GCGCCTGTAGCTCAGT--GGA-TAGAGCGTCTGTTTC---------------------CTA------------AGCA-----------GA-AAG---T-----CGTAGGTTCGACCCCTACCTGGCGCGCCA Cpapaya_tR160 GCGCCTATAGCTCAGT--GGA-TAGAGCGTCTGTTTC---------------------CTA------------AGCA-----------GA-AGG---T-----CGAAGGTTCGACCCCTTCCTGGCGCGCCA Cpapaya_tR108 GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGC-TAGCGCGTAGGTCTC---------------------ATA--GCTTCGAGAAATCC-----------TG-AGG---T-----CGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Cpapaya_tR147 GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGC-TAGCGCGTAGGTCTC---------------------ATA--GCTCCGAGTTATCC-----------TG-AGG---T-----CGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Cpapaya_tR74 GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGC-TAGCGCGTAGGTCTC---------------------ATA-GCTATAGAGAAATCC-----------TG-AGG---T-----CGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Cpapaya_tR20 GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGC-TAGCGCGTAGGTCTC---------------------ATAGCTTTCTGAGTAATCC-----------TG-AGG---T-----CGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Cpapaya_tR10 GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGC-TAGCGCGTAGGTCTC---------------------ATA--GCTAAGAGTGATCC-----------TG-AGG---T-----CGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Cpapaya_tR95 GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGC-TAGCGCGTAGGTCTC---------------------ATA-GCTAGAGAGTGATCC-----------TG-AGG---T-----CGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Cpapaya_tR68 GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGC-TAGCGCGTAGGTCTC---------------------ATAGCTATCTGAGTTATCC-----------TG-AGG---T-----CGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Cpapaya_tR122 GGGGTGGTGGCGCAGTT-GGC-TAGCGCGTAGGTCTC---------------------ATA-GCTATAGAGTTATCC-----------TG-AGG---T-----CGAGAGTTCGAGCCTCTCTCACCCCACCA Cpapaya_tR132 GCCCTTATAGCTCAGT---GG-TAGAGCGTCAGTCTT---------------------GTA------------AACT-----------GA-AGG---T-----CCGCAGTTCGATCCTGCGTGAGGGCACCA Cpapaya_tR92 GCCCCTATAGCTCAGT---GG-TAGAGCGTCAGTCTT---------------------GTA------------AACT-----------GA-AGG---T-----CCGTAGTTCGATCCTGCGTGGGGGCACCA Cpapaya_tR144 GCCCCTATAGCTCAGT---GG-TAGAGCGTCAGTCTT---------------------GTA------------AACT-----------GA-AGG---T-----CTGTAGTTCGATCCTGCATGGGGGCACCA Cpapaya_tR80 GCTTTCGTAGCTCAGTTGGGT-TAGAGCACCCGTTTA---------------------GTA------------AGCG-----------GGAAGG---T-----CTTGAGTTCGACTCTCAACGAAAGCACCA Cpapaya_tR107 GCTCTCGTAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCACCCGTTTA---------------------GTA------------AGCG-----------GG-AGG---T-----CTTGAGTTCGACTCTCAACGAGAGCACCA Cpapaya_tR150 GCTCTCGTAGCTCAGTTGGGT-TAGAGCACCCGTTTA---------------------GTA------------AGCG-----------GG-AGG---T-----CTTGAGTTCGACTCTCAACGAGAGCACCA Cpapaya_tR60 GCTCTCATAGCTCAGTC-GGT-TAGAGCACCCGTTTA---------------------GTA------------AGCG-----------GG-AGG---T-----CTTGAGTTCGACTCTCAATGAAAGCACCA Cpapaya_tR90 GCTTTCATAGCTCAGTT-GGT-TACAGCACCCGTTTA---------------------GTA------------AGCG-----------GG-AGG---T-----CTTGAGTTCGACTCTCAATGAAAGCACCA Cpapaya_tR154 GCTTTCATAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCACCCGTTTA---------------------GTA------------AGCG-----------GG-AGG---T-----CTTGAGTTCGACTCTCAATGAAAGCACCA Cpapaya_tR28 GGCCTATTAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGTCGTGCTA---------------------ATA------------ACGC-----------GA-AGG---T-----CGCAGGTTCGAGACCTGCATGGGCCACCA Cpapaya_tR129 GGCCTAGTGACTCAGTT-GGT-TAGAGCGTCGTGCTA---------------------ATA------------ACGC-----------GA-AGG---T-----CGCAGGTTCGAGACCTGCATGGGCCACCA Cpapaya_tR148 GCTCCCGTAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGTTGGTCTT---------------------ATG------------AGCC-----------GA-AGG---T-----CGCGAGTTCGAGCCTCGCCGGGAGCACCA Cpapaya_tR84 GGTCCCGTAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGCTGGTCTT---------------------ATG------------AGCC-----------GG-AGG---T-----CGCGAGTTCGAGCCTCGCCGGGACCACCA Cpapaya_tR110 GGTCCCGTAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGTTGGTCTT---------------------ATG------------AGCC-----------GA-AGG---T-----CGCGGGTTCGAGCCCCGCCGGGACCACCA Cpapaya_tR81 GGTCCCGTAGCTCAGTT-GGT-TAGAGCGTTGGTCTT---------------------ATG------------AGCC-----------GA-AGG---T-----CGCGAGTTCGAGCCTCGCCGGGACCACCA Cpapaya_tR56 GCTTCCATAGCATAGT---GG-TATTGCGTTCGCTTC---------------------GTA------------AGCG-----------AA-AGG---T-----CGCGAGTTCGATCCTCGCTGGGAGCTCCA Cpapaya_tR16 GCCTCCGTAGCATAGT---GG-TAGTGCGTTCGCTTC---------------------GTA------------AGCG-----------AA-AGG---T-----CGCGAGTTCGATCCTCGCCGGGGGCTCCA Cpapaya_tR115 GCTTCCGTAGCATAGT---GG-TAGTGCGTTCGCTTC---------------------GTA------------AGCG-----------AA-AGG---T-----CGCGAGTTCGATCCTCGCCGGGAGCTCCA Cpapaya_tR49 GCAGGTTTGCCCGAGA--GGT-TAAGGGGGAAGACTT---------------------AAG------------ATCT-TCTGCACATAAG-TGC---G-----CGTGGGTTCGAACCCCACAGCCTGCACCA Cpapaya_tR89 GCTGGTTTGCCCGAGA--GGT-TAAGGGGGAAGACTT---------------------AAG------------ATCT-TCTGCACATAAG-TGC---G-----CATGGGTTCGAACCCCATAGCCAGCACCA Cpapaya_tR156 GTCAAGATGGCCGAGTT-GGTCTAAGGCGCCAGTTTC---------------------AGG------------TACT-GGTCC----GAA-AGG---G-----CATGGGTTCGAATCCCATTCTTGACACCA Cpapaya_tR118 GTTGAGATGGCCGAGTTGGGTCTAAGGCGCCAGATTA---------------------AGG------------TTCTGGGTCC----GAA-AGG---G-----CGTGGGTTCAAATCCCACTCTCAACACCA Cpapaya_tR65 GTTGAGATGGCCGAGTT-GGTCTAAGGCGCCAGATTA---------------------AGG------------TTCT-GGTCC----GAA-AGG---G-----CGTGGGTTCAAATCCCACTCTCAACACCA Cpapaya_tR21 GCTGAGATGGCCGAGTT-GGTCTAAGGCGCCAGATTA---------------------AGG------------TTCT-GGTCC----GAA-AGG---G-----CGTGGGTTCAAATCCCACTCTCAACACCA Cpapaya_tR153 GTGGAGATGGCCGAGTT-GGTTTAAGGCGCCAGATTA---------------------AGG------------TTCT-GGTCC----GCA-AGG---G-----CGTGGGTTCAAATCCCACTCTCCACACCA Cpapaya_tR135 GTGGAGATGGCCGAGTT-GGTCTAAGGCGCCAGATTA---------------------AGG------------TTCT-GGTCC----GAA-AGG---G-----CGTGGGTTCAAATCCCACTCTCCACACCA Cpapaya_tR141 GACAGTTTGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCCAGATTT---------------------AGG------------CTCT-GGTCC----GAA-AGG---G-----CGTGGGTTCAAATCCCACAGCTGTCACCA Cpapaya_tR6 GTCAGGATGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCCAGACTC---------------------AAG------------TTCT-GGTCCTCGTGAG-AGG---G-----CGTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Cpapaya_tR106 GTCAGGATGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCCAGACTC---------------------AAG------------TTCT-GGTCCTCGTGAG-AGG---G-----CCTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Cpapaya_tR9 GTCAGGATGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCCAGACTC---------------------AAG------------TTCT-GGTTCTCGTTAG-AGA---G-----CGTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Cpapaya_tR64 GTCAGGATGGCCGAGT--GGTCTAAGGCGCCAGACTC---------------------AAG------------TTCT-GGTTCTCGTGAG-AGA---G-----CGTGGGTTCAAATCCCACTTCTGACACCA Cpapaya_tR54 GACCGCATAGCGCAGT--GGATTAGCGCGTTTGACTT---------------------CGG------------ATCA-----------AA-AGG---T-----CGTGGGTTCGACTCCCACTGTGGTCGCCA Cpapaya_tR78 GATCGCATAGCGGAGT--GGA-TATCGCGTTAGACTC---------------------CGG------------ATCT-----------AA-AGG---T-----CGTGGGTTCGAATCCCACTGCGATCGCCA Cpapaya_tR42 GACTTCATGGCCCAAT--GGA-TAAGGCGCTGGTCTA---------------------CGG------------AACC-----------AG-AGA---T-----TCTGGGTTCGATCCCCAGTGGAGTCGCCA Cpapaya_tR73 GACTCCATGGCCCAAT--GGA-TAAGGCGCTGGTCTA---------------------CGG------------AACC-----------AG-AGA---T-----TCTGGGTTCGATCCCCAGTGGAGTCGCCA Cpapaya_tR3 GCGCCCATGGCCTAAT--GGA-TAAGGCGTCTGACTT---------------------CTA------------ATCA-----------GG-CGA---T-----TGTGGGTTCGAGTCCCACTGGGCGTGCCA Cpapaya_tR48 GCACCCATGGCCTAAT--GGA-TAAGGCGTCTGACTT---------------------CTA------------ATCA-----------GG-CGA---T-----TGTGGGTTCGAGTCCCACTGGGTGTGCCA Cpapaya_tR87 GCGCTCGTGGCCTAAT--GGA-TAAGGCGCCTGACTT---------------------CTA------------ATCA-----------GG-CGA---T-----TGTGGGTTCGAGTCCCACCGGGCGTGCCA Cpapaya_tR59 GCGCCCGTGGCCTAAT--GGA-TAAGGCGTTTGACTT---------------------CTA------------ATCA-----------AG-CGA---T-----TGTGGGTTCGAGTCCCACCGGGCGTGCCA Cpapaya_tR104 GCGCCCGTGGCCTAAT--GGA-TAAGGCGTCTGACTT---------------------CTA------------ATCA-----------GG-CGA---T-----TGTGGGTTCGAGTCCCACCGGGCGTGCCA Cpapaya_tR63 GTTCGCGTGGCCTAAT--GGA-TAAGGCGCTCGCCTC---------------------CGG------------AGCG-----------GG-AGA---T-----TGTGGGTTCGAGTCCCACCGTGAACGCCA Cpapaya_tR94 GATCGCGTGGCCTAAT--GGA-TAAGGCGCTCGCCTC---------------------CGG------------AGCG-----------GG-AGA---T-----TGTGGGTTCGAGTCCCATCGCGATCGCCA
X: m1G
X: m1A/m1I/ms2i6A
X: i6A/t6A
X: m3C
X: m2G/m22G
X: D
X: Y